FuNGI

A0A094C1I3

Protein Details

Accession

A0A094C1I3

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
428-451	EMKKRLGKSLRKSLRKREKNYTYE	Basic
536-561	ETSGNESTRKKHKKKHMLSSSQPTGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
425-446	KEKEMKKRLGKSLRKSLRKREK
488-488	K
518-522	HKKHN
544-550	RKKHKKK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPAGITPNGTPTPNSGGQPPKIIRRAKADPFATYKRPVARPQAAPRSRQQNQNGLTALNKPPPQPRPLPRYPGNNRAAAAGPSNTNAPPQPQLDFTRKSNAGEYQDFALTTTKRAMREGLRYHIARFASKKDVDPTNSEDFIRPVSLHRRDPRQPPAGKVAKDEDTVMGGEPIDDKEREKQEIARAAKEAQRAADLAQIAPSGNNASALAAKKVQSFKNEKTTQVHRTAQSEAEMKESDLRYEEALPWHLEDAENKHTWVGNYEAALSDTNVIFVIDGGNFRMVPIEKWYKFTPKNQFKTMTIEEAEAEMNKKSKANRWAMHADQQNQEAAERQRGIQAMAGLYSKVKGERPMPKSEARDHDDLDITDDLFQDDDEQATVEPENDEDTKFAAEKIKREQLGANLFGDADEEEVEEEFKEEAKEKEMKKRLGKSLRKSLRKREKNYTYESDSSNPYSSSSGDETTDDEKQAEEDRKKDEEAKLKEKEKLGVPKIASGASTKGTTTPIGRPRSTDPHKKHNHLKRAGSPNLSASETSGNESTRKKHKKKHMLSSSQPTGTSTPRSGSPPSSSAPVGGVSPRKSSIVKLHVNSSRLSDIQSNSPHPAMSDSEMSDGAGGKRKSGIKLRLGSSASPSRAGSPANGSRAGSPAQTQGAASPIRPIMADEIAAAIPAEGIAIGMLLKIFSGRIKGNGKDKEDREKFIKLVKENSVFSQEDKLLRPRAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.3
3	0.32
4	0.32
5	0.33
6	0.38
7	0.4
8	0.48
9	0.49
10	0.51
11	0.56
12	0.6
13	0.58
14	0.59
15	0.66
16	0.65
17	0.7
18	0.63
19	0.61
20	0.63
21	0.65
22	0.61
23	0.57
24	0.55
25	0.54
26	0.58
27	0.59
28	0.61
29	0.63
30	0.67
31	0.72
32	0.77
33	0.74
34	0.73
35	0.74
36	0.74
37	0.71
38	0.71
39	0.68
40	0.66
41	0.64
42	0.66
43	0.59
44	0.49
45	0.45
46	0.42
47	0.4
48	0.37
49	0.37
50	0.35
51	0.42
52	0.47
53	0.53
54	0.56
55	0.61
56	0.63
57	0.69
58	0.73
59	0.72
60	0.77
61	0.77
62	0.78
63	0.74
64	0.68
65	0.6
66	0.53
67	0.48
68	0.39
69	0.34
70	0.26
71	0.22
72	0.19
73	0.22
74	0.19
75	0.19
76	0.19
77	0.19
78	0.22
79	0.23
80	0.24
81	0.26
82	0.32
83	0.37
84	0.4
85	0.4
86	0.44
87	0.44
88	0.44
89	0.43
90	0.43
91	0.42
92	0.4
93	0.39
94	0.32
95	0.31
96	0.29
97	0.26
98	0.25
99	0.19
100	0.18
101	0.23
102	0.24
103	0.24
104	0.26
105	0.3
106	0.31
107	0.4
108	0.43
109	0.43
110	0.47
111	0.47
112	0.47
113	0.47
114	0.42
115	0.38
116	0.36
117	0.34
118	0.36
119	0.37
120	0.39
121	0.4
122	0.45
123	0.43
124	0.44
125	0.45
126	0.43
127	0.42
128	0.4
129	0.35
130	0.29
131	0.28
132	0.25
133	0.19
134	0.18
135	0.26
136	0.31
137	0.39
138	0.45
139	0.52
140	0.58
141	0.66
142	0.71
143	0.71
144	0.68
145	0.64
146	0.67
147	0.66
148	0.6
149	0.55
150	0.51
151	0.44
152	0.41
153	0.38
154	0.28
155	0.22
156	0.21
157	0.17
158	0.13
159	0.09
160	0.08
161	0.08
162	0.09
163	0.11
164	0.11
165	0.12
166	0.19
167	0.23
168	0.26
169	0.27
170	0.3
171	0.34
172	0.42
173	0.43
174	0.38
175	0.36
176	0.37
177	0.39
178	0.38
179	0.32
180	0.24
181	0.22
182	0.2
183	0.19
184	0.19
185	0.16
186	0.13
187	0.12
188	0.11
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.06
196	0.07
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.13
201	0.15
202	0.19
203	0.24
204	0.26
205	0.31
206	0.37
207	0.41
208	0.49
209	0.51
210	0.5
211	0.51
212	0.56
213	0.55
214	0.55
215	0.55
216	0.46
217	0.46
218	0.45
219	0.4
220	0.36
221	0.33
222	0.26
223	0.23
224	0.21
225	0.19
226	0.22
227	0.21
228	0.19
229	0.16
230	0.17
231	0.15
232	0.16
233	0.17
234	0.14
235	0.15
236	0.15
237	0.14
238	0.14
239	0.13
240	0.12
241	0.12
242	0.15
243	0.18
244	0.19
245	0.18
246	0.18
247	0.19
248	0.19
249	0.19
250	0.17
251	0.13
252	0.12
253	0.13
254	0.12
255	0.12
256	0.12
257	0.1
258	0.09
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.14
276	0.22
277	0.22
278	0.26
279	0.29
280	0.35
281	0.38
282	0.46
283	0.51
284	0.53
285	0.58
286	0.59
287	0.61
288	0.54
289	0.57
290	0.51
291	0.43
292	0.34
293	0.28
294	0.23
295	0.2
296	0.19
297	0.12
298	0.11
299	0.09
300	0.09
301	0.1
302	0.12
303	0.13
304	0.19
305	0.28
306	0.36
307	0.37
308	0.42
309	0.47
310	0.46
311	0.52
312	0.5
313	0.45
314	0.38
315	0.37
316	0.31
317	0.25
318	0.23
319	0.2
320	0.17
321	0.16
322	0.15
323	0.14
324	0.16
325	0.17
326	0.17
327	0.14
328	0.13
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.06
336	0.07
337	0.08
338	0.1
339	0.16
340	0.25
341	0.29
342	0.35
343	0.38
344	0.42
345	0.44
346	0.47
347	0.48
348	0.43
349	0.41
350	0.36
351	0.33
352	0.29
353	0.26
354	0.22
355	0.16
356	0.12
357	0.1
358	0.09
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.04
372	0.05
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.13
382	0.14
383	0.18
384	0.23
385	0.29
386	0.28
387	0.29
388	0.3
389	0.29
390	0.32
391	0.3
392	0.24
393	0.18
394	0.18
395	0.16
396	0.15
397	0.1
398	0.06
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.06
409	0.08
410	0.08
411	0.12
412	0.19
413	0.21
414	0.31
415	0.38
416	0.44
417	0.5
418	0.56
419	0.62
420	0.66
421	0.72
422	0.7
423	0.74
424	0.76
425	0.79
426	0.78
427	0.8
428	0.81
429	0.82
430	0.81
431	0.8
432	0.81
433	0.77
434	0.78
435	0.72
436	0.67
437	0.6
438	0.55
439	0.47
440	0.4
441	0.36
442	0.3
443	0.24
444	0.19
445	0.17
446	0.15
447	0.15
448	0.14
449	0.13
450	0.13
451	0.13
452	0.15
453	0.17
454	0.17
455	0.15
456	0.13
457	0.12
458	0.12
459	0.17
460	0.22
461	0.22
462	0.24
463	0.28
464	0.3
465	0.32
466	0.36
467	0.37
468	0.39
469	0.44
470	0.49
471	0.52
472	0.54
473	0.57
474	0.54
475	0.52
476	0.49
477	0.51
478	0.46
479	0.44
480	0.41
481	0.39
482	0.38
483	0.34
484	0.28
485	0.2
486	0.18
487	0.14
488	0.14
489	0.12
490	0.12
491	0.13
492	0.14
493	0.15
494	0.21
495	0.27
496	0.33
497	0.33
498	0.35
499	0.4
500	0.49
501	0.54
502	0.57
503	0.55
504	0.6
505	0.68
506	0.73
507	0.77
508	0.77
509	0.79
510	0.77
511	0.78
512	0.76
513	0.77
514	0.75
515	0.68
516	0.59
517	0.52
518	0.46
519	0.41
520	0.31
521	0.23
522	0.21
523	0.18
524	0.19
525	0.18
526	0.16
527	0.2
528	0.22
529	0.27
530	0.34
531	0.45
532	0.51
533	0.59
534	0.69
535	0.77
536	0.84
537	0.89
538	0.89
539	0.88
540	0.87
541	0.87
542	0.83
543	0.73
544	0.64
545	0.54
546	0.46
547	0.4
548	0.36
549	0.28
550	0.23
551	0.23
552	0.27
553	0.28
554	0.29
555	0.3
556	0.28
557	0.28
558	0.3
559	0.27
560	0.24
561	0.22
562	0.19
563	0.15
564	0.17
565	0.21
566	0.2
567	0.22
568	0.23
569	0.25
570	0.25
571	0.28
572	0.32
573	0.36
574	0.41
575	0.41
576	0.47
577	0.5
578	0.51
579	0.48
580	0.43
581	0.37
582	0.3
583	0.3
584	0.27
585	0.24
586	0.3
587	0.33
588	0.33
589	0.33
590	0.33
591	0.3
592	0.26
593	0.26
594	0.22
595	0.2
596	0.2
597	0.17
598	0.19
599	0.19
600	0.18
601	0.16
602	0.15
603	0.14
604	0.19
605	0.18
606	0.18
607	0.24
608	0.27
609	0.33
610	0.4
611	0.46
612	0.47
613	0.54
614	0.55
615	0.57
616	0.55
617	0.51
618	0.48
619	0.48
620	0.41
621	0.36
622	0.34
623	0.3
624	0.3
625	0.3
626	0.25
627	0.26
628	0.3
629	0.31
630	0.33
631	0.31
632	0.3
633	0.32
634	0.31
635	0.24
636	0.2
637	0.2
638	0.19
639	0.19
640	0.18
641	0.16
642	0.2
643	0.19
644	0.17
645	0.18
646	0.17
647	0.17
648	0.17
649	0.17
650	0.16
651	0.16
652	0.16
653	0.12
654	0.13
655	0.13
656	0.13
657	0.11
658	0.07
659	0.06
660	0.05
661	0.05
662	0.03
663	0.03
664	0.03
665	0.03
666	0.03
667	0.03
668	0.03
669	0.03
670	0.03
671	0.04
672	0.05
673	0.07
674	0.11
675	0.13
676	0.21
677	0.28
678	0.34
679	0.43
680	0.5
681	0.56
682	0.61
683	0.65
684	0.68
685	0.67
686	0.68
687	0.64
688	0.61
689	0.57
690	0.55
691	0.58
692	0.52
693	0.54
694	0.56
695	0.57
696	0.53
697	0.54
698	0.53
699	0.46
700	0.43
701	0.42
702	0.38
703	0.36
704	0.39
705	0.42

A0A094C1I3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer