Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GML2

Protein Details
Accession C5GML2    Localization Confidence High Confidence Score 25.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-120EEEEEERKRRKNKEGRREKKSRRRQESDDVFSGBasic
124-145IDGKRVRKRREGGEKRSSRKVVBasic
167-187MDEQLKKPTKRRARKADGIDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-112RHKRARNEEEEEERKRRKNKEGRREKKSRRRQ
126-143GKRVRKRREGGEKRSSRK
172-181KKPTKRRARK
414-428RMKARQAAATKASKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEPPAPAPESPLVDKEDDSPQNNTANASIADVDLSDDESLLSDVDDAQFEDFDAANVSIDERPAIAIDEENLKLIGRHKRARNEEEEEERKRRKNKEGRREKKSRRRQESDDVFSGREEIDGKRVRKRREGGEKRSSRKVVEEVNEEELDPATRRRRALDRMMDEQLKKPTKRRARKADGIDLADLADAEIEDVRRRMTDAARLDSIARKENRPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYITSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLLDALGRLPINKETLIASGIGRVIVFYTKSKRPEIGIKRQAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYEEADFDPSQLASRNQGVSAQATAAEARARELLPPRLANRARVEAGHTSYTIVPRSTTVQESRFARPLGSSGEDRFRRMKARQAAATKASKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.33
3 0.33
4 0.3
5 0.3
6 0.28
7 0.33
8 0.35
9 0.35
10 0.36
11 0.36
12 0.37
13 0.37
14 0.35
15 0.27
16 0.24
17 0.21
18 0.19
19 0.16
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.11
24 0.08
25 0.09
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.06
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.13
60 0.13
61 0.14
62 0.13
63 0.12
64 0.13
65 0.19
66 0.27
67 0.31
68 0.39
69 0.46
70 0.56
71 0.65
72 0.71
73 0.72
74 0.7
75 0.68
76 0.69
77 0.7
78 0.67
79 0.67
80 0.67
81 0.67
82 0.68
83 0.69
84 0.7
85 0.73
86 0.77
87 0.8
88 0.84
89 0.87
90 0.89
91 0.92
92 0.93
93 0.93
94 0.93
95 0.93
96 0.92
97 0.9
98 0.87
99 0.87
100 0.85
101 0.81
102 0.76
103 0.66
104 0.56
105 0.48
106 0.41
107 0.3
108 0.22
109 0.16
110 0.11
111 0.18
112 0.25
113 0.28
114 0.35
115 0.43
116 0.47
117 0.54
118 0.59
119 0.61
120 0.65
121 0.73
122 0.74
123 0.78
124 0.81
125 0.78
126 0.81
127 0.73
128 0.63
129 0.56
130 0.5
131 0.46
132 0.41
133 0.41
134 0.34
135 0.36
136 0.35
137 0.31
138 0.27
139 0.2
140 0.17
141 0.13
142 0.15
143 0.17
144 0.2
145 0.21
146 0.25
147 0.31
148 0.36
149 0.44
150 0.49
151 0.48
152 0.5
153 0.53
154 0.53
155 0.48
156 0.45
157 0.45
158 0.43
159 0.4
160 0.42
161 0.48
162 0.54
163 0.63
164 0.7
165 0.72
166 0.74
167 0.81
168 0.81
169 0.79
170 0.73
171 0.64
172 0.54
173 0.43
174 0.34
175 0.25
176 0.18
177 0.09
178 0.05
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.09
189 0.09
190 0.16
191 0.18
192 0.21
193 0.21
194 0.21
195 0.22
196 0.22
197 0.23
198 0.23
199 0.21
200 0.2
201 0.22
202 0.27
203 0.3
204 0.31
205 0.37
206 0.36
207 0.41
208 0.42
209 0.42
210 0.42
211 0.41
212 0.38
213 0.31
214 0.25
215 0.21
216 0.19
217 0.18
218 0.14
219 0.11
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.04
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.12
254 0.11
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.1
274 0.11
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.11
287 0.16
288 0.22
289 0.26
290 0.29
291 0.3
292 0.32
293 0.41
294 0.47
295 0.52
296 0.56
297 0.58
298 0.59
299 0.61
300 0.59
301 0.51
302 0.43
303 0.34
304 0.33
305 0.28
306 0.25
307 0.23
308 0.22
309 0.25
310 0.25
311 0.24
312 0.19
313 0.21
314 0.24
315 0.3
316 0.37
317 0.37
318 0.39
319 0.4
320 0.39
321 0.39
322 0.36
323 0.3
324 0.23
325 0.25
326 0.24
327 0.27
328 0.26
329 0.24
330 0.24
331 0.22
332 0.21
333 0.19
334 0.17
335 0.14
336 0.18
337 0.19
338 0.18
339 0.2
340 0.2
341 0.19
342 0.19
343 0.15
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.09
350 0.1
351 0.12
352 0.12
353 0.16
354 0.21
355 0.27
356 0.31
357 0.36
358 0.36
359 0.44
360 0.46
361 0.48
362 0.48
363 0.48
364 0.44
365 0.4
366 0.43
367 0.38
368 0.4
369 0.36
370 0.3
371 0.26
372 0.27
373 0.3
374 0.28
375 0.23
376 0.2
377 0.19
378 0.24
379 0.25
380 0.28
381 0.31
382 0.31
383 0.37
384 0.41
385 0.45
386 0.46
387 0.43
388 0.38
389 0.33
390 0.33
391 0.32
392 0.32
393 0.29
394 0.28
395 0.38
396 0.39
397 0.42
398 0.44
399 0.43
400 0.47
401 0.48
402 0.53
403 0.53
404 0.59
405 0.64
406 0.66
407 0.68
408 0.68