Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GDM4

Protein Details
Accession C5GDM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
231-252DHNDGRRRKGGGRRKKEDHDDFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-246RRRKGGGRRKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MTDPDNSYRPRSPDFSGFPGSLQLPPSPYGQTPYPINSPLAHRASYDASPFFSPQAHQPQPQLQRPTHQQYIPQPLDSNYPPHIMPPQTRSRAAAALQQQPMEWHAAPKSPPPESQPTKMRGSVPSQASGGIEVRTKFPVARIKRIMQADEDVGKVAQVTPIAVSKALELFMISLVTKAAQEARARSSKRVTAAHLKEAISKDEVLDFLADIISKVPDHPANSKKDDDGSDHNDGRRRKGGGRRKKEDHDDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.5
3 0.49
4 0.45
5 0.4
6 0.38
7 0.35
8 0.28
9 0.25
10 0.21
11 0.19
12 0.2
13 0.22
14 0.21
15 0.2
16 0.23
17 0.22
18 0.25
19 0.26
20 0.28
21 0.3
22 0.29
23 0.3
24 0.28
25 0.31
26 0.35
27 0.34
28 0.31
29 0.28
30 0.28
31 0.3
32 0.3
33 0.28
34 0.21
35 0.2
36 0.21
37 0.21
38 0.2
39 0.17
40 0.16
41 0.2
42 0.29
43 0.31
44 0.32
45 0.35
46 0.42
47 0.5
48 0.56
49 0.55
50 0.46
51 0.49
52 0.55
53 0.59
54 0.56
55 0.49
56 0.47
57 0.49
58 0.58
59 0.52
60 0.46
61 0.39
62 0.34
63 0.38
64 0.33
65 0.3
66 0.21
67 0.21
68 0.2
69 0.2
70 0.23
71 0.21
72 0.23
73 0.26
74 0.33
75 0.35
76 0.36
77 0.37
78 0.34
79 0.34
80 0.31
81 0.3
82 0.27
83 0.3
84 0.3
85 0.28
86 0.26
87 0.24
88 0.24
89 0.22
90 0.16
91 0.11
92 0.11
93 0.13
94 0.14
95 0.18
96 0.21
97 0.2
98 0.21
99 0.24
100 0.32
101 0.34
102 0.39
103 0.41
104 0.42
105 0.43
106 0.44
107 0.41
108 0.35
109 0.35
110 0.35
111 0.3
112 0.27
113 0.24
114 0.22
115 0.2
116 0.18
117 0.15
118 0.09
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.1
125 0.14
126 0.22
127 0.24
128 0.31
129 0.35
130 0.36
131 0.42
132 0.43
133 0.4
134 0.33
135 0.31
136 0.25
137 0.21
138 0.19
139 0.14
140 0.12
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.1
168 0.13
169 0.15
170 0.21
171 0.28
172 0.3
173 0.33
174 0.36
175 0.36
176 0.4
177 0.4
178 0.4
179 0.43
180 0.45
181 0.48
182 0.47
183 0.43
184 0.43
185 0.42
186 0.39
187 0.31
188 0.27
189 0.21
190 0.18
191 0.18
192 0.13
193 0.12
194 0.09
195 0.07
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.12
204 0.15
205 0.18
206 0.26
207 0.33
208 0.39
209 0.44
210 0.46
211 0.43
212 0.45
213 0.44
214 0.41
215 0.42
216 0.41
217 0.44
218 0.46
219 0.48
220 0.5
221 0.5
222 0.52
223 0.51
224 0.48
225 0.48
226 0.55
227 0.62
228 0.67
229 0.75
230 0.78
231 0.81
232 0.86