Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GNU2

Protein Details
Accession C5GNU2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
457-476LEKERERETKRGMKKATRKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-115RRRAK
425-476KSEERKLQAEKAKKEERDRLLRGMSAEEQRKFLEKERERETKRGMKKATRKG
Subcellular Location(s) cyto 10, cyto_nucl 9, mito 7, nucl 6, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MSGLLQNLLKGDVNAPSSAPSSGDDADFADFAAGIPEPPPPQPVLTATGAAGTPLTATQEAIPASGNARPYTAWYRVWERHSRQDFMQEAFVIPFIAVLLLLHVWGMGKNRRRAKKWAQAHLPILQSEFAVVGYGGVGGARRAPSADDVQAEGLAKAAAAASASSGDELVVPASMLKEMSGTEFATYATGRQNVAFMDVSIKLFRWYNPLYMLGDFAVSMFFDSWPVPVERVECTAYSFDGKEKDLVPAPSAVEKELIEQRTKGAANNSSYDGFVFAVVHKNCMRKLREDRYDISLTFTRDNPKLPQWATVMSESAEITETMLTADLIKAVEEAGEDFEYLIITDQPLDKPTKLDETTPGKRINLSLRLPKSGSYATTMPIFTYFLRLTDRVVSAAHFRAEVVRKLRNTRDEETRKLRRAYEEEKSEERKLQAEKAKKEERDRLLRGMSAEEQRKFLEKERERETKRGMKKATRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.18
4 0.19
5 0.18
6 0.18
7 0.14
8 0.16
9 0.17
10 0.17
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.14
15 0.13
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.08
20 0.07
21 0.06
22 0.07
23 0.1
24 0.12
25 0.13
26 0.16
27 0.16
28 0.17
29 0.19
30 0.22
31 0.23
32 0.23
33 0.23
34 0.21
35 0.2
36 0.19
37 0.16
38 0.14
39 0.08
40 0.07
41 0.06
42 0.09
43 0.07
44 0.08
45 0.09
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.11
51 0.12
52 0.14
53 0.16
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.18
58 0.24
59 0.26
60 0.27
61 0.3
62 0.37
63 0.43
64 0.5
65 0.54
66 0.54
67 0.61
68 0.63
69 0.62
70 0.55
71 0.58
72 0.54
73 0.46
74 0.43
75 0.33
76 0.28
77 0.25
78 0.24
79 0.15
80 0.12
81 0.09
82 0.06
83 0.05
84 0.04
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.06
93 0.11
94 0.18
95 0.25
96 0.34
97 0.44
98 0.52
99 0.57
100 0.65
101 0.71
102 0.74
103 0.76
104 0.78
105 0.77
106 0.75
107 0.74
108 0.7
109 0.61
110 0.51
111 0.43
112 0.33
113 0.24
114 0.17
115 0.14
116 0.08
117 0.06
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.03
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.11
132 0.14
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.15
139 0.12
140 0.09
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.11
180 0.1
181 0.13
182 0.11
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.15
193 0.15
194 0.16
195 0.17
196 0.19
197 0.19
198 0.18
199 0.18
200 0.12
201 0.1
202 0.09
203 0.07
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.11
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.12
243 0.15
244 0.17
245 0.15
246 0.15
247 0.16
248 0.18
249 0.19
250 0.18
251 0.17
252 0.2
253 0.21
254 0.23
255 0.23
256 0.2
257 0.2
258 0.18
259 0.15
260 0.11
261 0.09
262 0.07
263 0.06
264 0.13
265 0.13
266 0.17
267 0.19
268 0.21
269 0.24
270 0.31
271 0.32
272 0.33
273 0.43
274 0.49
275 0.54
276 0.57
277 0.56
278 0.55
279 0.56
280 0.47
281 0.42
282 0.36
283 0.3
284 0.28
285 0.27
286 0.26
287 0.24
288 0.27
289 0.26
290 0.27
291 0.31
292 0.3
293 0.32
294 0.29
295 0.29
296 0.29
297 0.26
298 0.23
299 0.17
300 0.17
301 0.13
302 0.11
303 0.1
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.04
331 0.06
332 0.07
333 0.08
334 0.11
335 0.14
336 0.14
337 0.16
338 0.18
339 0.24
340 0.24
341 0.25
342 0.3
343 0.36
344 0.41
345 0.45
346 0.46
347 0.39
348 0.39
349 0.41
350 0.4
351 0.39
352 0.39
353 0.43
354 0.43
355 0.47
356 0.46
357 0.44
358 0.41
359 0.35
360 0.3
361 0.25
362 0.23
363 0.21
364 0.23
365 0.22
366 0.18
367 0.17
368 0.17
369 0.13
370 0.17
371 0.16
372 0.15
373 0.19
374 0.19
375 0.2
376 0.23
377 0.24
378 0.19
379 0.2
380 0.19
381 0.2
382 0.22
383 0.21
384 0.16
385 0.15
386 0.21
387 0.26
388 0.3
389 0.31
390 0.36
391 0.4
392 0.47
393 0.55
394 0.56
395 0.59
396 0.58
397 0.64
398 0.64
399 0.69
400 0.72
401 0.74
402 0.73
403 0.7
404 0.69
405 0.66
406 0.66
407 0.65
408 0.64
409 0.62
410 0.61
411 0.64
412 0.66
413 0.62
414 0.58
415 0.53
416 0.49
417 0.45
418 0.48
419 0.49
420 0.53
421 0.57
422 0.61
423 0.69
424 0.7
425 0.75
426 0.76
427 0.77
428 0.77
429 0.75
430 0.72
431 0.66
432 0.61
433 0.54
434 0.49
435 0.45
436 0.44
437 0.47
438 0.41
439 0.41
440 0.4
441 0.44
442 0.42
443 0.44
444 0.47
445 0.47
446 0.54
447 0.6
448 0.69
449 0.69
450 0.74
451 0.76
452 0.74
453 0.76
454 0.77
455 0.77
456 0.77