FuNGI

C5GAJ9

Protein Details

Accession

C5GAJ9

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-28	MGIHHKAEKKRKRASEKPDRPSKKPALA	Basic
62-88	SIPLTAYSRPRQNRQKHKTTTNTTLST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-25	KAEKKRKRASEKPDRPSKKP
477-485	ARRIARLRV
490-498	PKVSRGGRR

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, mito 7, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MGIHHKAEKKRKRASEKPDRPSKKPALAAPVVPAVKVQFVQNTNGAVPVIASTPGISSIPSSIPLTAYSRPRQNRQKHKTTTNTTLSTSEILLQSSAHPRIDFLGKEGENELDTLWNHYVAVYDPDAGKLELVEARKMTVRGCVRRVARKAINDGESDGDVVTKSNWAQRTALTEAFGTKQSRKAIQSIAENALLSNAPAGSGPTPAESALLSSIPKEHTSTSVSGSPQKSAQSEIQAAKPLPQPNLSATHPSQVYAIDTLVPNGLSTLRTMPVHEWQAAIGAGEPVLSSSRFVAHRVNHVVRSGDVTQLQLLRYIMILIELSRSLKPSRGAGSAAVAAGSKKLPPREDLRRILSSSSSSSSSAAATAAAVTNKQTHLPDSFLDALRRKFVPQRTFLSKTDITFLHTTICALSLHIPPEAGFAPNELATDPADLRDDLSLEYQTIQQYFRELGCKVEKPRESEFAKWGVRSKVEAGARRIARLRVPVEFPKVSRGGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.89
2	0.9
3	0.91
4	0.91
5	0.92
6	0.89
7	0.84
8	0.85
9	0.83
10	0.8
11	0.75
12	0.7
13	0.68
14	0.64
15	0.6
16	0.53
17	0.51
18	0.43
19	0.36
20	0.31
21	0.23
22	0.22
23	0.21
24	0.2
25	0.19
26	0.21
27	0.25
28	0.27
29	0.28
30	0.25
31	0.26
32	0.23
33	0.16
34	0.14
35	0.11
36	0.1
37	0.08
38	0.08
39	0.07
40	0.07
41	0.09
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.1
46	0.11
47	0.13
48	0.14
49	0.13
50	0.14
51	0.16
52	0.19
53	0.22
54	0.29
55	0.33
56	0.42
57	0.48
58	0.57
59	0.65
60	0.72
61	0.78
62	0.8
63	0.84
64	0.84
65	0.87
66	0.88
67	0.85
68	0.84
69	0.81
70	0.74
71	0.65
72	0.57
73	0.49
74	0.4
75	0.32
76	0.26
77	0.18
78	0.16
79	0.14
80	0.13
81	0.14
82	0.2
83	0.22
84	0.2
85	0.19
86	0.19
87	0.22
88	0.26
89	0.23
90	0.19
91	0.25
92	0.23
93	0.25
94	0.25
95	0.23
96	0.19
97	0.19
98	0.17
99	0.11
100	0.11
101	0.14
102	0.13
103	0.12
104	0.12
105	0.12
106	0.12
107	0.1
108	0.13
109	0.1
110	0.11
111	0.11
112	0.12
113	0.13
114	0.13
115	0.12
116	0.08
117	0.09
118	0.11
119	0.12
120	0.13
121	0.12
122	0.14
123	0.16
124	0.17
125	0.16
126	0.2
127	0.27
128	0.31
129	0.34
130	0.4
131	0.43
132	0.51
133	0.55
134	0.56
135	0.54
136	0.52
137	0.56
138	0.54
139	0.51
140	0.43
141	0.4
142	0.33
143	0.27
144	0.23
145	0.16
146	0.11
147	0.08
148	0.08
149	0.07
150	0.07
151	0.08
152	0.12
153	0.14
154	0.16
155	0.17
156	0.18
157	0.23
158	0.24
159	0.24
160	0.2
161	0.18
162	0.18
163	0.19
164	0.21
165	0.19
166	0.17
167	0.21
168	0.23
169	0.28
170	0.28
171	0.3
172	0.3
173	0.31
174	0.33
175	0.32
176	0.31
177	0.27
178	0.25
179	0.22
180	0.19
181	0.15
182	0.11
183	0.07
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.08
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.11
207	0.14
208	0.15
209	0.16
210	0.18
211	0.18
212	0.23
213	0.23
214	0.22
215	0.21
216	0.22
217	0.2
218	0.2
219	0.2
220	0.17
221	0.21
222	0.21
223	0.21
224	0.22
225	0.22
226	0.22
227	0.25
228	0.24
229	0.22
230	0.21
231	0.21
232	0.2
233	0.24
234	0.22
235	0.22
236	0.2
237	0.22
238	0.2
239	0.19
240	0.18
241	0.14
242	0.14
243	0.1
244	0.09
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.05
252	0.06
253	0.05
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.11
260	0.14
261	0.16
262	0.16
263	0.15
264	0.13
265	0.14
266	0.13
267	0.11
268	0.07
269	0.05
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.08
279	0.09
280	0.11
281	0.16
282	0.17
283	0.23
284	0.3
285	0.32
286	0.3
287	0.31
288	0.3
289	0.25
290	0.28
291	0.22
292	0.17
293	0.16
294	0.15
295	0.15
296	0.16
297	0.15
298	0.12
299	0.12
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.07
304	0.06
305	0.06
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.07
310	0.08
311	0.1
312	0.1
313	0.14
314	0.15
315	0.18
316	0.2
317	0.2
318	0.21
319	0.19
320	0.2
321	0.18
322	0.16
323	0.13
324	0.1
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.09
329	0.12
330	0.16
331	0.17
332	0.21
333	0.29
334	0.38
335	0.47
336	0.51
337	0.53
338	0.53
339	0.53
340	0.5
341	0.44
342	0.36
343	0.3
344	0.26
345	0.21
346	0.18
347	0.18
348	0.17
349	0.15
350	0.13
351	0.11
352	0.08
353	0.06
354	0.06
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.1
360	0.11
361	0.14
362	0.14
363	0.15
364	0.17
365	0.18
366	0.18
367	0.2
368	0.24
369	0.23
370	0.28
371	0.3
372	0.29
373	0.31
374	0.32
375	0.3
376	0.33
377	0.4
378	0.43
379	0.44
380	0.5
381	0.55
382	0.6
383	0.58
384	0.58
385	0.52
386	0.45
387	0.43
388	0.36
389	0.32
390	0.28
391	0.27
392	0.22
393	0.19
394	0.19
395	0.15
396	0.15
397	0.11
398	0.1
399	0.14
400	0.14
401	0.16
402	0.16
403	0.15
404	0.14
405	0.17
406	0.17
407	0.14
408	0.11
409	0.11
410	0.13
411	0.13
412	0.13
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.12
417	0.11
418	0.1
419	0.12
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.13
424	0.11
425	0.13
426	0.12
427	0.11
428	0.13
429	0.14
430	0.16
431	0.17
432	0.17
433	0.15
434	0.17
435	0.19
436	0.2
437	0.22
438	0.19
439	0.24
440	0.3
441	0.37
442	0.4
443	0.48
444	0.5
445	0.52
446	0.57
447	0.6
448	0.57
449	0.55
450	0.54
451	0.53
452	0.53
453	0.5
454	0.5
455	0.47
456	0.45
457	0.44
458	0.41
459	0.4
460	0.43
461	0.47
462	0.46
463	0.5
464	0.49
465	0.51
466	0.53
467	0.48
468	0.46
469	0.47
470	0.46
471	0.42
472	0.47
473	0.49
474	0.52
475	0.53
476	0.49
477	0.49
478	0.51

C5GAJ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer