Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A094HCX2

Protein Details
Accession A0A094HCX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-296LTPPMHFARKRRFRKRISRTAIEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
61-87LPKTKAGRASKPSAKAAANKNGKRIKD
95-133HKPRVVAERAPKKLKLSLGGPKAPTVLKAKFKGKPPKRP
281-288RKRRFRKR
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 10.666, cyto_nucl 6.333, nucl 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MSKPMITLKIGGGSTPGINLTGKSPSTAGTPTPGSAAPKIRFNMSNGSKATTPNEVVVKPLPKTKAGRASKPSAKAAANKNGKRIKDESDDGDDHKPRVVAERAPKKLKLSLGGPKAPTVLKAKFKGKPPKRPLGEGYDSEASDREEDPLVVEEFILRMIPGPDCDYIRESIQNKSIGMPRQQDGADIQMKFIHTEGRRAIVTVRKHHYAATLVDLPCVIEGMKSWDKRGWWKSADICQMLLVFAPIKTEAEAATIDLPKIIDPQTFQYPHGLTPPMHFARKRRFRKRISRTAIEAVEDAVEKLLEADLKAESIRHELIEPEVRSRQGSRSFGSPLAYDEEGYSEDEDADGDIDDGTAYYGHINGNGVSKQEEGEEHDLDADLEADLEAAFEADFDIGTPASNAIAETPIATITSGTPDASGNVNGDSGDESSDASVEDDDADGGSGDEIDDDERTRLAQLQGAKEDIAEMEKQLASLQASWEMQVNPILKTRIKGNIEKVKAELQLKKSAIGEGDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.16
4 0.11
5 0.12
6 0.13
7 0.13
8 0.17
9 0.17
10 0.18
11 0.18
12 0.17
13 0.2
14 0.21
15 0.2
16 0.19
17 0.21
18 0.2
19 0.22
20 0.23
21 0.23
22 0.26
23 0.34
24 0.32
25 0.37
26 0.38
27 0.41
28 0.41
29 0.41
30 0.46
31 0.42
32 0.47
33 0.42
34 0.44
35 0.4
36 0.4
37 0.4
38 0.35
39 0.31
40 0.28
41 0.31
42 0.27
43 0.29
44 0.33
45 0.35
46 0.32
47 0.37
48 0.35
49 0.38
50 0.43
51 0.48
52 0.52
53 0.55
54 0.62
55 0.63
56 0.69
57 0.7
58 0.71
59 0.67
60 0.62
61 0.58
62 0.57
63 0.58
64 0.59
65 0.61
66 0.59
67 0.64
68 0.65
69 0.63
70 0.61
71 0.56
72 0.53
73 0.5
74 0.51
75 0.46
76 0.47
77 0.47
78 0.45
79 0.49
80 0.44
81 0.37
82 0.35
83 0.31
84 0.24
85 0.29
86 0.29
87 0.28
88 0.36
89 0.45
90 0.51
91 0.56
92 0.58
93 0.55
94 0.56
95 0.53
96 0.47
97 0.44
98 0.45
99 0.47
100 0.49
101 0.47
102 0.43
103 0.42
104 0.37
105 0.34
106 0.32
107 0.31
108 0.33
109 0.39
110 0.45
111 0.48
112 0.58
113 0.65
114 0.69
115 0.74
116 0.75
117 0.79
118 0.76
119 0.76
120 0.71
121 0.69
122 0.65
123 0.55
124 0.52
125 0.44
126 0.4
127 0.34
128 0.3
129 0.22
130 0.18
131 0.17
132 0.13
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.13
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.04
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.1
150 0.12
151 0.12
152 0.14
153 0.15
154 0.15
155 0.17
156 0.22
157 0.21
158 0.23
159 0.27
160 0.27
161 0.25
162 0.27
163 0.3
164 0.29
165 0.33
166 0.33
167 0.28
168 0.3
169 0.3
170 0.28
171 0.23
172 0.24
173 0.24
174 0.2
175 0.19
176 0.18
177 0.18
178 0.17
179 0.17
180 0.18
181 0.14
182 0.19
183 0.19
184 0.21
185 0.2
186 0.21
187 0.23
188 0.22
189 0.27
190 0.3
191 0.34
192 0.34
193 0.34
194 0.34
195 0.33
196 0.3
197 0.25
198 0.22
199 0.23
200 0.2
201 0.2
202 0.19
203 0.17
204 0.14
205 0.14
206 0.09
207 0.03
208 0.04
209 0.11
210 0.17
211 0.17
212 0.19
213 0.2
214 0.22
215 0.31
216 0.35
217 0.34
218 0.3
219 0.34
220 0.37
221 0.42
222 0.45
223 0.38
224 0.33
225 0.27
226 0.26
227 0.21
228 0.17
229 0.11
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.11
252 0.16
253 0.18
254 0.18
255 0.2
256 0.2
257 0.2
258 0.21
259 0.2
260 0.15
261 0.15
262 0.22
263 0.21
264 0.23
265 0.25
266 0.29
267 0.37
268 0.48
269 0.57
270 0.61
271 0.68
272 0.75
273 0.84
274 0.88
275 0.88
276 0.86
277 0.8
278 0.74
279 0.69
280 0.6
281 0.5
282 0.39
283 0.29
284 0.21
285 0.16
286 0.12
287 0.06
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.12
306 0.18
307 0.18
308 0.19
309 0.2
310 0.2
311 0.21
312 0.23
313 0.26
314 0.26
315 0.28
316 0.27
317 0.28
318 0.3
319 0.3
320 0.29
321 0.24
322 0.19
323 0.19
324 0.18
325 0.15
326 0.13
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.14
361 0.18
362 0.17
363 0.16
364 0.16
365 0.16
366 0.15
367 0.14
368 0.09
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.05
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.13
408 0.13
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.09
443 0.1
444 0.14
445 0.14
446 0.17
447 0.21
448 0.26
449 0.29
450 0.3
451 0.28
452 0.24
453 0.24
454 0.21
455 0.18
456 0.13
457 0.11
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.14
463 0.13
464 0.14
465 0.15
466 0.16
467 0.16
468 0.17
469 0.2
470 0.19
471 0.18
472 0.22
473 0.23
474 0.2
475 0.24
476 0.28
477 0.26
478 0.28
479 0.32
480 0.37
481 0.41
482 0.47
483 0.52
484 0.58
485 0.61
486 0.61
487 0.58
488 0.54
489 0.54
490 0.55
491 0.52
492 0.47
493 0.52
494 0.5
495 0.5
496 0.46
497 0.42
498 0.37