Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GB10

Protein Details
Accession C5GB10    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-210LPTSSSSSPRPRKKCNCQATLHHydrophilic
488-511GDQSSSRGERRQRQTWRRVQDDDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MPLNPPLKSWALPRLSALLPGLDEDSLTQLLEYTFSLGAEQGAEHLRNILGDSARALEFIVAFGERWRRSGGKAGKIGEMEMGMGEGRGGAQREGRKQPPSASGPLISEYLPNVRSKAARVSGGARRQQQQQQQQQQQGQSSSSPSHNRPSTSTSSTSTISTTATTTTSNIADLTAAIAQLELTTNPSLPTSSSSSPRPRKKCNCQATLHPLFTPAPNCLNCGKIICALEGLQPCSFCQQPLLSAGQVQEMIRELRAERGSEKMRAHNNGKGAARRGELYDETPVGSSSSSSSSHGAGGGGGGATDGPTTTATSSNSSRSSDTTTHRDLAAAKAHRDKLLRFQAQNARRTKVVDEVAEFETPDVHAASTLWMSAGQRALALKRQQKVLREMEERGKEEWERRGGSVVVSLSFEGGGRGKRGLQRGVLRRVEERVEEQAEGEEEEEEEEEVVEEEEEEKGEGKGGFGDNPLLAGGGLVRPVWKGKGVDGDQSSSRGERRQRQTWRRVQDDDEDNERWILDGGLYGYGREGREIEGGGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.35
3 0.35
4 0.31
5 0.23
6 0.19
7 0.19
8 0.18
9 0.13
10 0.12
11 0.1
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.08
29 0.12
30 0.13
31 0.12
32 0.14
33 0.13
34 0.13
35 0.14
36 0.16
37 0.13
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.07
49 0.08
50 0.11
51 0.2
52 0.19
53 0.21
54 0.25
55 0.26
56 0.28
57 0.38
58 0.43
59 0.43
60 0.49
61 0.5
62 0.49
63 0.48
64 0.46
65 0.37
66 0.28
67 0.19
68 0.13
69 0.11
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.14
79 0.21
80 0.28
81 0.36
82 0.42
83 0.45
84 0.46
85 0.5
86 0.52
87 0.52
88 0.49
89 0.44
90 0.4
91 0.36
92 0.35
93 0.32
94 0.24
95 0.19
96 0.16
97 0.17
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.18
102 0.19
103 0.2
104 0.26
105 0.26
106 0.26
107 0.27
108 0.32
109 0.37
110 0.44
111 0.48
112 0.46
113 0.46
114 0.51
115 0.57
116 0.6
117 0.62
118 0.65
119 0.69
120 0.71
121 0.75
122 0.72
123 0.69
124 0.63
125 0.55
126 0.46
127 0.36
128 0.31
129 0.27
130 0.27
131 0.29
132 0.28
133 0.35
134 0.37
135 0.38
136 0.38
137 0.41
138 0.42
139 0.41
140 0.41
141 0.35
142 0.35
143 0.34
144 0.32
145 0.26
146 0.21
147 0.16
148 0.14
149 0.12
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.04
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.11
178 0.14
179 0.16
180 0.19
181 0.26
182 0.35
183 0.45
184 0.54
185 0.58
186 0.64
187 0.72
188 0.79
189 0.84
190 0.83
191 0.82
192 0.76
193 0.76
194 0.75
195 0.71
196 0.61
197 0.51
198 0.43
199 0.36
200 0.34
201 0.27
202 0.19
203 0.18
204 0.17
205 0.2
206 0.19
207 0.19
208 0.18
209 0.18
210 0.17
211 0.15
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.15
223 0.14
224 0.1
225 0.11
226 0.09
227 0.1
228 0.12
229 0.13
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.09
237 0.08
238 0.09
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.12
246 0.18
247 0.2
248 0.24
249 0.26
250 0.27
251 0.3
252 0.35
253 0.37
254 0.34
255 0.34
256 0.34
257 0.35
258 0.31
259 0.3
260 0.26
261 0.24
262 0.22
263 0.21
264 0.18
265 0.17
266 0.15
267 0.14
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.08
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.08
277 0.08
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.02
291 0.02
292 0.02
293 0.02
294 0.03
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.07
299 0.08
300 0.11
301 0.13
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.18
307 0.22
308 0.23
309 0.26
310 0.29
311 0.3
312 0.3
313 0.29
314 0.29
315 0.25
316 0.24
317 0.27
318 0.23
319 0.24
320 0.28
321 0.3
322 0.32
323 0.33
324 0.31
325 0.33
326 0.4
327 0.43
328 0.38
329 0.44
330 0.5
331 0.54
332 0.61
333 0.56
334 0.48
335 0.43
336 0.45
337 0.39
338 0.36
339 0.32
340 0.26
341 0.23
342 0.25
343 0.26
344 0.24
345 0.22
346 0.16
347 0.13
348 0.11
349 0.11
350 0.07
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.1
365 0.12
366 0.17
367 0.24
368 0.28
369 0.31
370 0.39
371 0.41
372 0.46
373 0.52
374 0.52
375 0.53
376 0.51
377 0.51
378 0.52
379 0.54
380 0.51
381 0.45
382 0.41
383 0.37
384 0.37
385 0.4
386 0.37
387 0.34
388 0.32
389 0.33
390 0.3
391 0.28
392 0.27
393 0.21
394 0.15
395 0.14
396 0.13
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.08
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.12
405 0.16
406 0.21
407 0.26
408 0.29
409 0.33
410 0.41
411 0.48
412 0.56
413 0.56
414 0.54
415 0.51
416 0.51
417 0.48
418 0.41
419 0.36
420 0.32
421 0.3
422 0.28
423 0.26
424 0.23
425 0.21
426 0.19
427 0.16
428 0.1
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.1
447 0.1
448 0.09
449 0.12
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.16
454 0.13
455 0.13
456 0.13
457 0.1
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.08
466 0.11
467 0.13
468 0.17
469 0.17
470 0.2
471 0.29
472 0.31
473 0.37
474 0.37
475 0.4
476 0.36
477 0.38
478 0.36
479 0.3
480 0.3
481 0.3
482 0.37
483 0.43
484 0.5
485 0.58
486 0.68
487 0.75
488 0.83
489 0.86
490 0.87
491 0.85
492 0.81
493 0.75
494 0.73
495 0.71
496 0.66
497 0.62
498 0.54
499 0.48
500 0.43
501 0.38
502 0.29
503 0.22
504 0.16
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.13
509 0.13
510 0.12
511 0.13
512 0.17
513 0.17
514 0.17
515 0.17
516 0.15
517 0.18