FuNGI

C5G7Q6

Protein Details

Accession

C5G7Q6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
420-443	EAEYKRQLKQKRQQKKDGRRDAHG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
425-452	RQLKQKRQQKKDGRRDAHGPGKSRRDRP
505-529	RHSRGGRGRGRGRGSDRGGRGRGRG

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MVEMPSTDQLMSGDIKDPPAKRPCLDMASNGPELGGEPAADEGSDFYNTPLNAGTPVYTAQTCRAEDNTSVVPPTPPKPAPAIPGLSFLYKNESATESQAAGSAVQQTSSLDKPSEPDTPQELDNRVPNSEDVEMGSPTPVVQQREEEQQGQNHTVTEESKNDAPTVSEANHDPVPPTQNGASGESPGRANHTGGAEIGPDNSENPEWEMDSSPYESSSSDSSSDDSDDDDDDDDDDDSSGDYDLLDPEEQARILMAAEGGSDDEGDGKNKGGHVRTANEKPEEIVPKPDITVTPDMKVEVLGNVETIVENVVLIKANISGEYQVLESGSVLCLADLSVIGMVSETLGRVEQPLYTVRFPNEESIKEAKLEKGTPVFYVVDHSTFVFTQPLKGLKGSDASNFHDEEVGEEEIEFSDDEAEAEYKRQLKQKRQQKKDGRRDAHGPGKSRRDRPGPSGLGNYQVNYDDISTEDGYTPLSRPKNFHEMIGNREAPIEESQPRNQFAERHSRGGRGRGRGRGSDRGGRGRGRGGSYQKQGDDRQPPQQQQHQPEQPQRGQQETPQYAHPPQSSEFRPPQTFYQAQNPYQQQPSPYNPPSYPPYQPPQQNQPAQMYNTNQAFFPSGFPPAQQQFPFQLLHQPQSVSPYPPPGSHINPAFFRNLQQQQHSSQSQPPEQAQQSLQGAHSAEASATQSSVDTFAAAQAQLDLLRRLSRGGS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.2
3	0.26
4	0.28
5	0.34
6	0.41
7	0.45
8	0.42
9	0.47
10	0.5
11	0.51
12	0.51
13	0.48
14	0.47
15	0.48
16	0.48
17	0.41
18	0.34
19	0.27
20	0.26
21	0.22
22	0.15
23	0.08
24	0.08
25	0.09
26	0.09
27	0.09
28	0.08
29	0.07
30	0.09
31	0.1
32	0.1
33	0.1
34	0.15
35	0.15
36	0.16
37	0.15
38	0.14
39	0.14
40	0.14
41	0.14
42	0.11
43	0.12
44	0.14
45	0.15
46	0.15
47	0.2
48	0.24
49	0.25
50	0.26
51	0.28
52	0.28
53	0.28
54	0.31
55	0.29
56	0.25
57	0.25
58	0.23
59	0.23
60	0.24
61	0.27
62	0.3
63	0.28
64	0.29
65	0.34
66	0.37
67	0.38
68	0.39
69	0.42
70	0.34
71	0.38
72	0.37
73	0.33
74	0.3
75	0.26
76	0.28
77	0.24
78	0.23
79	0.21
80	0.22
81	0.21
82	0.23
83	0.25
84	0.18
85	0.17
86	0.18
87	0.16
88	0.14
89	0.13
90	0.15
91	0.13
92	0.12
93	0.13
94	0.12
95	0.16
96	0.17
97	0.19
98	0.15
99	0.15
100	0.17
101	0.21
102	0.26
103	0.24
104	0.26
105	0.28
106	0.3
107	0.32
108	0.34
109	0.32
110	0.29
111	0.34
112	0.32
113	0.28
114	0.27
115	0.25
116	0.24
117	0.22
118	0.19
119	0.15
120	0.15
121	0.15
122	0.14
123	0.14
124	0.1
125	0.09
126	0.14
127	0.17
128	0.17
129	0.18
130	0.21
131	0.24
132	0.32
133	0.36
134	0.34
135	0.34
136	0.35
137	0.38
138	0.37
139	0.35
140	0.27
141	0.24
142	0.22
143	0.2
144	0.2
145	0.18
146	0.19
147	0.21
148	0.21
149	0.21
150	0.2
151	0.19
152	0.17
153	0.18
154	0.15
155	0.15
156	0.15
157	0.18
158	0.19
159	0.19
160	0.18
161	0.18
162	0.21
163	0.2
164	0.21
165	0.18
166	0.2
167	0.22
168	0.25
169	0.22
170	0.2
171	0.21
172	0.19
173	0.2
174	0.17
175	0.19
176	0.17
177	0.17
178	0.17
179	0.17
180	0.16
181	0.16
182	0.16
183	0.12
184	0.11
185	0.11
186	0.08
187	0.07
188	0.07
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.12
196	0.13
197	0.12
198	0.13
199	0.14
200	0.13
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.11
205	0.12
206	0.12
207	0.11
208	0.12
209	0.12
210	0.12
211	0.13
212	0.11
213	0.11
214	0.1
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.04
244	0.03
245	0.03
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.1
258	0.13
259	0.13
260	0.17
261	0.19
262	0.22
263	0.28
264	0.33
265	0.36
266	0.34
267	0.33
268	0.3
269	0.32
270	0.32
271	0.27
272	0.25
273	0.22
274	0.21
275	0.22
276	0.21
277	0.17
278	0.17
279	0.22
280	0.19
281	0.19
282	0.18
283	0.18
284	0.17
285	0.17
286	0.14
287	0.08
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.06
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.02
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.06
340	0.08
341	0.11
342	0.12
343	0.14
344	0.14
345	0.15
346	0.16
347	0.19
348	0.19
349	0.17
350	0.2
351	0.21
352	0.21
353	0.21
354	0.21
355	0.18
356	0.18
357	0.18
358	0.15
359	0.15
360	0.15
361	0.14
362	0.16
363	0.14
364	0.12
365	0.14
366	0.13
367	0.11
368	0.11
369	0.11
370	0.1
371	0.09
372	0.1
373	0.1
374	0.09
375	0.1
376	0.11
377	0.13
378	0.13
379	0.14
380	0.14
381	0.12
382	0.15
383	0.15
384	0.16
385	0.17
386	0.19
387	0.21
388	0.21
389	0.2
390	0.18
391	0.17
392	0.14
393	0.14
394	0.12
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.08
399	0.08
400	0.07
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.06
409	0.09
410	0.11
411	0.15
412	0.22
413	0.28
414	0.38
415	0.47
416	0.57
417	0.65
418	0.71
419	0.79
420	0.83
421	0.87
422	0.88
423	0.9
424	0.84
425	0.77
426	0.74
427	0.7
428	0.68
429	0.61
430	0.55
431	0.51
432	0.57
433	0.59
434	0.59
435	0.59
436	0.58
437	0.58
438	0.58
439	0.61
440	0.54
441	0.49
442	0.48
443	0.42
444	0.4
445	0.36
446	0.31
447	0.22
448	0.19
449	0.17
450	0.13
451	0.13
452	0.07
453	0.08
454	0.1
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.1
460	0.1
461	0.11
462	0.15
463	0.19
464	0.2
465	0.23
466	0.28
467	0.37
468	0.36
469	0.37
470	0.39
471	0.37
472	0.41
473	0.46
474	0.41
475	0.32
476	0.32
477	0.3
478	0.23
479	0.22
480	0.2
481	0.17
482	0.2
483	0.26
484	0.29
485	0.31
486	0.3
487	0.3
488	0.3
489	0.3
490	0.38
491	0.36
492	0.39
493	0.38
494	0.43
495	0.44
496	0.5
497	0.52
498	0.5
499	0.53
500	0.53
501	0.56
502	0.56
503	0.59
504	0.59
505	0.57
506	0.56
507	0.54
508	0.54
509	0.55
510	0.5
511	0.47
512	0.43
513	0.42
514	0.38
515	0.39
516	0.39
517	0.43
518	0.46
519	0.49
520	0.46
521	0.47
522	0.47
523	0.48
524	0.5
525	0.46
526	0.5
527	0.53
528	0.56
529	0.58
530	0.64
531	0.64
532	0.62
533	0.68
534	0.67
535	0.67
536	0.7
537	0.71
538	0.66
539	0.65
540	0.62
541	0.57
542	0.5
543	0.46
544	0.49
545	0.45
546	0.43
547	0.39
548	0.4
549	0.38
550	0.43
551	0.4
552	0.32
553	0.3
554	0.35
555	0.34
556	0.38
557	0.42
558	0.43
559	0.45
560	0.44
561	0.46
562	0.47
563	0.49
564	0.44
565	0.48
566	0.48
567	0.47
568	0.53
569	0.53
570	0.49
571	0.49
572	0.47
573	0.42
574	0.41
575	0.45
576	0.47
577	0.47
578	0.47
579	0.44
580	0.47
581	0.48
582	0.46
583	0.45
584	0.41
585	0.44
586	0.47
587	0.54
588	0.56
589	0.61
590	0.65
591	0.65
592	0.63
593	0.63
594	0.6
595	0.56
596	0.54
597	0.48
598	0.45
599	0.43
600	0.4
601	0.33
602	0.29
603	0.29
604	0.24
605	0.24
606	0.18
607	0.18
608	0.18
609	0.19
610	0.25
611	0.25
612	0.31
613	0.29
614	0.31
615	0.3
616	0.33
617	0.34
618	0.27
619	0.33
620	0.31
621	0.33
622	0.32
623	0.3
624	0.28
625	0.33
626	0.36
627	0.3
628	0.29
629	0.33
630	0.33
631	0.33
632	0.36
633	0.35
634	0.37
635	0.41
636	0.44
637	0.41
638	0.42
639	0.44
640	0.44
641	0.39
642	0.38
643	0.4
644	0.43
645	0.44
646	0.47
647	0.49
648	0.49
649	0.56
650	0.56
651	0.5
652	0.47
653	0.49
654	0.48
655	0.48
656	0.46
657	0.47
658	0.46
659	0.47
660	0.42
661	0.41
662	0.38
663	0.36
664	0.33
665	0.27
666	0.26
667	0.22
668	0.22
669	0.16
670	0.13
671	0.12
672	0.14
673	0.11
674	0.1
675	0.1
676	0.09
677	0.1
678	0.11
679	0.1
680	0.08
681	0.08
682	0.09
683	0.11
684	0.11
685	0.11
686	0.09
687	0.1
688	0.12
689	0.14
690	0.14
691	0.15
692	0.18
693	0.18

C5G7Q6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer