Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A094HIC3

Protein Details
Accession A0A094HIC3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
491-518EVKRVPKNMLQRAHKKERKNIPVKMTGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
501-525QRAHKKERKNIPVKMTGRGGGGGGG
Subcellular Location(s) plas 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004841  AA-permease/SLC12A_dom  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
IPR027078  snRNP-E  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0055085  P:transmembrane transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00324  AA_permease  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01718  Sm_E  
Amino Acid Sequences MKDFKREDDGPSAEETELGTVLTTNPEYNLTHGQNQLERGLKSRHIQFLALGGAIGTGLFVGSGGILADTGPAPLFMAYLSMMGVVWCVMNNLAEMVTYLPMKGISVPYFVDRFVDPSLSFAAGWNYWYAYAMLVAAEASAAAIVLDYWNAPVNVAVWITMVLFIILLLNVIAVSFFGEAEFWFASIKLITILGLIILGVVLFFGGGPSHDRLGFRYWKNPGAFKQYMSPNETGKFLAYWHAFVKAGFAFITSPELIAIAAGETVDPRRNIPKAAKRFVWRLAIFYGLASLIIGVIVSSDNDQLGGAGNAAASPFVIGIQSAGIKGLNHAINGAILTSAWSAGAQVFQPYQQARCPVRRGALHMDVLAAGVPQRVQHGHHGVQLVRQHQHHLGLHRLDRRHDHVPALPRRIRVSRPAAHAALPHAVPAVRDIFWPGKFNVSDFLAAYITLPIFVVLYAGHKLWFRTPFAIPIHEIDIITGKKEMDELAELEVKRVPKNMLQRAHKKERKNIPVKMTGRGGGGGGGRRVLLPPINMIFKLLQTNSTVSIWLYEQIAIRIEGKIRGFDEFMNLVIDDAIEVGQVTKTNDTETRRPLGRILLKGDNVSLIQSLSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.24
3 0.17
4 0.14
5 0.12
6 0.09
7 0.07
8 0.08
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.12
13 0.15
14 0.15
15 0.19
16 0.27
17 0.27
18 0.31
19 0.34
20 0.38
21 0.38
22 0.4
23 0.41
24 0.39
25 0.36
26 0.36
27 0.37
28 0.38
29 0.42
30 0.47
31 0.49
32 0.45
33 0.45
34 0.41
35 0.39
36 0.36
37 0.29
38 0.21
39 0.13
40 0.11
41 0.1
42 0.09
43 0.05
44 0.03
45 0.02
46 0.02
47 0.02
48 0.02
49 0.02
50 0.03
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.04
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.15
95 0.18
96 0.18
97 0.18
98 0.18
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.17
103 0.14
104 0.15
105 0.17
106 0.15
107 0.15
108 0.13
109 0.14
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.1
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.02
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.03
194 0.05
195 0.07
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.19
201 0.26
202 0.26
203 0.31
204 0.33
205 0.39
206 0.4
207 0.43
208 0.41
209 0.42
210 0.42
211 0.36
212 0.39
213 0.38
214 0.4
215 0.4
216 0.38
217 0.31
218 0.31
219 0.31
220 0.25
221 0.19
222 0.16
223 0.12
224 0.16
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.15
230 0.14
231 0.17
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.07
237 0.07
238 0.1
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.05
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.13
256 0.15
257 0.18
258 0.26
259 0.34
260 0.4
261 0.44
262 0.48
263 0.48
264 0.51
265 0.52
266 0.52
267 0.42
268 0.36
269 0.32
270 0.28
271 0.24
272 0.2
273 0.16
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.04
278 0.03
279 0.02
280 0.02
281 0.02
282 0.02
283 0.02
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.02
300 0.02
301 0.02
302 0.02
303 0.02
304 0.02
305 0.03
306 0.03
307 0.04
308 0.03
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.04
322 0.03
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.1
336 0.1
337 0.12
338 0.13
339 0.2
340 0.23
341 0.28
342 0.32
343 0.31
344 0.35
345 0.35
346 0.37
347 0.37
348 0.37
349 0.32
350 0.29
351 0.26
352 0.21
353 0.2
354 0.15
355 0.08
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.06
361 0.07
362 0.09
363 0.14
364 0.19
365 0.2
366 0.23
367 0.25
368 0.24
369 0.27
370 0.29
371 0.28
372 0.26
373 0.25
374 0.25
375 0.24
376 0.29
377 0.28
378 0.27
379 0.3
380 0.3
381 0.35
382 0.38
383 0.38
384 0.36
385 0.38
386 0.41
387 0.39
388 0.37
389 0.35
390 0.34
391 0.42
392 0.46
393 0.5
394 0.48
395 0.45
396 0.48
397 0.49
398 0.47
399 0.46
400 0.47
401 0.44
402 0.47
403 0.5
404 0.47
405 0.43
406 0.41
407 0.35
408 0.3
409 0.23
410 0.17
411 0.13
412 0.12
413 0.11
414 0.12
415 0.12
416 0.09
417 0.1
418 0.13
419 0.17
420 0.18
421 0.21
422 0.19
423 0.22
424 0.22
425 0.23
426 0.22
427 0.2
428 0.19
429 0.17
430 0.18
431 0.12
432 0.12
433 0.12
434 0.1
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.09
447 0.1
448 0.11
449 0.16
450 0.2
451 0.21
452 0.23
453 0.24
454 0.29
455 0.3
456 0.32
457 0.28
458 0.26
459 0.26
460 0.24
461 0.22
462 0.17
463 0.2
464 0.17
465 0.17
466 0.16
467 0.13
468 0.12
469 0.13
470 0.13
471 0.09
472 0.11
473 0.11
474 0.12
475 0.17
476 0.17
477 0.18
478 0.2
479 0.2
480 0.2
481 0.22
482 0.22
483 0.23
484 0.33
485 0.41
486 0.47
487 0.55
488 0.64
489 0.71
490 0.8
491 0.81
492 0.79
493 0.8
494 0.82
495 0.83
496 0.82
497 0.8
498 0.77
499 0.8
500 0.75
501 0.71
502 0.63
503 0.54
504 0.46
505 0.38
506 0.31
507 0.23
508 0.23
509 0.2
510 0.17
511 0.16
512 0.15
513 0.15
514 0.15
515 0.16
516 0.16
517 0.14
518 0.17
519 0.2
520 0.23
521 0.22
522 0.24
523 0.22
524 0.21
525 0.25
526 0.22
527 0.2
528 0.2
529 0.22
530 0.23
531 0.22
532 0.21
533 0.15
534 0.16
535 0.15
536 0.14
537 0.14
538 0.13
539 0.14
540 0.15
541 0.16
542 0.16
543 0.16
544 0.17
545 0.18
546 0.2
547 0.21
548 0.23
549 0.22
550 0.23
551 0.24
552 0.22
553 0.25
554 0.21
555 0.2
556 0.18
557 0.17
558 0.15
559 0.13
560 0.12
561 0.07
562 0.07
563 0.06
564 0.04
565 0.04
566 0.05
567 0.06
568 0.08
569 0.1
570 0.13
571 0.14
572 0.18
573 0.24
574 0.3
575 0.37
576 0.41
577 0.46
578 0.47
579 0.48
580 0.47
581 0.51
582 0.52
583 0.5
584 0.51
585 0.5
586 0.49
587 0.49
588 0.47
589 0.39
590 0.31
591 0.27
592 0.21