Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GDF2

Protein Details
Accession C5GDF2    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-159VDTTGGKKKRKRAPHDPNAPKRALBasic
287-310SPEPVREPTPPRTKRRRTTGGAAAHydrophilic
364-384AATETPKGKGGKKKRKSEAGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-156GKKKRKRAPHDPNAPK
298-304RTKRRRT
321-380ASTKKASPEKKMRGAAAKRDKEREEAAAALTGSGKLKRGAVAAAATETPKGKGGKKKRKS
Subcellular Location(s) cyto 18.5, cyto_nucl 13.333, nucl 7, mito_nucl 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSRKDDKAKDSTAIVTVNIDDFTRTRDSAFLDSIARTIRPISVACDELIAAATDPINNTALTYIQVIVSLATLQSAVSDLSRAYINHANTVLNRGPSTLDLGGITSSLLENGLLSGARVLSPGGGIAGVARGPGGVDTTGGKKKRKRAPHDPNAPKRALTPYFLYMQHNRATIAEELGENARPKEVADEGTKRWAEMPDHEKQIWKKLYAENLAVYQEKMRAYKAGLPIPEDGYATGAAVNANVAAAMQLQQGVHHAAAGEEEASSEGSEQESEEEEEEEEEEEESSPEPVREPTPPRTKRRRTTGGAAAADVKPATPLSASTKKASPEKKMRGAAAKRDKEREEAAAALTGSGKLKRGAVAAAATETPKGKGGKKKRKSEAGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.24
3 0.2
4 0.18
5 0.16
6 0.14
7 0.12
8 0.12
9 0.16
10 0.19
11 0.18
12 0.18
13 0.2
14 0.23
15 0.26
16 0.27
17 0.24
18 0.22
19 0.22
20 0.23
21 0.23
22 0.19
23 0.16
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.16
28 0.19
29 0.2
30 0.22
31 0.21
32 0.2
33 0.18
34 0.16
35 0.16
36 0.11
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.08
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.04
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.05
67 0.07
68 0.09
69 0.09
70 0.13
71 0.18
72 0.19
73 0.21
74 0.22
75 0.22
76 0.21
77 0.27
78 0.25
79 0.21
80 0.21
81 0.18
82 0.18
83 0.17
84 0.21
85 0.15
86 0.13
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.06
125 0.11
126 0.17
127 0.22
128 0.28
129 0.33
130 0.42
131 0.5
132 0.59
133 0.64
134 0.7
135 0.76
136 0.81
137 0.87
138 0.88
139 0.89
140 0.85
141 0.76
142 0.65
143 0.56
144 0.52
145 0.42
146 0.34
147 0.27
148 0.23
149 0.26
150 0.27
151 0.28
152 0.25
153 0.26
154 0.26
155 0.24
156 0.22
157 0.19
158 0.2
159 0.16
160 0.14
161 0.11
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.13
175 0.16
176 0.17
177 0.23
178 0.23
179 0.21
180 0.22
181 0.21
182 0.18
183 0.21
184 0.25
185 0.24
186 0.28
187 0.28
188 0.31
189 0.3
190 0.37
191 0.34
192 0.3
193 0.29
194 0.28
195 0.34
196 0.32
197 0.33
198 0.25
199 0.23
200 0.23
201 0.2
202 0.18
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.18
211 0.21
212 0.22
213 0.22
214 0.23
215 0.24
216 0.24
217 0.23
218 0.18
219 0.13
220 0.11
221 0.1
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.02
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.12
279 0.18
280 0.24
281 0.32
282 0.43
283 0.51
284 0.6
285 0.7
286 0.78
287 0.81
288 0.86
289 0.85
290 0.81
291 0.81
292 0.79
293 0.77
294 0.67
295 0.59
296 0.52
297 0.43
298 0.37
299 0.29
300 0.2
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.07
305 0.09
306 0.17
307 0.25
308 0.27
309 0.3
310 0.33
311 0.38
312 0.46
313 0.51
314 0.53
315 0.56
316 0.62
317 0.68
318 0.7
319 0.7
320 0.72
321 0.72
322 0.73
323 0.73
324 0.73
325 0.71
326 0.73
327 0.7
328 0.65
329 0.61
330 0.55
331 0.47
332 0.39
333 0.33
334 0.28
335 0.26
336 0.21
337 0.18
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.16
342 0.15
343 0.16
344 0.18
345 0.19
346 0.18
347 0.19
348 0.19
349 0.18
350 0.18
351 0.18
352 0.17
353 0.18
354 0.17
355 0.16
356 0.19
357 0.22
358 0.28
359 0.37
360 0.48
361 0.57
362 0.67
363 0.76
364 0.81