FuNGI

C5GDA2

Protein Details

Accession

C5GDA2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
301-326	TMETPPRLKSRRRKKSENNTPHKSTM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
307-316	RLKSRRRKKS
445-453	IAGKKKSEK
656-689	RANRKRAELRKQLEARNKGVGTGGGGPAKKKRRF

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015381 XLF_N IPR038051 XRCC4-like_N_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006302 P:double-strand break repair
Pfam	View protein in Pfam PF09302 XLF
CDD	cd22285 HD_XLF_N

Amino Acid Sequences

MSKWSKLQLPCGNPTPPLLYKYLTSNLGCEIFVTDLAYVWSESLTRKEIHNNASKYNTSIDPSEDDEQYFVLLQKISDALRGSKDSSLSLASETGGNELKLSTSTKLPAPLDPLRWTFTLSQQSPNALTKHILLPILKGEVNHDTRIMSLIGQVKQKDWALSKLFDKIESSGVDLSTVFPGMGGVRLSRKDSVYSQASKLIKGVAPFDEELWNNEYQAKDADYNLGVHIASELSLSFSSIDRQSDGIAPENWWNKLAAGLADKPRQAARKDKYQEERASKIRLPPVEKEEVTESDDDEFQTMETPPRLKSRRRKKSENNTPHKSTMPTGKRRIDSDGDSTEGSPSLSLGSKSRKHTGDVADHSKQKKSRASNSSEATASEEDGQDDTQPGPNRRPKGLGTICGRQLVRRKNSPMESAESTESEAQPEAAAKPKSTTKAKGSLGTIAGKKKSEKPRQETPIESTASDLSDAPGTASSPKLTKEAADTNDMPTESENDTDSSVSRPAEQELPKASQRKSSPPLKAQPKSGGMGVIGQIGGRKKKDEQTSPTDHPETPKLGTLNHDNDEDGDEMETSPATHQTAKLRHSSGKLGMIGGRGKPAASTSQKESSPDRRMPQLSPPPRYGTATRTSEQPLAPELGEKVEIKQEAKEETPEERANRKRAELRKQLEARNKGVGTGGGGPAKKKRRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.48
3	0.43
4	0.39
5	0.35
6	0.31
7	0.3
8	0.34
9	0.36
10	0.35
11	0.32
12	0.29
13	0.3
14	0.3
15	0.28
16	0.23
17	0.19
18	0.15
19	0.15
20	0.14
21	0.1
22	0.09
23	0.1
24	0.11
25	0.09
26	0.08
27	0.08
28	0.09
29	0.11
30	0.14
31	0.17
32	0.18
33	0.21
34	0.3
35	0.36
36	0.43
37	0.51
38	0.51
39	0.53
40	0.57
41	0.55
42	0.48
43	0.46
44	0.4
45	0.33
46	0.31
47	0.28
48	0.25
49	0.29
50	0.31
51	0.28
52	0.26
53	0.23
54	0.21
55	0.19
56	0.17
57	0.13
58	0.12
59	0.11
60	0.11
61	0.12
62	0.14
63	0.13
64	0.16
65	0.17
66	0.17
67	0.21
68	0.23
69	0.24
70	0.25
71	0.25
72	0.23
73	0.22
74	0.21
75	0.18
76	0.16
77	0.15
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.14
82	0.14
83	0.13
84	0.12
85	0.11
86	0.11
87	0.12
88	0.14
89	0.13
90	0.14
91	0.17
92	0.19
93	0.25
94	0.26
95	0.26
96	0.31
97	0.34
98	0.36
99	0.38
100	0.39
101	0.36
102	0.35
103	0.35
104	0.3
105	0.32
106	0.38
107	0.34
108	0.38
109	0.36
110	0.39
111	0.39
112	0.41
113	0.35
114	0.27
115	0.26
116	0.23
117	0.24
118	0.24
119	0.23
120	0.19
121	0.19
122	0.2
123	0.22
124	0.2
125	0.17
126	0.18
127	0.23
128	0.26
129	0.25
130	0.24
131	0.21
132	0.2
133	0.22
134	0.19
135	0.12
136	0.13
137	0.18
138	0.21
139	0.25
140	0.26
141	0.25
142	0.28
143	0.3
144	0.29
145	0.26
146	0.29
147	0.28
148	0.31
149	0.32
150	0.35
151	0.34
152	0.31
153	0.3
154	0.25
155	0.24
156	0.21
157	0.22
158	0.16
159	0.15
160	0.15
161	0.13
162	0.13
163	0.1
164	0.1
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.11
173	0.13
174	0.16
175	0.18
176	0.19
177	0.2
178	0.22
179	0.27
180	0.3
181	0.31
182	0.3
183	0.35
184	0.35
185	0.32
186	0.31
187	0.27
188	0.22
189	0.2
190	0.21
191	0.15
192	0.17
193	0.17
194	0.18
195	0.18
196	0.17
197	0.18
198	0.19
199	0.18
200	0.16
201	0.18
202	0.16
203	0.14
204	0.15
205	0.14
206	0.12
207	0.12
208	0.14
209	0.12
210	0.13
211	0.12
212	0.12
213	0.1
214	0.08
215	0.08
216	0.06
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.09
226	0.1
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.12
231	0.14
232	0.15
233	0.15
234	0.14
235	0.15
236	0.2
237	0.22
238	0.22
239	0.2
240	0.18
241	0.15
242	0.16
243	0.15
244	0.11
245	0.11
246	0.15
247	0.19
248	0.22
249	0.22
250	0.22
251	0.25
252	0.28
253	0.29
254	0.34
255	0.33
256	0.41
257	0.46
258	0.52
259	0.56
260	0.6
261	0.65
262	0.6
263	0.62
264	0.55
265	0.55
266	0.5
267	0.47
268	0.44
269	0.41
270	0.39
271	0.37
272	0.38
273	0.39
274	0.37
275	0.34
276	0.32
277	0.29
278	0.27
279	0.23
280	0.18
281	0.13
282	0.14
283	0.12
284	0.09
285	0.08
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.09
291	0.11
292	0.12
293	0.21
294	0.26
295	0.33
296	0.43
297	0.53
298	0.62
299	0.69
300	0.78
301	0.8
302	0.87
303	0.9
304	0.9
305	0.89
306	0.85
307	0.81
308	0.73
309	0.64
310	0.54
311	0.45
312	0.44
313	0.42
314	0.43
315	0.46
316	0.49
317	0.49
318	0.49
319	0.51
320	0.45
321	0.39
322	0.35
323	0.29
324	0.24
325	0.23
326	0.21
327	0.17
328	0.14
329	0.11
330	0.07
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.09
336	0.15
337	0.2
338	0.24
339	0.3
340	0.3
341	0.31
342	0.35
343	0.37
344	0.38
345	0.38
346	0.41
347	0.39
348	0.43
349	0.43
350	0.43
351	0.41
352	0.39
353	0.41
354	0.41
355	0.46
356	0.49
357	0.54
358	0.56
359	0.55
360	0.52
361	0.45
362	0.39
363	0.32
364	0.25
365	0.19
366	0.13
367	0.11
368	0.09
369	0.1
370	0.09
371	0.07
372	0.08
373	0.08
374	0.11
375	0.15
376	0.16
377	0.23
378	0.29
379	0.32
380	0.33
381	0.36
382	0.33
383	0.39
384	0.4
385	0.39
386	0.38
387	0.4
388	0.39
389	0.4
390	0.39
391	0.33
392	0.38
393	0.4
394	0.41
395	0.44
396	0.47
397	0.5
398	0.53
399	0.54
400	0.48
401	0.45
402	0.4
403	0.36
404	0.33
405	0.26
406	0.24
407	0.21
408	0.18
409	0.14
410	0.12
411	0.09
412	0.08
413	0.09
414	0.08
415	0.13
416	0.14
417	0.13
418	0.16
419	0.2
420	0.26
421	0.29
422	0.34
423	0.32
424	0.4
425	0.42
426	0.43
427	0.41
428	0.38
429	0.36
430	0.35
431	0.34
432	0.3
433	0.3
434	0.28
435	0.3
436	0.35
437	0.44
438	0.49
439	0.56
440	0.59
441	0.67
442	0.72
443	0.74
444	0.69
445	0.63
446	0.59
447	0.51
448	0.43
449	0.35
450	0.28
451	0.23
452	0.2
453	0.15
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.1
464	0.11
465	0.13
466	0.13
467	0.13
468	0.17
469	0.22
470	0.23
471	0.27
472	0.27
473	0.27
474	0.29
475	0.28
476	0.23
477	0.18
478	0.19
479	0.14
480	0.14
481	0.13
482	0.11
483	0.12
484	0.12
485	0.12
486	0.11
487	0.13
488	0.12
489	0.13
490	0.13
491	0.15
492	0.21
493	0.22
494	0.24
495	0.26
496	0.3
497	0.34
498	0.39
499	0.38
500	0.38
501	0.4
502	0.45
503	0.49
504	0.53
505	0.56
506	0.59
507	0.68
508	0.7
509	0.71
510	0.67
511	0.66
512	0.61
513	0.55
514	0.47
515	0.38
516	0.28
517	0.26
518	0.21
519	0.14
520	0.11
521	0.09
522	0.11
523	0.14
524	0.19
525	0.19
526	0.21
527	0.25
528	0.33
529	0.42
530	0.48
531	0.51
532	0.55
533	0.62
534	0.64
535	0.66
536	0.62
537	0.54
538	0.49
539	0.47
540	0.41
541	0.34
542	0.34
543	0.28
544	0.26
545	0.28
546	0.33
547	0.33
548	0.32
549	0.31
550	0.27
551	0.27
552	0.28
553	0.25
554	0.17
555	0.12
556	0.1
557	0.1
558	0.1
559	0.09
560	0.07
561	0.08
562	0.09
563	0.1
564	0.12
565	0.15
566	0.23
567	0.29
568	0.32
569	0.38
570	0.4
571	0.43
572	0.45
573	0.47
574	0.43
575	0.42
576	0.4
577	0.35
578	0.33
579	0.32
580	0.32
581	0.27
582	0.26
583	0.2
584	0.19
585	0.18
586	0.18
587	0.23
588	0.25
589	0.29
590	0.32
591	0.38
592	0.4
593	0.43
594	0.48
595	0.49
596	0.52
597	0.55
598	0.53
599	0.55
600	0.57
601	0.57
602	0.6
603	0.61
604	0.62
605	0.61
606	0.61
607	0.59
608	0.58
609	0.6
610	0.53
611	0.48
612	0.47
613	0.47
614	0.44
615	0.42
616	0.44
617	0.44
618	0.41
619	0.37
620	0.31
621	0.28
622	0.27
623	0.24
624	0.21
625	0.18
626	0.2
627	0.19
628	0.18
629	0.21
630	0.24
631	0.23
632	0.25
633	0.27
634	0.28
635	0.3
636	0.32
637	0.29
638	0.3
639	0.36
640	0.39
641	0.41
642	0.46
643	0.52
644	0.56
645	0.58
646	0.62
647	0.65
648	0.68
649	0.74
650	0.75
651	0.72
652	0.75
653	0.78
654	0.79
655	0.8
656	0.77
657	0.71
658	0.69
659	0.63
660	0.53
661	0.47
662	0.39
663	0.32
664	0.29
665	0.28
666	0.24
667	0.26
668	0.29
669	0.36

C5GDA2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer