Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179TVK6

Protein Details
Accession A0A179TVK6    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
213-232YTRRRFDDREHRRRRGRANEBasic
307-330LDSRERTRKSFRNRSPRNSRSRDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-203RRRS
221-228REHRRRRG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MEVASSLHPQPTNGTNLNPSMIDSSMDIDMDLDLGPLPEPEPEHVGIQAQVPSVTAEEAVASSHLNEEPQFEKVHIRGVDELTTEDLKRYSSEHFVTEELTRIEWIDDTSANLVYSCTDIGLQALATFSQQNPEEDPSPLHSLRLRTAKSLSTHPESVLQVRTAVKTDRKRQRAHESSRFYLMHPEHDPRERMRREFADRRRSGRRDDSESDYTRRRFDDREHRRRRGRANEENLSESMYDDDGGRSRERSGSNEGRLNGDRGRDRSRRDRRDTIELFPDDGPGSSGRLRDRSASPLRMEFDQDSTLDSRERTRKSFRNRSPRNSRSRDLMSRANEYATIDDGSGRPELFPNKTTSSYLKRELFPKKSTSSNHRRSDAFDAADETADLFPKHMPVPLMDGASGGEASGRSTGPVELFPDKSDNNGMSIHVAASEDQGISIRGAAQGISIKGAASVRELFPSKYNSNEGKELFSDKLQGRGGKRRKAEDMFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.32
4 0.34
5 0.3
6 0.27
7 0.22
8 0.2
9 0.18
10 0.14
11 0.15
12 0.14
13 0.14
14 0.12
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.08
19 0.06
20 0.05
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.07
25 0.08
26 0.1
27 0.12
28 0.16
29 0.17
30 0.17
31 0.18
32 0.19
33 0.18
34 0.19
35 0.19
36 0.15
37 0.14
38 0.13
39 0.13
40 0.12
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.13
55 0.14
56 0.16
57 0.17
58 0.16
59 0.2
60 0.2
61 0.27
62 0.24
63 0.25
64 0.26
65 0.27
66 0.28
67 0.24
68 0.24
69 0.19
70 0.21
71 0.19
72 0.17
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.2
79 0.22
80 0.22
81 0.24
82 0.23
83 0.25
84 0.24
85 0.23
86 0.18
87 0.16
88 0.14
89 0.13
90 0.13
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.1
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.11
117 0.12
118 0.13
119 0.16
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.22
124 0.21
125 0.26
126 0.25
127 0.24
128 0.23
129 0.24
130 0.29
131 0.36
132 0.32
133 0.29
134 0.32
135 0.34
136 0.34
137 0.37
138 0.37
139 0.34
140 0.34
141 0.32
142 0.34
143 0.31
144 0.31
145 0.28
146 0.22
147 0.2
148 0.2
149 0.2
150 0.18
151 0.21
152 0.26
153 0.32
154 0.42
155 0.5
156 0.56
157 0.61
158 0.66
159 0.73
160 0.75
161 0.76
162 0.76
163 0.73
164 0.67
165 0.68
166 0.61
167 0.5
168 0.48
169 0.4
170 0.35
171 0.31
172 0.32
173 0.3
174 0.33
175 0.35
176 0.31
177 0.41
178 0.39
179 0.39
180 0.41
181 0.43
182 0.47
183 0.55
184 0.6
185 0.61
186 0.61
187 0.64
188 0.68
189 0.65
190 0.63
191 0.63
192 0.59
193 0.56
194 0.56
195 0.57
196 0.54
197 0.54
198 0.52
199 0.49
200 0.44
201 0.39
202 0.37
203 0.32
204 0.28
205 0.33
206 0.41
207 0.46
208 0.56
209 0.63
210 0.7
211 0.75
212 0.79
213 0.8
214 0.79
215 0.78
216 0.76
217 0.75
218 0.72
219 0.66
220 0.61
221 0.52
222 0.42
223 0.32
224 0.23
225 0.15
226 0.09
227 0.08
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.14
236 0.15
237 0.18
238 0.24
239 0.28
240 0.31
241 0.34
242 0.34
243 0.33
244 0.33
245 0.32
246 0.25
247 0.24
248 0.23
249 0.23
250 0.31
251 0.32
252 0.37
253 0.45
254 0.55
255 0.6
256 0.65
257 0.7
258 0.67
259 0.72
260 0.7
261 0.62
262 0.58
263 0.49
264 0.43
265 0.35
266 0.31
267 0.21
268 0.18
269 0.16
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.12
274 0.13
275 0.16
276 0.17
277 0.19
278 0.21
279 0.27
280 0.31
281 0.32
282 0.32
283 0.33
284 0.33
285 0.31
286 0.32
287 0.24
288 0.21
289 0.18
290 0.16
291 0.15
292 0.14
293 0.15
294 0.13
295 0.13
296 0.17
297 0.24
298 0.27
299 0.3
300 0.38
301 0.45
302 0.55
303 0.65
304 0.68
305 0.72
306 0.78
307 0.83
308 0.86
309 0.87
310 0.87
311 0.83
312 0.76
313 0.72
314 0.7
315 0.66
316 0.6
317 0.58
318 0.51
319 0.48
320 0.46
321 0.4
322 0.33
323 0.27
324 0.23
325 0.17
326 0.14
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.11
335 0.15
336 0.17
337 0.19
338 0.23
339 0.25
340 0.27
341 0.29
342 0.32
343 0.36
344 0.38
345 0.44
346 0.43
347 0.43
348 0.49
349 0.56
350 0.58
351 0.54
352 0.55
353 0.51
354 0.53
355 0.56
356 0.59
357 0.6
358 0.64
359 0.67
360 0.65
361 0.62
362 0.6
363 0.61
364 0.56
365 0.46
366 0.37
367 0.32
368 0.29
369 0.27
370 0.23
371 0.16
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.09
376 0.09
377 0.11
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.19
383 0.2
384 0.21
385 0.18
386 0.18
387 0.15
388 0.15
389 0.14
390 0.08
391 0.06
392 0.05
393 0.06
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.12
401 0.15
402 0.17
403 0.19
404 0.2
405 0.23
406 0.22
407 0.23
408 0.26
409 0.23
410 0.21
411 0.2
412 0.19
413 0.17
414 0.17
415 0.14
416 0.11
417 0.11
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.12
433 0.12
434 0.13
435 0.12
436 0.11
437 0.13
438 0.14
439 0.13
440 0.13
441 0.16
442 0.16
443 0.21
444 0.24
445 0.24
446 0.27
447 0.34
448 0.33
449 0.34
450 0.41
451 0.42
452 0.45
453 0.5
454 0.47
455 0.43
456 0.43
457 0.42
458 0.37
459 0.33
460 0.35
461 0.29
462 0.35
463 0.36
464 0.39
465 0.43
466 0.51
467 0.59
468 0.61
469 0.67
470 0.67
471 0.72