Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A094H5H5

Protein Details
Accession A0A094H5H5    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-172KKEAAPKKAEAKKTKEKRKPVAAKESSBasic
403-425SSSDVKKTKSKDKKTVAKAKELSHydrophilic
475-502LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-167PKKEAAPKKAEAKKTKEKRKPVA
411-416KSKDKK
481-494KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MNPNLVPVAKRKPKAPVGEKPDWLFGNGASKPTANPQVSLSQPKAGKKTTVKGSKATTTESTTKTPPSPELLDLVGEFLTEFGFNNTGNLFASERKDRTKSEGWQGRPVAAVKTSSVTLGNIYEKFRETTNGNTVVNQKETQAAPKKEAAPKKAEAKKTKEKRKPVAAKESSGDSDIEMGDAKAITTTTSKKSSSSSSSGSSSSESSDSDADDEKEVPAAKAAPPKAKVNALKRKASPDSSSSSSSDSDSDSSSSEDEAPKRKKSKTTPAAAKSTSSSNSGSSSDSDSSSESDSAPKKSAKSSSESSSSDSDSSSASSSSGSAKKASANDSSSSDDSSSDSDSDSSSDSDSSTQSAAAKVPLPDSGSESSSGSDSDSSSDEETGDATAKSDSTATLASSDSDSSSDVKKTKSKDKKTVAKAKELSPPLPPLPPTPVVKKTNVPFSRIPKDIVVDERLRSNAFVPYDYAQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDVEGKKGIRFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.71
3 0.7
4 0.71
5 0.76
6 0.77
7 0.7
8 0.68
9 0.58
10 0.5
11 0.4
12 0.32
13 0.32
14 0.28
15 0.27
16 0.23
17 0.22
18 0.22
19 0.28
20 0.36
21 0.29
22 0.29
23 0.3
24 0.35
25 0.39
26 0.46
27 0.41
28 0.39
29 0.42
30 0.47
31 0.5
32 0.47
33 0.5
34 0.5
35 0.57
36 0.6
37 0.65
38 0.62
39 0.62
40 0.65
41 0.63
42 0.59
43 0.55
44 0.48
45 0.44
46 0.48
47 0.45
48 0.44
49 0.4
50 0.42
51 0.4
52 0.39
53 0.36
54 0.35
55 0.35
56 0.32
57 0.31
58 0.27
59 0.25
60 0.22
61 0.2
62 0.14
63 0.1
64 0.09
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.13
79 0.18
80 0.24
81 0.27
82 0.32
83 0.36
84 0.36
85 0.43
86 0.47
87 0.49
88 0.53
89 0.58
90 0.56
91 0.6
92 0.59
93 0.53
94 0.48
95 0.43
96 0.34
97 0.27
98 0.25
99 0.17
100 0.18
101 0.17
102 0.15
103 0.14
104 0.12
105 0.11
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.19
114 0.2
115 0.19
116 0.22
117 0.27
118 0.31
119 0.29
120 0.31
121 0.35
122 0.35
123 0.36
124 0.3
125 0.24
126 0.23
127 0.24
128 0.3
129 0.35
130 0.34
131 0.34
132 0.39
133 0.44
134 0.48
135 0.54
136 0.5
137 0.46
138 0.49
139 0.56
140 0.58
141 0.61
142 0.62
143 0.64
144 0.71
145 0.75
146 0.81
147 0.8
148 0.82
149 0.82
150 0.85
151 0.86
152 0.84
153 0.85
154 0.78
155 0.71
156 0.63
157 0.57
158 0.47
159 0.38
160 0.29
161 0.18
162 0.15
163 0.12
164 0.1
165 0.08
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.07
174 0.11
175 0.14
176 0.18
177 0.19
178 0.2
179 0.22
180 0.25
181 0.28
182 0.29
183 0.27
184 0.26
185 0.27
186 0.27
187 0.26
188 0.23
189 0.18
190 0.15
191 0.13
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.15
209 0.18
210 0.21
211 0.23
212 0.25
213 0.27
214 0.32
215 0.37
216 0.41
217 0.49
218 0.5
219 0.53
220 0.52
221 0.56
222 0.54
223 0.5
224 0.43
225 0.36
226 0.35
227 0.33
228 0.33
229 0.28
230 0.26
231 0.23
232 0.21
233 0.19
234 0.15
235 0.12
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.11
244 0.12
245 0.2
246 0.24
247 0.3
248 0.35
249 0.38
250 0.44
251 0.49
252 0.58
253 0.58
254 0.63
255 0.66
256 0.66
257 0.68
258 0.61
259 0.54
260 0.44
261 0.38
262 0.3
263 0.23
264 0.19
265 0.15
266 0.16
267 0.16
268 0.15
269 0.14
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.1
279 0.14
280 0.16
281 0.17
282 0.19
283 0.2
284 0.2
285 0.24
286 0.29
287 0.26
288 0.29
289 0.31
290 0.32
291 0.35
292 0.35
293 0.34
294 0.3
295 0.29
296 0.24
297 0.2
298 0.17
299 0.12
300 0.12
301 0.1
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.11
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.18
312 0.2
313 0.23
314 0.22
315 0.22
316 0.23
317 0.25
318 0.28
319 0.25
320 0.24
321 0.21
322 0.17
323 0.15
324 0.15
325 0.13
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.13
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.14
350 0.13
351 0.17
352 0.17
353 0.16
354 0.16
355 0.16
356 0.15
357 0.14
358 0.13
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.11
391 0.13
392 0.17
393 0.19
394 0.23
395 0.28
396 0.33
397 0.43
398 0.52
399 0.6
400 0.66
401 0.73
402 0.79
403 0.85
404 0.89
405 0.83
406 0.83
407 0.77
408 0.71
409 0.7
410 0.64
411 0.55
412 0.49
413 0.49
414 0.41
415 0.41
416 0.37
417 0.31
418 0.33
419 0.37
420 0.37
421 0.39
422 0.45
423 0.46
424 0.49
425 0.53
426 0.52
427 0.58
428 0.56
429 0.54
430 0.52
431 0.56
432 0.6
433 0.55
434 0.53
435 0.45
436 0.45
437 0.44
438 0.41
439 0.39
440 0.34
441 0.34
442 0.34
443 0.34
444 0.31
445 0.28
446 0.25
447 0.24
448 0.22
449 0.22
450 0.22
451 0.22
452 0.27
453 0.27
454 0.26
455 0.22
456 0.23
457 0.23
458 0.22
459 0.22
460 0.18
461 0.18
462 0.25
463 0.29
464 0.27
465 0.27
466 0.3
467 0.31
468 0.36
469 0.4
470 0.43
471 0.49
472 0.59
473 0.68
474 0.75
475 0.82
476 0.84
477 0.9
478 0.91
479 0.9
480 0.91
481 0.88
482 0.86
483 0.84
484 0.79
485 0.68
486 0.58
487 0.57
488 0.46
489 0.42
490 0.34
491 0.27
492 0.23