FuNGI

C5GRR4

Protein Details

Accession

C5GRR4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
130-154	WCLAAQPRWKPTKKDKDGKFLPPAE	Hydrophilic
314-333	SGRKSDKSRRWKEVTHRRYH	Basic
968-994	LQAKETPKSTPQQRRWWHTHKYRDVLG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 8.5, cyto_mito 7, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MDIHRCRFVAYNPQAINALAFSHPPSAEASGRGVPTLRLAIGRANGDVEIWNPLRGAWLQESILRGGKDRTIEGLAWTQDPSEDEVDSSGFKVPGKLRLFSIGSSSVVTEWNLEEGRPARHSSGSFGEIWCLAAQPRWKPTKKDKDGKFLPPAEGEYTGQHLAVGCADGSIVILSTENGDLRYLRTMRPSTKKARVLSLTFQDRNTAVAGYADSTIRIFDIRSGKILRTVSMGKGPVKGSKDLLVWSVKCLPDGTIISGDSSGEIRFWDVRNYSLIQRIQGHQADVLDIAVSADGESVISGGADQRTTIYKLESGRKSDKSRRWKEVTHRRYHTHDVKAFAVYETKDISIVVSGGLDTIPVVLPLREYGAEHHRKLSNLPQVPQVTSSPSSRLLMSWWDREVCLWYISKRSGPGEQLLDGTSHKLVGKVLVQGDESLTSAALSSDGKLLIAATVAEVKIFSLKWRKGDSKPALRVQKIDLPPAVARHGAKSATFSPDSQWICLVRPNNDISLARIVSDSDPKENPRVLSELIDLDRIPRQIRHKEIYGTLGQYERSVRCVVFSEDSRMLACGDLGGFIDTWILEDVQEFEKTGKGVKVNGIASSDDESSDDDDAPVVLEGQRWIPTPSESPIPRLKAGILLLSFRPPNRSHVKTLTNGTTDSHVSRPTSPGTGRLMVLTAEHQLSEFEVMKGKLSDWSRRNPKAYLPNEFTILKDRAMGAIWDVNQSRERLWLYGPTWMWMFDLSQDFPSPDDVVESKDVPDTAKQGTNKRKRYDEEGKMPKTNTGAGDRIAVSKSDVGLGRKMRKIVGSDEANAQWIDLKRERSRDDVVEEDEYEQYNESSAANDSVLARLRRDRSLSEPETKEEGKDEDDGRDKETSHHGQYQPNGMSTSFPSSSITSSRKLQVAFAVVIDNRPHANGHNKTLAKGKQEQSQKPQAAIPEKPEREEQATVATQNPANQDAVPELPLQAKETPKSTPQQRRWWHTHKYRDVLGIVPLDQLGSVSDTDQELRGGGFNLEVAVVERPMWEIELPGRYVRDYE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.4
3	0.36
4	0.25
5	0.21
6	0.12
7	0.13
8	0.14
9	0.17
10	0.16
11	0.16
12	0.19
13	0.2
14	0.22
15	0.22
16	0.24
17	0.24
18	0.25
19	0.25
20	0.23
21	0.2
22	0.21
23	0.21
24	0.19
25	0.15
26	0.16
27	0.19
28	0.22
29	0.23
30	0.21
31	0.2
32	0.19
33	0.18
34	0.18
35	0.14
36	0.18
37	0.17
38	0.17
39	0.16
40	0.16
41	0.18
42	0.18
43	0.22
44	0.18
45	0.2
46	0.21
47	0.23
48	0.25
49	0.25
50	0.29
51	0.25
52	0.24
53	0.23
54	0.25
55	0.26
56	0.25
57	0.25
58	0.24
59	0.24
60	0.25
61	0.28
62	0.26
63	0.24
64	0.24
65	0.2
66	0.18
67	0.19
68	0.19
69	0.16
70	0.14
71	0.13
72	0.14
73	0.15
74	0.14
75	0.14
76	0.14
77	0.13
78	0.13
79	0.19
80	0.21
81	0.29
82	0.32
83	0.33
84	0.32
85	0.37
86	0.38
87	0.33
88	0.35
89	0.28
90	0.25
91	0.23
92	0.22
93	0.16
94	0.16
95	0.16
96	0.13
97	0.11
98	0.14
99	0.13
100	0.13
101	0.17
102	0.18
103	0.22
104	0.24
105	0.26
106	0.25
107	0.29
108	0.3
109	0.29
110	0.31
111	0.3
112	0.29
113	0.26
114	0.25
115	0.21
116	0.22
117	0.17
118	0.14
119	0.11
120	0.14
121	0.19
122	0.24
123	0.32
124	0.41
125	0.47
126	0.54
127	0.65
128	0.72
129	0.77
130	0.82
131	0.81
132	0.82
133	0.84
134	0.84
135	0.82
136	0.74
137	0.66
138	0.58
139	0.53
140	0.44
141	0.39
142	0.31
143	0.24
144	0.24
145	0.21
146	0.19
147	0.17
148	0.14
149	0.12
150	0.12
151	0.11
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.06
163	0.07
164	0.07
165	0.08
166	0.09
167	0.09
168	0.1
169	0.18
170	0.18
171	0.19
172	0.26
173	0.32
174	0.39
175	0.48
176	0.55
177	0.57
178	0.65
179	0.7
180	0.66
181	0.68
182	0.66
183	0.61
184	0.6
185	0.59
186	0.59
187	0.53
188	0.51
189	0.45
190	0.39
191	0.36
192	0.3
193	0.21
194	0.13
195	0.11
196	0.11
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.09
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.07
206	0.11
207	0.18
208	0.18
209	0.23
210	0.25
211	0.25
212	0.3
213	0.31
214	0.26
215	0.25
216	0.26
217	0.24
218	0.27
219	0.3
220	0.26
221	0.29
222	0.3
223	0.31
224	0.31
225	0.31
226	0.28
227	0.28
228	0.28
229	0.25
230	0.26
231	0.27
232	0.24
233	0.25
234	0.29
235	0.25
236	0.25
237	0.24
238	0.21
239	0.21
240	0.22
241	0.2
242	0.17
243	0.17
244	0.17
245	0.16
246	0.15
247	0.11
248	0.1
249	0.08
250	0.06
251	0.06
252	0.08
253	0.1
254	0.11
255	0.15
256	0.16
257	0.17
258	0.2
259	0.22
260	0.22
261	0.27
262	0.27
263	0.26
264	0.28
265	0.29
266	0.33
267	0.32
268	0.3
269	0.24
270	0.23
271	0.2
272	0.17
273	0.15
274	0.08
275	0.07
276	0.06
277	0.04
278	0.04
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.07
293	0.09
294	0.11
295	0.12
296	0.12
297	0.14
298	0.19
299	0.28
300	0.31
301	0.35
302	0.4
303	0.47
304	0.54
305	0.6
306	0.65
307	0.67
308	0.72
309	0.74
310	0.74
311	0.75
312	0.77
313	0.79
314	0.8
315	0.79
316	0.76
317	0.72
318	0.72
319	0.74
320	0.71
321	0.69
322	0.62
323	0.55
324	0.5
325	0.47
326	0.41
327	0.32
328	0.27
329	0.18
330	0.16
331	0.14
332	0.13
333	0.11
334	0.11
335	0.1
336	0.08
337	0.07
338	0.06
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.04
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.1
356	0.19
357	0.26
358	0.26
359	0.31
360	0.32
361	0.32
362	0.34
363	0.39
364	0.38
365	0.36
366	0.37
367	0.38
368	0.38
369	0.38
370	0.38
371	0.3
372	0.25
373	0.23
374	0.23
375	0.18
376	0.18
377	0.19
378	0.17
379	0.16
380	0.14
381	0.18
382	0.21
383	0.21
384	0.21
385	0.2
386	0.2
387	0.2
388	0.22
389	0.17
390	0.15
391	0.14
392	0.14
393	0.17
394	0.18
395	0.2
396	0.19
397	0.2
398	0.21
399	0.21
400	0.23
401	0.21
402	0.2
403	0.2
404	0.18
405	0.16
406	0.14
407	0.13
408	0.1
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.08
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.13
417	0.12
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.11
422	0.09
423	0.07
424	0.06
425	0.05
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.03
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.05
446	0.05
447	0.09
448	0.16
449	0.18
450	0.23
451	0.28
452	0.34
453	0.36
454	0.46
455	0.51
456	0.52
457	0.56
458	0.59
459	0.6
460	0.56
461	0.54
462	0.47
463	0.46
464	0.38
465	0.35
466	0.28
467	0.23
468	0.23
469	0.23
470	0.21
471	0.15
472	0.14
473	0.13
474	0.15
475	0.13
476	0.12
477	0.14
478	0.14
479	0.16
480	0.17
481	0.16
482	0.15
483	0.22
484	0.22
485	0.19
486	0.19
487	0.16
488	0.16
489	0.19
490	0.2
491	0.15
492	0.18
493	0.19
494	0.18
495	0.19
496	0.19
497	0.17
498	0.18
499	0.15
500	0.13
501	0.12
502	0.12
503	0.11
504	0.15
505	0.14
506	0.13
507	0.15
508	0.16
509	0.19
510	0.19
511	0.19
512	0.16
513	0.17
514	0.15
515	0.15
516	0.14
517	0.14
518	0.12
519	0.13
520	0.11
521	0.1
522	0.11
523	0.11
524	0.11
525	0.14
526	0.2
527	0.25
528	0.3
529	0.33
530	0.33
531	0.34
532	0.34
533	0.34
534	0.29
535	0.24
536	0.19
537	0.17
538	0.15
539	0.13
540	0.15
541	0.12
542	0.13
543	0.13
544	0.12
545	0.12
546	0.14
547	0.15
548	0.15
549	0.15
550	0.18
551	0.17
552	0.18
553	0.17
554	0.15
555	0.14
556	0.11
557	0.1
558	0.05
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.06
573	0.07
574	0.08
575	0.08
576	0.08
577	0.09
578	0.09
579	0.11
580	0.11
581	0.1
582	0.12
583	0.14
584	0.18
585	0.18
586	0.18
587	0.18
588	0.16
589	0.16
590	0.16
591	0.14
592	0.1
593	0.09
594	0.09
595	0.09
596	0.1
597	0.09
598	0.07
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.05
603	0.05
604	0.04
605	0.05
606	0.05
607	0.06
608	0.08
609	0.08
610	0.1
611	0.1
612	0.11
613	0.13
614	0.14
615	0.2
616	0.19
617	0.23
618	0.27
619	0.29
620	0.28
621	0.27
622	0.25
623	0.21
624	0.21
625	0.19
626	0.14
627	0.13
628	0.13
629	0.15
630	0.16
631	0.14
632	0.18
633	0.17
634	0.23
635	0.29
636	0.33
637	0.35
638	0.4
639	0.45
640	0.44
641	0.47
642	0.44
643	0.38
644	0.34
645	0.3
646	0.25
647	0.22
648	0.2
649	0.18
650	0.16
651	0.16
652	0.17
653	0.19
654	0.18
655	0.2
656	0.19
657	0.21
658	0.23
659	0.23
660	0.21
661	0.19
662	0.18
663	0.14
664	0.15
665	0.12
666	0.1
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.07
671	0.07
672	0.09
673	0.09
674	0.08
675	0.11
676	0.11
677	0.12
678	0.13
679	0.13
680	0.16
681	0.19
682	0.27
683	0.28
684	0.38
685	0.47
686	0.52
687	0.55
688	0.51
689	0.55
690	0.57
691	0.57
692	0.55
693	0.51
694	0.47
695	0.46
696	0.45
697	0.38
698	0.34
699	0.31
700	0.23
701	0.19
702	0.18
703	0.15
704	0.15
705	0.14
706	0.09
707	0.11
708	0.11
709	0.14
710	0.14
711	0.15
712	0.17
713	0.18
714	0.17
715	0.18
716	0.19
717	0.16
718	0.17
719	0.21
720	0.19
721	0.25
722	0.24
723	0.22
724	0.21
725	0.2
726	0.19
727	0.14
728	0.13
729	0.1
730	0.13
731	0.13
732	0.14
733	0.14
734	0.14
735	0.14
736	0.16
737	0.13
738	0.1
739	0.11
740	0.1
741	0.12
742	0.14
743	0.14
744	0.13
745	0.14
746	0.14
747	0.13
748	0.14
749	0.14
750	0.15
751	0.2
752	0.24
753	0.32
754	0.42
755	0.51
756	0.58
757	0.62
758	0.66
759	0.65
760	0.7
761	0.72
762	0.7
763	0.71
764	0.73
765	0.72
766	0.69
767	0.66
768	0.58
769	0.49
770	0.43
771	0.35
772	0.3
773	0.26
774	0.22
775	0.24
776	0.23
777	0.23
778	0.2
779	0.17
780	0.14
781	0.14
782	0.13
783	0.14
784	0.16
785	0.16
786	0.21
787	0.28
788	0.34
789	0.35
790	0.37
791	0.35
792	0.36
793	0.36
794	0.35
795	0.36
796	0.32
797	0.31
798	0.33
799	0.32
800	0.3
801	0.27
802	0.23
803	0.2
804	0.18
805	0.22
806	0.23
807	0.3
808	0.33
809	0.41
810	0.43
811	0.44
812	0.47
813	0.44
814	0.44
815	0.41
816	0.39
817	0.35
818	0.33
819	0.29
820	0.25
821	0.23
822	0.19
823	0.16
824	0.12
825	0.1
826	0.1
827	0.08
828	0.08
829	0.09
830	0.09
831	0.08
832	0.1
833	0.1
834	0.12
835	0.17
836	0.17
837	0.19
838	0.25
839	0.28
840	0.32
841	0.35
842	0.35
843	0.37
844	0.45
845	0.48
846	0.51
847	0.5
848	0.49
849	0.51
850	0.48
851	0.42
852	0.35
853	0.32
854	0.25
855	0.27
856	0.25
857	0.25
858	0.32
859	0.32
860	0.32
861	0.32
862	0.3
863	0.29
864	0.36
865	0.36
866	0.34
867	0.41
868	0.42
869	0.46
870	0.49
871	0.54
872	0.47
873	0.43
874	0.39
875	0.31
876	0.29
877	0.26
878	0.29
879	0.21
880	0.19
881	0.2
882	0.2
883	0.22
884	0.27
885	0.28
886	0.25
887	0.29
888	0.33
889	0.35
890	0.34
891	0.33
892	0.3
893	0.31
894	0.28
895	0.24
896	0.23
897	0.2
898	0.22
899	0.21
900	0.2
901	0.16
902	0.16
903	0.17
904	0.18
905	0.28
906	0.3
907	0.35
908	0.42
909	0.42
910	0.44
911	0.51
912	0.51
913	0.48
914	0.52
915	0.5
916	0.49
917	0.58
918	0.64
919	0.64
920	0.7
921	0.66
922	0.59
923	0.57
924	0.57
925	0.54
926	0.49
927	0.48
928	0.49
929	0.48
930	0.49
931	0.5
932	0.47
933	0.46
934	0.44
935	0.37
936	0.33
937	0.34
938	0.32
939	0.31
940	0.29
941	0.25
942	0.26
943	0.28
944	0.23
945	0.22
946	0.21
947	0.2
948	0.19
949	0.19
950	0.17
951	0.15
952	0.14
953	0.17
954	0.17
955	0.19
956	0.22
957	0.25
958	0.27
959	0.29
960	0.32
961	0.35
962	0.43
963	0.5
964	0.56
965	0.61
966	0.69
967	0.76
968	0.81
969	0.85
970	0.85
971	0.85
972	0.84
973	0.86
974	0.85
975	0.82
976	0.77
977	0.72
978	0.65
979	0.56
980	0.5
981	0.42
982	0.33
983	0.27
984	0.22
985	0.17
986	0.15
987	0.13
988	0.09
989	0.08
990	0.08
991	0.08
992	0.1
993	0.11
994	0.12
995	0.13
996	0.12
997	0.11
998	0.11
999	0.12
1000	0.12
1001	0.11
1002	0.1
1003	0.09
1004	0.09
1005	0.09
1006	0.08
1007	0.08
1008	0.09
1009	0.09
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.1
1013	0.11
1014	0.12
1015	0.11
1016	0.12
1017	0.16
1018	0.2
1019	0.22
1020	0.24
1021	0.24

C5GRR4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer