Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GSA8

Protein Details
Accession C5GSA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-100ATRKPAVPTRPARKNRKFSDLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-94ATRKPAVPTRPARKNR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MAAAKEAVSFDEIIQAARTRRKKQALTDKFFEAKRRSSAPGSGPGSGSGAGALANRVSVVPGSLASRVGIGKRSAAPVATRKPAVPTRPARKNRKFSDLITQNSGQTTITDRGPGFSKGSVSGPCVVLGSNFAPGTTAADIVSALEPVGGAILGCRIVSTHPEVTAEMTFEEGSGAESVVARFNNQKADGRILHVRIKPGLQPPPQIPAETNTGRLRHHRSQPTFDSLREQADRERREQRRADPQVQDGRYGFDDRSQQQQHAGVGRGSRDQRGGSGSGRDRSMGNGRDTGLYSDQMVIDEPSHDSHYHGRRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.19
3 0.23
4 0.31
5 0.4
6 0.41
7 0.51
8 0.6
9 0.64
10 0.71
11 0.77
12 0.79
13 0.79
14 0.77
15 0.74
16 0.7
17 0.66
18 0.64
19 0.58
20 0.53
21 0.51
22 0.5
23 0.49
24 0.47
25 0.5
26 0.47
27 0.5
28 0.47
29 0.43
30 0.39
31 0.35
32 0.32
33 0.27
34 0.21
35 0.12
36 0.09
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.06
45 0.05
46 0.06
47 0.05
48 0.06
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.14
57 0.14
58 0.16
59 0.18
60 0.2
61 0.19
62 0.19
63 0.22
64 0.26
65 0.31
66 0.32
67 0.31
68 0.3
69 0.35
70 0.4
71 0.4
72 0.42
73 0.46
74 0.51
75 0.61
76 0.7
77 0.75
78 0.79
79 0.85
80 0.81
81 0.8
82 0.75
83 0.66
84 0.68
85 0.64
86 0.57
87 0.52
88 0.48
89 0.4
90 0.36
91 0.34
92 0.23
93 0.16
94 0.17
95 0.14
96 0.13
97 0.15
98 0.15
99 0.16
100 0.18
101 0.19
102 0.16
103 0.15
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.11
114 0.09
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.04
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.05
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.09
170 0.11
171 0.14
172 0.16
173 0.19
174 0.18
175 0.24
176 0.23
177 0.25
178 0.27
179 0.27
180 0.32
181 0.31
182 0.31
183 0.27
184 0.28
185 0.28
186 0.3
187 0.35
188 0.32
189 0.34
190 0.33
191 0.38
192 0.37
193 0.34
194 0.28
195 0.23
196 0.27
197 0.24
198 0.28
199 0.25
200 0.27
201 0.28
202 0.33
203 0.39
204 0.4
205 0.49
206 0.54
207 0.55
208 0.61
209 0.63
210 0.65
211 0.59
212 0.52
213 0.48
214 0.4
215 0.4
216 0.34
217 0.31
218 0.3
219 0.37
220 0.39
221 0.4
222 0.48
223 0.49
224 0.56
225 0.6
226 0.6
227 0.63
228 0.68
229 0.69
230 0.64
231 0.66
232 0.67
233 0.62
234 0.58
235 0.47
236 0.42
237 0.36
238 0.34
239 0.26
240 0.21
241 0.27
242 0.25
243 0.35
244 0.34
245 0.33
246 0.34
247 0.37
248 0.36
249 0.34
250 0.34
251 0.26
252 0.26
253 0.27
254 0.3
255 0.3
256 0.29
257 0.28
258 0.26
259 0.26
260 0.28
261 0.28
262 0.24
263 0.3
264 0.33
265 0.34
266 0.34
267 0.33
268 0.3
269 0.32
270 0.38
271 0.35
272 0.33
273 0.32
274 0.33
275 0.34
276 0.35
277 0.34
278 0.28
279 0.23
280 0.21
281 0.2
282 0.19
283 0.17
284 0.16
285 0.14
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.14
290 0.17
291 0.17
292 0.18
293 0.26
294 0.33