FuNGI

A0A094HJG0

Protein Details

Accession

A0A094HJG0

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
429-448	MKKRLGKSLRKSLRKREKNY	Basic
536-561	ETSGNESSRKKHKKKHMLSSSQPTGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
425-446	KEKEMKKRLGKSLRKSLRKREK
488-488	K
517-525	PHKKHNHLK
543-550	SRKKHKKK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPAGITPNGTPTPNSGGQPPKIIRRAKPDPFATYKRPVARPQAAPRARQQNQNGLTALNKPPPPPRPLPRYPGNNPAAAPAGPSASNASPQPQLDFTRKSNIGEYEDFALTTTKRAMREGLRYHIARFASKKNVDPTNSDDFIKPVSLHRRDPRQPPAGKVAKDEDSVMGEPIDDKEREKQEIARAAKDAQRAADLAQIAPSGNNASALAAKKVQSFKNEKTTQVHRTAQTESEMKESDLRYEEALPWHLEDAENKHTWVGNYEAALSDTNVIFVIDGGNFRMVPIEKWYKFTPKNQFKTMTIEEAEAEMNKKSKANRWAMHADQQNQEAAERQRGIQAMAGLYSKVKGERPMPKSEARDHDDLDITDDLFQDDDEQATVEPDNDEDTKFATEKIKREQLGANLFGEADEEEVEEEFKEEAKEKEMKKRLGKSLRKSLRKREKNYTYESDSSNPYSSSSGDETTDDEKQAEEDRKKDEEAKLKEKEKLGVPKIASGASTKGTTTPIGRPRSTDPHKKHNHLKRAGSPNLSASETSGNESSRKKHKKKHMLSSSQPTGTSTPRSGSPHPSSSAPAGGVSPRKSSIVKLHVNSSRLSDIQSNSPHPAMSDSEMSDGAGGKRKSGIKLRLGNSASPSRAGSPTNGSRAGSPAQAQGMAPLSLSPTSQIPFRPTSPPKPRGRSPASARVTNSSAGAASPIKPIMADEIAAAIPAEGIAIGMLLKIFSGRIKGNGKDKEDREKFIKLVKENSVFSQEDKLLRPRAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.3
3	0.32
4	0.32
5	0.33
6	0.38
7	0.4
8	0.48
9	0.49
10	0.51
11	0.56
12	0.61
13	0.61
14	0.63
15	0.71
16	0.7
17	0.75
18	0.71
19	0.71
20	0.72
21	0.73
22	0.7
23	0.68
24	0.68
25	0.67
26	0.68
27	0.67
28	0.68
29	0.7
30	0.72
31	0.73
32	0.76
33	0.73
34	0.71
35	0.73
36	0.74
37	0.7
38	0.7
39	0.66
40	0.65
41	0.63
42	0.64
43	0.55
44	0.45
45	0.43
46	0.39
47	0.38
48	0.35
49	0.34
50	0.33
51	0.41
52	0.46
53	0.52
54	0.56
55	0.6
56	0.62
57	0.68
58	0.72
59	0.73
60	0.76
61	0.74
62	0.75
63	0.69
64	0.62
65	0.55
66	0.49
67	0.43
68	0.33
69	0.29
70	0.19
71	0.18
72	0.15
73	0.15
74	0.17
75	0.14
76	0.17
77	0.17
78	0.19
79	0.21
80	0.22
81	0.24
82	0.24
83	0.27
84	0.31
85	0.36
86	0.36
87	0.41
88	0.42
89	0.42
90	0.42
91	0.42
92	0.41
93	0.37
94	0.36
95	0.31
96	0.29
97	0.27
98	0.23
99	0.21
100	0.16
101	0.16
102	0.19
103	0.19
104	0.2
105	0.21
106	0.26
107	0.3
108	0.39
109	0.42
110	0.44
111	0.47
112	0.47
113	0.47
114	0.47
115	0.43
116	0.38
117	0.37
118	0.38
119	0.4
120	0.42
121	0.47
122	0.49
123	0.54
124	0.51
125	0.51
126	0.5
127	0.49
128	0.47
129	0.43
130	0.37
131	0.3
132	0.29
133	0.27
134	0.22
135	0.21
136	0.29
137	0.32
138	0.4
139	0.47
140	0.56
141	0.62
142	0.69
143	0.72
144	0.71
145	0.7
146	0.66
147	0.69
148	0.66
149	0.6
150	0.56
151	0.51
152	0.45
153	0.42
154	0.38
155	0.29
156	0.25
157	0.24
158	0.21
159	0.15
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.15
164	0.12
165	0.14
166	0.21
167	0.25
168	0.28
169	0.29
170	0.31
171	0.34
172	0.43
173	0.44
174	0.39
175	0.37
176	0.37
177	0.39
178	0.38
179	0.33
180	0.24
181	0.23
182	0.21
183	0.2
184	0.19
185	0.16
186	0.13
187	0.12
188	0.12
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.08
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.1
198	0.12
199	0.13
200	0.14
201	0.15
202	0.19
203	0.24
204	0.27
205	0.31
206	0.37
207	0.41
208	0.5
209	0.52
210	0.51
211	0.52
212	0.56
213	0.55
214	0.56
215	0.55
216	0.47
217	0.47
218	0.46
219	0.41
220	0.38
221	0.34
222	0.27
223	0.25
224	0.24
225	0.21
226	0.23
227	0.22
228	0.21
229	0.2
230	0.2
231	0.17
232	0.18
233	0.19
234	0.17
235	0.19
236	0.16
237	0.15
238	0.14
239	0.13
240	0.12
241	0.13
242	0.16
243	0.19
244	0.19
245	0.19
246	0.19
247	0.2
248	0.19
249	0.19
250	0.17
251	0.13
252	0.13
253	0.13
254	0.12
255	0.12
256	0.12
257	0.1
258	0.09
259	0.08
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.15
276	0.23
277	0.23
278	0.27
279	0.29
280	0.36
281	0.39
282	0.47
283	0.52
284	0.53
285	0.58
286	0.6
287	0.62
288	0.55
289	0.58
290	0.52
291	0.44
292	0.34
293	0.29
294	0.24
295	0.21
296	0.19
297	0.13
298	0.12
299	0.09
300	0.1
301	0.1
302	0.12
303	0.13
304	0.2
305	0.28
306	0.36
307	0.38
308	0.42
309	0.48
310	0.48
311	0.53
312	0.51
313	0.46
314	0.39
315	0.38
316	0.32
317	0.26
318	0.24
319	0.21
320	0.17
321	0.17
322	0.16
323	0.15
324	0.17
325	0.17
326	0.17
327	0.14
328	0.14
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.08
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.1
339	0.17
340	0.26
341	0.3
342	0.36
343	0.39
344	0.43
345	0.45
346	0.48
347	0.49
348	0.44
349	0.42
350	0.37
351	0.34
352	0.3
353	0.26
354	0.23
355	0.16
356	0.12
357	0.11
358	0.1
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.05
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.06
377	0.07
378	0.08
379	0.08
380	0.1
381	0.14
382	0.17
383	0.21
384	0.27
385	0.32
386	0.31
387	0.34
388	0.35
389	0.34
390	0.34
391	0.32
392	0.26
393	0.2
394	0.19
395	0.17
396	0.14
397	0.09
398	0.05
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.04
407	0.05
408	0.06
409	0.07
410	0.08
411	0.12
412	0.18
413	0.2
414	0.3
415	0.37
416	0.43
417	0.48
418	0.55
419	0.6
420	0.65
421	0.71
422	0.69
423	0.72
424	0.75
425	0.78
426	0.77
427	0.79
428	0.79
429	0.81
430	0.8
431	0.8
432	0.8
433	0.76
434	0.77
435	0.71
436	0.66
437	0.59
438	0.54
439	0.46
440	0.38
441	0.35
442	0.28
443	0.23
444	0.18
445	0.16
446	0.14
447	0.15
448	0.14
449	0.13
450	0.12
451	0.13
452	0.14
453	0.16
454	0.16
455	0.14
456	0.12
457	0.11
458	0.12
459	0.16
460	0.21
461	0.21
462	0.23
463	0.27
464	0.29
465	0.3
466	0.34
467	0.36
468	0.38
469	0.42
470	0.48
471	0.51
472	0.52
473	0.56
474	0.52
475	0.5
476	0.47
477	0.49
478	0.44
479	0.42
480	0.39
481	0.37
482	0.36
483	0.33
484	0.27
485	0.19
486	0.17
487	0.14
488	0.14
489	0.11
490	0.11
491	0.12
492	0.13
493	0.14
494	0.2
495	0.27
496	0.32
497	0.32
498	0.34
499	0.38
500	0.47
501	0.53
502	0.56
503	0.54
504	0.59
505	0.67
506	0.71
507	0.76
508	0.76
509	0.78
510	0.76
511	0.76
512	0.75
513	0.76
514	0.73
515	0.66
516	0.58
517	0.5
518	0.45
519	0.39
520	0.3
521	0.22
522	0.2
523	0.17
524	0.18
525	0.17
526	0.15
527	0.18
528	0.21
529	0.26
530	0.33
531	0.44
532	0.5
533	0.58
534	0.68
535	0.76
536	0.83
537	0.88
538	0.88
539	0.87
540	0.86
541	0.86
542	0.82
543	0.72
544	0.62
545	0.53
546	0.44
547	0.38
548	0.34
549	0.26
550	0.21
551	0.24
552	0.29
553	0.3
554	0.36
555	0.39
556	0.39
557	0.4
558	0.39
559	0.37
560	0.34
561	0.33
562	0.24
563	0.19
564	0.15
565	0.17
566	0.21
567	0.21
568	0.21
569	0.21
570	0.23
571	0.23
572	0.26
573	0.31
574	0.34
575	0.39
576	0.39
577	0.46
578	0.48
579	0.49
580	0.46
581	0.41
582	0.35
583	0.28
584	0.29
585	0.25
586	0.23
587	0.28
588	0.32
589	0.31
590	0.31
591	0.31
592	0.29
593	0.25
594	0.25
595	0.21
596	0.19
597	0.19
598	0.16
599	0.17
600	0.17
601	0.17
602	0.15
603	0.14
604	0.13
605	0.18
606	0.18
607	0.17
608	0.22
609	0.26
610	0.31
611	0.39
612	0.44
613	0.46
614	0.55
615	0.56
616	0.6
617	0.59
618	0.55
619	0.52
620	0.5
621	0.41
622	0.34
623	0.33
624	0.27
625	0.28
626	0.27
627	0.24
628	0.26
629	0.31
630	0.34
631	0.35
632	0.32
633	0.3
634	0.33
635	0.32
636	0.26
637	0.22
638	0.2
639	0.19
640	0.2
641	0.19
642	0.17
643	0.17
644	0.15
645	0.13
646	0.11
647	0.11
648	0.11
649	0.11
650	0.1
651	0.1
652	0.12
653	0.14
654	0.17
655	0.2
656	0.24
657	0.27
658	0.36
659	0.41
660	0.51
661	0.59
662	0.66
663	0.71
664	0.75
665	0.79
666	0.79
667	0.8
668	0.79
669	0.77
670	0.78
671	0.74
672	0.71
673	0.66
674	0.61
675	0.55
676	0.47
677	0.39
678	0.29
679	0.23
680	0.17
681	0.18
682	0.15
683	0.14
684	0.15
685	0.15
686	0.14
687	0.14
688	0.14
689	0.16
690	0.15
691	0.14
692	0.11
693	0.13
694	0.12
695	0.12
696	0.12
697	0.07
698	0.06
699	0.05
700	0.05
701	0.03
702	0.03
703	0.03
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.03
709	0.04
710	0.04
711	0.05
712	0.07
713	0.11
714	0.13
715	0.21
716	0.28
717	0.34
718	0.43
719	0.51
720	0.56
721	0.61
722	0.65
723	0.68
724	0.68
725	0.68
726	0.64
727	0.61
728	0.57
729	0.55
730	0.58
731	0.52
732	0.54
733	0.56
734	0.57
735	0.53
736	0.54
737	0.53
738	0.46
739	0.43
740	0.42
741	0.38
742	0.36
743	0.39
744	0.42

A0A094HJG0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer