FuNGI

C5GYD7

Protein Details

Accession

C5GYD7

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-53	GPPMRIRRPKVDPLVRPKQKRTPRPQGQGQPGAG	Hydrophilic
527-546	GTDTSRKKPKSKHADAEPGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-78	PGRAPPGQPGPPMRIRRPKVDPLVRPKQKRTPRPQGQGQPGAGPVTNGRVGSPKPRPPQAAPRPAPAK
471-484	RAKKEKGKESDKNS
494-519	PSGRSKHTDPLNKKAASRAARKRPGS
531-574	SRKKPKSKHADAEPGSRPMSPGPSGHRKPGVPADQAGKKRSRNG

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSTPPNPPPPGRAPPGQPGPPMRIRRPKVDPLVRPKQKRTPRPQGQGQPGAGPVTNGRVGSPKPRPPQAAPRPAPAKPAIPSADDLTVNGFSGPLLSETYVDYPLITTKRAWREGLKHHVAKFASKKNIDPRDESSFTRPVRLQRRDPRASNTGPAVERDDQHPRRHGELNEAEREELEAKKAAREKERAENLAQIAPSASVTQKKTNAPKPRTQQVFKSEMTPAEIAKARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSGTYAMFVLQNDGKMRMVPLDRWYKFTTKTPFKTLTIEEAEKFMAKKAKDPRWVMEKEQDRAQKKALEDYARQSRLFTGRREGFSGVSEGFEGDDLDFEEDRFADDEEHVGILDDDEDAKVAEKRIKEDQLKANIFDLKDEHMYDQEENQEKKEKEALKNFGKHVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDESSDDSETERLKEEQQKLEEERAKKEKGKESDKNSGISSKGTNTPSGRSKHTDPLNKKAASRAARKRPGSPNLSDASGTDTSRKKPKSKHADAEPGSRPMSPGPSGHRKPGVPADQAGKKRSRNGPAGSGSGSDGERGIGSAAEMSDSTAAGAKKRKPNQPGVMSRTGTPRGSRAGSPAGLVPPRTGPGSGVNSPAPPTRTSTPGLSSSANLTFPTASEIHSAIPPTGIASAELLKIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDKLLRPGVLKEGSV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.6
3	0.66
4	0.63
5	0.61
6	0.57
7	0.59
8	0.62
9	0.64
10	0.65
11	0.67
12	0.67
13	0.7
14	0.74
15	0.76
16	0.77
17	0.79
18	0.79
19	0.78
20	0.85
21	0.85
22	0.86
23	0.85
24	0.84
25	0.85
26	0.87
27	0.87
28	0.87
29	0.88
30	0.89
31	0.91
32	0.9
33	0.89
34	0.87
35	0.77
36	0.68
37	0.59
38	0.51
39	0.41
40	0.32
41	0.23
42	0.2
43	0.21
44	0.18
45	0.17
46	0.2
47	0.22
48	0.31
49	0.39
50	0.44
51	0.49
52	0.57
53	0.63
54	0.65
55	0.74
56	0.75
57	0.77
58	0.71
59	0.73
60	0.71
61	0.66
62	0.65
63	0.57
64	0.51
65	0.42
66	0.46
67	0.38
68	0.35
69	0.36
70	0.33
71	0.33
72	0.28
73	0.26
74	0.22
75	0.2
76	0.18
77	0.15
78	0.12
79	0.08
80	0.08
81	0.09
82	0.07
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.1
87	0.13
88	0.13
89	0.12
90	0.11
91	0.11
92	0.15
93	0.16
94	0.16
95	0.17
96	0.24
97	0.33
98	0.37
99	0.4
100	0.42
101	0.49
102	0.57
103	0.64
104	0.65
105	0.63
106	0.6
107	0.63
108	0.57
109	0.57
110	0.56
111	0.55
112	0.55
113	0.51
114	0.56
115	0.6
116	0.68
117	0.64
118	0.6
119	0.57
120	0.57
121	0.57
122	0.54
123	0.49
124	0.48
125	0.44
126	0.45
127	0.43
128	0.43
129	0.51
130	0.56
131	0.6
132	0.63
133	0.72
134	0.75
135	0.76
136	0.74
137	0.71
138	0.66
139	0.6
140	0.53
141	0.48
142	0.4
143	0.38
144	0.36
145	0.31
146	0.3
147	0.3
148	0.37
149	0.37
150	0.42
151	0.48
152	0.45
153	0.48
154	0.53
155	0.49
156	0.48
157	0.51
158	0.51
159	0.5
160	0.48
161	0.43
162	0.37
163	0.37
164	0.3
165	0.22
166	0.18
167	0.16
168	0.15
169	0.2
170	0.25
171	0.29
172	0.34
173	0.39
174	0.42
175	0.48
176	0.55
177	0.53
178	0.49
179	0.48
180	0.43
181	0.4
182	0.34
183	0.25
184	0.18
185	0.15
186	0.14
187	0.11
188	0.11
189	0.14
190	0.17
191	0.22
192	0.26
193	0.33
194	0.41
195	0.49
196	0.58
197	0.59
198	0.64
199	0.67
200	0.72
201	0.73
202	0.68
203	0.67
204	0.64
205	0.63
206	0.55
207	0.51
208	0.44
209	0.36
210	0.35
211	0.29
212	0.21
213	0.19
214	0.21
215	0.19
216	0.22
217	0.23
218	0.21
219	0.22
220	0.23
221	0.2
222	0.21
223	0.25
224	0.23
225	0.24
226	0.24
227	0.24
228	0.23
229	0.22
230	0.19
231	0.15
232	0.16
233	0.15
234	0.14
235	0.13
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.14
240	0.11
241	0.1
242	0.09
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.08
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.07
256	0.07
257	0.09
258	0.1
259	0.12
260	0.12
261	0.11
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.19
267	0.28
268	0.29
269	0.33
270	0.35
271	0.35
272	0.36
273	0.41
274	0.44
275	0.43
276	0.47
277	0.48
278	0.49
279	0.48
280	0.49
281	0.43
282	0.39
283	0.34
284	0.32
285	0.26
286	0.23
287	0.22
288	0.2
289	0.19
290	0.16
291	0.16
292	0.15
293	0.21
294	0.29
295	0.37
296	0.44
297	0.47
298	0.49
299	0.52
300	0.55
301	0.51
302	0.5
303	0.47
304	0.41
305	0.45
306	0.47
307	0.41
308	0.41
309	0.4
310	0.36
311	0.31
312	0.34
313	0.32
314	0.3
315	0.29
316	0.33
317	0.39
318	0.37
319	0.37
320	0.32
321	0.3
322	0.33
323	0.35
324	0.3
325	0.3
326	0.32
327	0.33
328	0.35
329	0.33
330	0.26
331	0.23
332	0.23
333	0.15
334	0.11
335	0.1
336	0.08
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.04
367	0.05
368	0.06
369	0.1
370	0.1
371	0.13
372	0.18
373	0.25
374	0.27
375	0.33
376	0.38
377	0.44
378	0.44
379	0.42
380	0.39
381	0.35
382	0.32
383	0.27
384	0.21
385	0.14
386	0.14
387	0.14
388	0.12
389	0.11
390	0.13
391	0.12
392	0.13
393	0.17
394	0.21
395	0.21
396	0.22
397	0.29
398	0.28
399	0.29
400	0.35
401	0.35
402	0.36
403	0.43
404	0.49
405	0.48
406	0.53
407	0.54
408	0.56
409	0.54
410	0.5
411	0.48
412	0.48
413	0.49
414	0.53
415	0.61
416	0.63
417	0.67
418	0.71
419	0.73
420	0.68
421	0.66
422	0.58
423	0.51
424	0.46
425	0.39
426	0.36
427	0.3
428	0.27
429	0.22
430	0.21
431	0.19
432	0.14
433	0.13
434	0.11
435	0.09
436	0.1
437	0.11
438	0.14
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.13
447	0.17
448	0.25
449	0.29
450	0.33
451	0.35
452	0.39
453	0.39
454	0.46
455	0.47
456	0.42
457	0.44
458	0.44
459	0.46
460	0.47
461	0.52
462	0.52
463	0.55
464	0.62
465	0.63
466	0.64
467	0.69
468	0.66
469	0.61
470	0.54
471	0.48
472	0.38
473	0.32
474	0.27
475	0.2
476	0.23
477	0.23
478	0.26
479	0.25
480	0.29
481	0.34
482	0.36
483	0.37
484	0.37
485	0.39
486	0.43
487	0.5
488	0.54
489	0.53
490	0.59
491	0.63
492	0.6
493	0.56
494	0.53
495	0.53
496	0.5
497	0.55
498	0.56
499	0.58
500	0.65
501	0.67
502	0.71
503	0.72
504	0.73
505	0.69
506	0.61
507	0.56
508	0.49
509	0.48
510	0.39
511	0.3
512	0.28
513	0.24
514	0.22
515	0.22
516	0.23
517	0.27
518	0.36
519	0.42
520	0.43
521	0.5
522	0.6
523	0.66
524	0.72
525	0.77
526	0.77
527	0.81
528	0.77
529	0.77
530	0.7
531	0.62
532	0.53
533	0.44
534	0.36
535	0.27
536	0.28
537	0.21
538	0.21
539	0.25
540	0.34
541	0.37
542	0.42
543	0.45
544	0.41
545	0.44
546	0.5
547	0.49
548	0.41
549	0.41
550	0.42
551	0.45
552	0.49
553	0.5
554	0.48
555	0.46
556	0.52
557	0.57
558	0.58
559	0.58
560	0.58
561	0.6
562	0.56
563	0.55
564	0.47
565	0.4
566	0.33
567	0.27
568	0.23
569	0.16
570	0.12
571	0.1
572	0.09
573	0.08
574	0.08
575	0.05
576	0.05
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.09
586	0.1
587	0.14
588	0.21
589	0.28
590	0.38
591	0.46
592	0.54
593	0.59
594	0.69
595	0.74
596	0.78
597	0.79
598	0.77
599	0.77
600	0.7
601	0.64
602	0.61
603	0.55
604	0.47
605	0.4
606	0.35
607	0.32
608	0.34
609	0.33
610	0.31
611	0.32
612	0.3
613	0.29
614	0.28
615	0.28
616	0.27
617	0.27
618	0.24
619	0.21
620	0.22
621	0.22
622	0.2
623	0.17
624	0.21
625	0.27
626	0.27
627	0.29
628	0.28
629	0.28
630	0.3
631	0.33
632	0.28
633	0.23
634	0.27
635	0.27
636	0.3
637	0.32
638	0.33
639	0.33
640	0.34
641	0.36
642	0.31
643	0.28
644	0.28
645	0.28
646	0.25
647	0.21
648	0.19
649	0.16
650	0.15
651	0.18
652	0.15
653	0.14
654	0.15
655	0.16
656	0.16
657	0.18
658	0.19
659	0.15
660	0.15
661	0.13
662	0.12
663	0.12
664	0.11
665	0.09
666	0.1
667	0.11
668	0.13
669	0.14
670	0.13
671	0.14
672	0.18
673	0.19
674	0.2
675	0.22
676	0.25
677	0.33
678	0.4
679	0.45
680	0.46
681	0.56
682	0.65
683	0.64
684	0.63
685	0.55
686	0.49
687	0.44
688	0.48
689	0.46
690	0.4
691	0.39
692	0.38
693	0.39
694	0.38
695	0.37
696	0.3
697	0.24
698	0.22
699	0.21
700	0.21
701	0.24
702	0.27
703	0.32
704	0.34
705	0.33
706	0.34
707	0.35
708	0.4

C5GYD7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer