Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GKJ0

Protein Details
Accession C5GKJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MAKTRPSNKSSKKRVKSGLGANRSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-21NKSSKKRVKSGLGA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 10.5, cyto_nucl 8.833, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MAKTRPSNKSSKKRVKSGLGANRSAPRKMIEDPAIFFDQATVLLQTGQPEAALPLAQRGLDIASTGSSNVLLGLNLIGEIYVELGEIDAAREHFMRAVALDPNGEISESEGGGAEKFLWLAQLNEAGGKDSVNWFEKGVATLRRNIQSLEQSSKTDDALAAQEKKKKLAHALCGVVEIYMTDLSWEEDAEARCESLVTEALLVAPDSPECLQTLASVRISQLRHDDARAALSRSLELWKDLPPESPLVPDFPTRISLSRLLMEAQMEIEALEVLERMALEDDHSVEMWYLGGWCLYLLGKGEKLPPNKSDLSESELRQATLRSSRSWLKQSLKLYELVEYEDVKLKEHAEELVQDLQTQLGDVSDSDDGEDVGGEWEDESDGSDDDDDNVQGEDHKMTDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.88
3 0.86
4 0.85
5 0.85
6 0.81
7 0.75
8 0.7
9 0.69
10 0.64
11 0.56
12 0.48
13 0.4
14 0.36
15 0.36
16 0.4
17 0.39
18 0.39
19 0.39
20 0.43
21 0.42
22 0.38
23 0.34
24 0.26
25 0.19
26 0.16
27 0.15
28 0.1
29 0.08
30 0.09
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.1
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.03
66 0.03
67 0.04
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.15
124 0.16
125 0.18
126 0.21
127 0.2
128 0.25
129 0.29
130 0.31
131 0.31
132 0.3
133 0.3
134 0.29
135 0.32
136 0.32
137 0.29
138 0.27
139 0.28
140 0.28
141 0.25
142 0.19
143 0.15
144 0.1
145 0.12
146 0.15
147 0.18
148 0.21
149 0.26
150 0.27
151 0.31
152 0.32
153 0.31
154 0.35
155 0.36
156 0.39
157 0.39
158 0.41
159 0.36
160 0.35
161 0.33
162 0.24
163 0.18
164 0.11
165 0.07
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.17
209 0.19
210 0.2
211 0.2
212 0.21
213 0.16
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.15
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.16
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.12
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.15
230 0.17
231 0.16
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.13
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.18
244 0.18
245 0.18
246 0.18
247 0.16
248 0.16
249 0.15
250 0.12
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.07
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.19
289 0.24
290 0.29
291 0.33
292 0.32
293 0.37
294 0.39
295 0.39
296 0.37
297 0.32
298 0.34
299 0.35
300 0.35
301 0.36
302 0.34
303 0.33
304 0.29
305 0.28
306 0.26
307 0.28
308 0.29
309 0.24
310 0.28
311 0.34
312 0.4
313 0.45
314 0.49
315 0.48
316 0.53
317 0.56
318 0.57
319 0.52
320 0.5
321 0.44
322 0.4
323 0.34
324 0.3
325 0.26
326 0.21
327 0.21
328 0.24
329 0.23
330 0.22
331 0.22
332 0.21
333 0.2
334 0.2
335 0.19
336 0.15
337 0.16
338 0.18
339 0.22
340 0.2
341 0.19
342 0.18
343 0.17
344 0.15
345 0.14
346 0.1
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.13
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.13
380 0.12