Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TNJ0

Protein Details
Accession A7TNJ0    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MAKSTTKKESKKDLKLTKKEESSSHydrophilic
73-95SEDEKKEEKKEVKKEEKKEESSSAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-409RGGRGDRGGFRGGRGDRGGFRGDRGGFRGDRGGRGGNRGGRGGFR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG vpo:Kpol_1026p21  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
Amino Acid Sequences MAKSTTKKESKKDLKLTKKEESSSSSSSSSSSSSSAEESSSSSSSSSESESEDEDKSSSSSSSSESDSSSDESEDEKKEEKKEVKKEEKKEESSSDSSSSSSESEEEEKKKKSSSSSDESSSDESSSDESSSDEEEKEEAKDSKKRKLEESEESEESEESEKESKKSKTEDSNDGETATIFVGRLSWSVDDEWLKNEFEHIGDVIGARVIYERGTDRSRGYGYVDFSSKSAAERAVKEMHGKQIDGREINCDMSTSKPAGGNGGDRAKKFGDVPSQPSDTLFLGNLSFNADRDQIYELFSKHGEIISVRLPTHPETEQPKGFGYVQYGNVNDAQSALDALQGEYIDNRPVRLDFSTPKPNNGGDRGGRGDRGGFRGGRGDRGGFRGDRGGFRGDRGGRGGNRGGRGGFRPSGSGANTAPLGRQRNTASFSGQKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.9
3 0.89
4 0.87
5 0.84
6 0.77
7 0.71
8 0.67
9 0.63
10 0.57
11 0.53
12 0.45
13 0.37
14 0.34
15 0.31
16 0.26
17 0.2
18 0.18
19 0.15
20 0.15
21 0.17
22 0.17
23 0.16
24 0.15
25 0.15
26 0.17
27 0.17
28 0.15
29 0.14
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.15
34 0.13
35 0.14
36 0.15
37 0.18
38 0.2
39 0.2
40 0.19
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.15
45 0.13
46 0.11
47 0.11
48 0.13
49 0.15
50 0.16
51 0.17
52 0.17
53 0.18
54 0.18
55 0.2
56 0.18
57 0.16
58 0.14
59 0.15
60 0.19
61 0.2
62 0.21
63 0.24
64 0.27
65 0.3
66 0.39
67 0.45
68 0.5
69 0.58
70 0.66
71 0.72
72 0.77
73 0.83
74 0.85
75 0.86
76 0.82
77 0.78
78 0.72
79 0.67
80 0.61
81 0.55
82 0.46
83 0.37
84 0.32
85 0.27
86 0.23
87 0.17
88 0.14
89 0.12
90 0.12
91 0.16
92 0.22
93 0.27
94 0.32
95 0.35
96 0.36
97 0.38
98 0.39
99 0.41
100 0.44
101 0.46
102 0.48
103 0.49
104 0.5
105 0.49
106 0.48
107 0.44
108 0.36
109 0.28
110 0.21
111 0.17
112 0.14
113 0.14
114 0.12
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.12
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.15
126 0.15
127 0.19
128 0.26
129 0.3
130 0.38
131 0.43
132 0.45
133 0.48
134 0.54
135 0.56
136 0.58
137 0.61
138 0.59
139 0.54
140 0.52
141 0.46
142 0.37
143 0.31
144 0.23
145 0.15
146 0.11
147 0.15
148 0.15
149 0.16
150 0.23
151 0.25
152 0.28
153 0.32
154 0.37
155 0.41
156 0.45
157 0.52
158 0.51
159 0.53
160 0.48
161 0.44
162 0.38
163 0.28
164 0.23
165 0.15
166 0.1
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.06
200 0.09
201 0.11
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.16
206 0.15
207 0.17
208 0.17
209 0.17
210 0.17
211 0.18
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.13
216 0.1
217 0.09
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.16
222 0.18
223 0.18
224 0.21
225 0.22
226 0.25
227 0.24
228 0.23
229 0.21
230 0.24
231 0.26
232 0.24
233 0.23
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.18
238 0.14
239 0.11
240 0.12
241 0.14
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.16
250 0.22
251 0.23
252 0.22
253 0.25
254 0.24
255 0.24
256 0.23
257 0.23
258 0.24
259 0.24
260 0.3
261 0.32
262 0.33
263 0.32
264 0.31
265 0.29
266 0.21
267 0.19
268 0.14
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.15
281 0.12
282 0.14
283 0.16
284 0.15
285 0.16
286 0.16
287 0.15
288 0.13
289 0.13
290 0.11
291 0.09
292 0.11
293 0.13
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.17
298 0.18
299 0.22
300 0.2
301 0.22
302 0.26
303 0.32
304 0.33
305 0.32
306 0.31
307 0.3
308 0.31
309 0.26
310 0.25
311 0.22
312 0.24
313 0.25
314 0.25
315 0.23
316 0.24
317 0.23
318 0.18
319 0.15
320 0.12
321 0.09
322 0.09
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.1
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.17
338 0.18
339 0.22
340 0.22
341 0.29
342 0.4
343 0.4
344 0.43
345 0.43
346 0.44
347 0.45
348 0.44
349 0.43
350 0.35
351 0.39
352 0.41
353 0.39
354 0.37
355 0.32
356 0.33
357 0.3
358 0.31
359 0.31
360 0.26
361 0.25
362 0.33
363 0.33
364 0.34
365 0.33
366 0.32
367 0.3
368 0.33
369 0.37
370 0.29
371 0.3
372 0.32
373 0.32
374 0.31
375 0.32
376 0.34
377 0.3
378 0.31
379 0.38
380 0.33
381 0.33
382 0.34
383 0.39
384 0.34
385 0.39
386 0.44
387 0.41
388 0.42
389 0.41
390 0.39
391 0.36
392 0.37
393 0.38
394 0.35
395 0.3
396 0.3
397 0.29
398 0.33
399 0.31
400 0.31
401 0.25
402 0.24
403 0.25
404 0.23
405 0.24
406 0.26
407 0.31
408 0.29
409 0.34
410 0.36
411 0.4
412 0.45
413 0.44
414 0.43
415 0.45
416 0.49
417 0.52