Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GHC3

Protein Details
Accession C5GHC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
388-407VSKKPGRLIKGRKSRPRSESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
361-404APRKRLIRGQRMRTSSPPSRASPAPARVSKKPGRLIKGRKSRPR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MEELVPDTPLRNQRADMSSIAAGSDAEHDDQGSSEFEETVATVPLYKHQLPTQTLFTPSTQQFTQKSTQPTQIIDRNPNHLLSPSAQNSSVVQVATSSPLAPKFTPSRPYKITRAGVLSNSMAPIGTQFRPPPMVKVPIKRPPAIDLDDEGPTYRGGSSDEDDIQFVGTTDIKRSTFAKNPKSPDKERILESPAAVNGAATRFKEITASAFYNPSANDNNRNVSGKRSADRMSSAPDYRSGSPKRSRQEDTFTLDDIEDYQTRIKVQRILNVLPGKSIQLILNTLVSKRGNYENALEHLASIEDYLPTDPISDDELSLDRHTPHVEPAKQQIKARTRIQDKWTSSQRLPTQKSGSDRDASAPRKRLIRGQRMRTSSPPSRASPAPARVSKKPGRLIKGRKSRPRSESPEIPIVEIDSSESDNHEDSEDDSILESKVLKFFNSCSVADLSDIAEIRENIANTIISKRPFKSLNAVRQITQEDDSIGKTSKDKSKKYAKKPIGDKVVDKCLDMWTGYEAVDALVSKCEALGKPVANEMKRWGVDIFGTKTQGELEITSLDTKNTSDGTHDSGIGTPSSGCSLSVDDDELKPNNNSRKKQQYIGQPAIMSESITMKNYQIVGINWLNLLFEQNLSCILADDMGLGKTCQVIAFLAHLFEKGVKGPHLVVVPSSTLENWLREFSVFCPKLNVMPYYANQKVRAEIRQQIEDTRDCINVVVTTYTIAKAKIDAAFLRSMDFCVCVYDEGHMLKSSKSVLYDKLIRIPAQFRLLLTGTPLQNNLQELASLLGFILPSVFRERKEDLEYIFSAKAKTVDDTHAALLSAQRIARAKSMLTPFVLRRKKHQVIDLPPKLTSVEYCEMNEAQKEIYTHEVETVRQLIADRAAGKKVGNKSANILMKLRQAAIHPLFYRRHYDDKTLSRIAKACIKDEKWAASDPDQIYLELCAYNDFEVHTLCEQNPTALSRFILKNDEWMHSGKVDKLCELLTRFKENGDRTLVFSQFTMVMDILEHVLQTLQMRFFRLDGSTSVEDRQSTLDAFHEQVDIPVFLLSTKAGGAGINLACANKVIIFDSSFNPQEDVQAENRAHRVGQTRAVEVVRLVTRDTIEEQMYALGQTKLALDQRVSGEDDGGAASARKSEEAGLKVVEEMVIAKLKEEKNDEAGEPPAAAAGGSEKVETAEIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.38
4 0.34
5 0.31
6 0.28
7 0.26
8 0.19
9 0.15
10 0.12
11 0.14
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.1
30 0.11
31 0.16
32 0.23
33 0.24
34 0.27
35 0.29
36 0.37
37 0.39
38 0.43
39 0.44
40 0.4
41 0.42
42 0.4
43 0.38
44 0.39
45 0.36
46 0.36
47 0.32
48 0.35
49 0.34
50 0.37
51 0.41
52 0.4
53 0.46
54 0.46
55 0.53
56 0.5
57 0.51
58 0.53
59 0.55
60 0.55
61 0.57
62 0.56
63 0.54
64 0.53
65 0.51
66 0.44
67 0.38
68 0.34
69 0.28
70 0.33
71 0.3
72 0.31
73 0.3
74 0.3
75 0.29
76 0.29
77 0.28
78 0.19
79 0.15
80 0.13
81 0.13
82 0.15
83 0.15
84 0.13
85 0.13
86 0.16
87 0.19
88 0.19
89 0.24
90 0.28
91 0.34
92 0.43
93 0.46
94 0.51
95 0.55
96 0.61
97 0.62
98 0.65
99 0.63
100 0.59
101 0.59
102 0.54
103 0.49
104 0.46
105 0.4
106 0.31
107 0.27
108 0.22
109 0.17
110 0.13
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.18
115 0.2
116 0.23
117 0.3
118 0.31
119 0.34
120 0.35
121 0.44
122 0.46
123 0.54
124 0.6
125 0.63
126 0.68
127 0.65
128 0.61
129 0.56
130 0.55
131 0.5
132 0.43
133 0.37
134 0.34
135 0.32
136 0.3
137 0.26
138 0.2
139 0.17
140 0.15
141 0.12
142 0.09
143 0.1
144 0.13
145 0.14
146 0.18
147 0.2
148 0.2
149 0.2
150 0.19
151 0.18
152 0.15
153 0.13
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.13
158 0.18
159 0.17
160 0.2
161 0.22
162 0.27
163 0.33
164 0.42
165 0.5
166 0.53
167 0.61
168 0.7
169 0.76
170 0.75
171 0.74
172 0.73
173 0.68
174 0.64
175 0.61
176 0.56
177 0.5
178 0.45
179 0.39
180 0.31
181 0.27
182 0.22
183 0.17
184 0.13
185 0.13
186 0.15
187 0.13
188 0.16
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.16
193 0.17
194 0.19
195 0.21
196 0.19
197 0.2
198 0.2
199 0.21
200 0.21
201 0.22
202 0.23
203 0.24
204 0.3
205 0.32
206 0.36
207 0.37
208 0.41
209 0.38
210 0.36
211 0.41
212 0.38
213 0.37
214 0.38
215 0.37
216 0.36
217 0.39
218 0.36
219 0.34
220 0.35
221 0.35
222 0.31
223 0.32
224 0.33
225 0.33
226 0.39
227 0.38
228 0.4
229 0.47
230 0.53
231 0.57
232 0.61
233 0.64
234 0.61
235 0.65
236 0.63
237 0.6
238 0.55
239 0.48
240 0.41
241 0.35
242 0.3
243 0.23
244 0.2
245 0.14
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.16
250 0.19
251 0.21
252 0.25
253 0.27
254 0.32
255 0.36
256 0.36
257 0.42
258 0.44
259 0.41
260 0.35
261 0.33
262 0.27
263 0.22
264 0.22
265 0.15
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.16
270 0.15
271 0.15
272 0.18
273 0.17
274 0.16
275 0.18
276 0.22
277 0.21
278 0.22
279 0.25
280 0.25
281 0.27
282 0.28
283 0.25
284 0.2
285 0.18
286 0.16
287 0.13
288 0.09
289 0.07
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.15
306 0.12
307 0.13
308 0.15
309 0.14
310 0.2
311 0.27
312 0.28
313 0.3
314 0.39
315 0.44
316 0.46
317 0.49
318 0.52
319 0.51
320 0.56
321 0.59
322 0.59
323 0.59
324 0.62
325 0.66
326 0.66
327 0.62
328 0.63
329 0.65
330 0.62
331 0.56
332 0.57
333 0.58
334 0.58
335 0.58
336 0.56
337 0.53
338 0.51
339 0.56
340 0.53
341 0.5
342 0.42
343 0.38
344 0.37
345 0.4
346 0.41
347 0.43
348 0.43
349 0.43
350 0.45
351 0.46
352 0.5
353 0.51
354 0.57
355 0.6
356 0.63
357 0.68
358 0.69
359 0.71
360 0.68
361 0.66
362 0.62
363 0.59
364 0.54
365 0.49
366 0.48
367 0.45
368 0.46
369 0.44
370 0.44
371 0.44
372 0.45
373 0.48
374 0.48
375 0.55
376 0.56
377 0.56
378 0.57
379 0.57
380 0.58
381 0.62
382 0.68
383 0.7
384 0.74
385 0.77
386 0.78
387 0.8
388 0.82
389 0.8
390 0.79
391 0.78
392 0.75
393 0.73
394 0.68
395 0.67
396 0.58
397 0.51
398 0.41
399 0.33
400 0.25
401 0.18
402 0.13
403 0.07
404 0.08
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.11
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.07
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.12
427 0.19
428 0.21
429 0.21
430 0.19
431 0.2
432 0.2
433 0.19
434 0.19
435 0.12
436 0.1
437 0.1
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.11
443 0.1
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.13
449 0.14
450 0.15
451 0.18
452 0.19
453 0.23
454 0.25
455 0.26
456 0.32
457 0.37
458 0.44
459 0.49
460 0.49
461 0.45
462 0.46
463 0.46
464 0.38
465 0.31
466 0.22
467 0.14
468 0.14
469 0.13
470 0.13
471 0.12
472 0.11
473 0.11
474 0.16
475 0.23
476 0.3
477 0.33
478 0.39
479 0.5
480 0.59
481 0.67
482 0.73
483 0.73
484 0.73
485 0.77
486 0.77
487 0.75
488 0.67
489 0.61
490 0.54
491 0.55
492 0.46
493 0.4
494 0.32
495 0.24
496 0.23
497 0.19
498 0.15
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.08
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.1
516 0.11
517 0.11
518 0.15
519 0.19
520 0.18
521 0.19
522 0.2
523 0.21
524 0.2
525 0.21
526 0.17
527 0.14
528 0.14
529 0.17
530 0.18
531 0.14
532 0.16
533 0.14
534 0.14
535 0.14
536 0.14
537 0.1
538 0.08
539 0.07
540 0.06
541 0.07
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.07
550 0.08
551 0.09
552 0.12
553 0.13
554 0.13
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.11
559 0.1
560 0.06
561 0.05
562 0.06
563 0.06
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.1
573 0.1
574 0.11
575 0.11
576 0.15
577 0.23
578 0.29
579 0.31
580 0.37
581 0.47
582 0.48
583 0.52
584 0.53
585 0.54
586 0.56
587 0.57
588 0.51
589 0.41
590 0.38
591 0.35
592 0.29
593 0.19
594 0.11
595 0.09
596 0.08
597 0.09
598 0.1
599 0.08
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.13
606 0.13
607 0.13
608 0.12
609 0.11
610 0.11
611 0.09
612 0.1
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.05
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.05
628 0.04
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.06
637 0.06
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.07
643 0.07
644 0.07
645 0.08
646 0.08
647 0.09
648 0.09
649 0.11
650 0.12
651 0.11
652 0.1
653 0.1
654 0.1
655 0.09
656 0.09
657 0.07
658 0.09
659 0.1
660 0.11
661 0.11
662 0.11
663 0.11
664 0.11
665 0.12
666 0.11
667 0.21
668 0.21
669 0.2
670 0.22
671 0.22
672 0.24
673 0.26
674 0.25
675 0.17
676 0.18
677 0.2
678 0.24
679 0.28
680 0.27
681 0.27
682 0.27
683 0.27
684 0.28
685 0.31
686 0.27
687 0.3
688 0.31
689 0.32
690 0.32
691 0.31
692 0.31
693 0.28
694 0.27
695 0.22
696 0.19
697 0.16
698 0.15
699 0.13
700 0.1
701 0.1
702 0.08
703 0.06
704 0.07
705 0.07
706 0.08
707 0.08
708 0.08
709 0.07
710 0.08
711 0.1
712 0.11
713 0.12
714 0.11
715 0.13
716 0.14
717 0.14
718 0.15
719 0.13
720 0.12
721 0.11
722 0.11
723 0.09
724 0.08
725 0.09
726 0.08
727 0.08
728 0.08
729 0.1
730 0.1
731 0.11
732 0.11
733 0.11
734 0.11
735 0.12
736 0.12
737 0.12
738 0.13
739 0.14
740 0.15
741 0.19
742 0.25
743 0.25
744 0.29
745 0.3
746 0.28
747 0.29
748 0.29
749 0.27
750 0.25
751 0.25
752 0.19
753 0.2
754 0.2
755 0.18
756 0.18
757 0.19
758 0.16
759 0.17
760 0.18
761 0.15
762 0.16
763 0.17
764 0.15
765 0.11
766 0.1
767 0.09
768 0.09
769 0.08
770 0.07
771 0.06
772 0.05
773 0.05
774 0.04
775 0.05
776 0.04
777 0.05
778 0.12
779 0.14
780 0.14
781 0.19
782 0.21
783 0.25
784 0.29
785 0.3
786 0.25
787 0.28
788 0.28
789 0.26
790 0.25
791 0.22
792 0.18
793 0.17
794 0.17
795 0.14
796 0.15
797 0.14
798 0.15
799 0.17
800 0.19
801 0.18
802 0.17
803 0.16
804 0.14
805 0.13
806 0.12
807 0.11
808 0.09
809 0.11
810 0.13
811 0.14
812 0.16
813 0.16
814 0.16
815 0.2
816 0.23
817 0.22
818 0.22
819 0.25
820 0.26
821 0.35
822 0.42
823 0.37
824 0.41
825 0.5
826 0.56
827 0.57
828 0.61
829 0.6
830 0.63
831 0.73
832 0.71
833 0.63
834 0.55
835 0.51
836 0.44
837 0.36
838 0.26
839 0.22
840 0.19
841 0.18
842 0.19
843 0.21
844 0.21
845 0.21
846 0.21
847 0.15
848 0.12
849 0.12
850 0.12
851 0.12
852 0.15
853 0.15
854 0.15
855 0.19
856 0.19
857 0.18
858 0.2
859 0.2
860 0.15
861 0.15
862 0.15
863 0.12
864 0.12
865 0.14
866 0.14
867 0.14
868 0.15
869 0.16
870 0.16
871 0.21
872 0.25
873 0.32
874 0.33
875 0.31
876 0.34
877 0.41
878 0.44
879 0.4
880 0.37
881 0.31
882 0.33
883 0.33
884 0.3
885 0.24
886 0.21
887 0.27
888 0.28
889 0.31
890 0.27
891 0.32
892 0.34
893 0.35
894 0.41
895 0.37
896 0.43
897 0.4
898 0.45
899 0.48
900 0.52
901 0.56
902 0.56
903 0.53
904 0.48
905 0.48
906 0.45
907 0.43
908 0.39
909 0.37
910 0.39
911 0.39
912 0.41
913 0.41
914 0.41
915 0.37
916 0.38
917 0.37
918 0.31
919 0.37
920 0.32
921 0.32
922 0.29
923 0.27
924 0.24
925 0.21
926 0.19
927 0.12
928 0.12
929 0.08
930 0.08
931 0.09
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.09
936 0.11
937 0.11
938 0.13
939 0.13
940 0.17
941 0.16
942 0.17
943 0.18
944 0.18
945 0.19
946 0.18
947 0.18
948 0.2
949 0.21
950 0.23
951 0.26
952 0.23
953 0.29
954 0.3
955 0.32
956 0.29
957 0.29
958 0.28
959 0.26
960 0.28
961 0.25
962 0.27
963 0.26
964 0.24
965 0.24
966 0.23
967 0.26
968 0.27
969 0.3
970 0.3
971 0.35
972 0.34
973 0.36
974 0.42
975 0.4
976 0.42
977 0.41
978 0.37
979 0.36
980 0.41
981 0.38
982 0.32
983 0.29
984 0.25
985 0.2
986 0.19
987 0.16
988 0.11
989 0.1
990 0.1
991 0.1
992 0.1
993 0.08
994 0.08
995 0.06
996 0.06
997 0.07
998 0.09
999 0.11
1000 0.14
1001 0.15
1002 0.18
1003 0.19
1004 0.19
1005 0.2
1006 0.19
1007 0.18
1008 0.16
1009 0.22
1010 0.23
1011 0.23
1012 0.25
1013 0.24
1014 0.23
1015 0.22
1016 0.23
1017 0.17
1018 0.15
1019 0.14
1020 0.15
1021 0.15
1022 0.16
1023 0.16
1024 0.15
1025 0.14
1026 0.15
1027 0.16
1028 0.14
1029 0.12
1030 0.11
1031 0.1
1032 0.08
1033 0.09
1034 0.08
1035 0.06
1036 0.06
1037 0.06
1038 0.06
1039 0.06
1040 0.06
1041 0.11
1042 0.11
1043 0.12
1044 0.12
1045 0.12
1046 0.12
1047 0.12
1048 0.13
1049 0.08
1050 0.09
1051 0.09
1052 0.11
1053 0.13
1054 0.15
1055 0.17
1056 0.22
1057 0.24
1058 0.24
1059 0.24
1060 0.22
1061 0.23
1062 0.22
1063 0.24
1064 0.21
1065 0.26
1066 0.26
1067 0.28
1068 0.3
1069 0.27
1070 0.26
1071 0.27
1072 0.31
1073 0.28
1074 0.35
1075 0.35
1076 0.35
1077 0.38
1078 0.38
1079 0.34
1080 0.28
1081 0.3
1082 0.24
1083 0.22
1084 0.21
1085 0.19
1086 0.19
1087 0.21
1088 0.23
1089 0.21
1090 0.2
1091 0.19
1092 0.18
1093 0.17
1094 0.17
1095 0.15
1096 0.15
1097 0.11
1098 0.1
1099 0.11
1100 0.11
1101 0.14
1102 0.17
1103 0.19
1104 0.17
1105 0.21
1106 0.24
1107 0.26
1108 0.28
1109 0.24
1110 0.22
1111 0.19
1112 0.19
1113 0.14
1114 0.12
1115 0.1
1116 0.08
1117 0.07
1118 0.1
1119 0.1
1120 0.1
1121 0.11
1122 0.15
1123 0.21
1124 0.23
1125 0.26
1126 0.24
1127 0.23
1128 0.23
1129 0.23
1130 0.18
1131 0.12
1132 0.1
1133 0.11
1134 0.14
1135 0.13
1136 0.14
1137 0.21
1138 0.24
1139 0.29
1140 0.34
1141 0.35
1142 0.36
1143 0.4
1144 0.4
1145 0.36
1146 0.36
1147 0.31
1148 0.25
1149 0.21
1150 0.16
1151 0.12
1152 0.11
1153 0.08
1154 0.08
1155 0.1
1156 0.1
1157 0.1
1158 0.1
1159 0.11