Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GMG9

Protein Details
Accession C5GMG9    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-56LSAPEPPSKKALRKAKKKGAAAQTTEHydrophilic
288-314EESQSKAKAKNKKPTTKRVWVNRIMGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-49PSKKALRKAKKKG
293-305KAKAKNKKPTTKR
386-387KK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPGIKEASPSGSPPASRKRKLDEGPALEIDLSAPEPPSKKALRKAKKKGAAAQTTEQSTTPPATKPKSPEPADKPSKRSSYGVWIGNLPFNVKKDDVRVFFTSSGSLKNEEITRIHLPEGIKQNGKPQNKGFAYVDFTTQKAMEAAIAMSEQLISGRRALVKNANNFVGRPDKPKDEAAGNKTSNSTVHAPSKRVFVGNLGFDVTKEILEEHFKPCGVIESIQVATFQDTGKCKGYAWVEFESIDAAEAAMRGFVHVPEEEEDDDDHDDDDDEKNTDSSNEVGGSRGEESQSKAKAKNKKPTTKRVWVNRIMGRPLRMEFAEDKATRYKKRFGKDGTSKDKFATESGGEEQVRHNGIEPPAIEEVSEKNTKSFQKSRAGKGQGNFKKGGPARGGRYTQDVVQRLSGAIVESQGKKTTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.48
3 0.54
4 0.58
5 0.61
6 0.68
7 0.71
8 0.75
9 0.74
10 0.69
11 0.68
12 0.63
13 0.55
14 0.45
15 0.39
16 0.29
17 0.2
18 0.15
19 0.09
20 0.1
21 0.12
22 0.14
23 0.17
24 0.24
25 0.29
26 0.36
27 0.45
28 0.55
29 0.63
30 0.72
31 0.81
32 0.85
33 0.87
34 0.86
35 0.86
36 0.85
37 0.83
38 0.78
39 0.73
40 0.68
41 0.61
42 0.55
43 0.46
44 0.36
45 0.3
46 0.27
47 0.23
48 0.23
49 0.27
50 0.31
51 0.37
52 0.42
53 0.49
54 0.56
55 0.59
56 0.64
57 0.64
58 0.71
59 0.76
60 0.76
61 0.72
62 0.71
63 0.71
64 0.65
65 0.6
66 0.52
67 0.51
68 0.51
69 0.49
70 0.42
71 0.39
72 0.37
73 0.37
74 0.34
75 0.27
76 0.23
77 0.21
78 0.23
79 0.21
80 0.22
81 0.25
82 0.32
83 0.32
84 0.35
85 0.36
86 0.35
87 0.35
88 0.34
89 0.3
90 0.24
91 0.25
92 0.21
93 0.2
94 0.17
95 0.19
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.21
100 0.23
101 0.22
102 0.22
103 0.22
104 0.22
105 0.26
106 0.33
107 0.33
108 0.32
109 0.31
110 0.4
111 0.46
112 0.49
113 0.48
114 0.43
115 0.48
116 0.46
117 0.5
118 0.41
119 0.36
120 0.37
121 0.32
122 0.33
123 0.24
124 0.24
125 0.21
126 0.2
127 0.17
128 0.12
129 0.11
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.09
144 0.12
145 0.13
146 0.15
147 0.23
148 0.27
149 0.32
150 0.34
151 0.35
152 0.32
153 0.32
154 0.32
155 0.32
156 0.28
157 0.28
158 0.29
159 0.3
160 0.32
161 0.33
162 0.32
163 0.3
164 0.34
165 0.34
166 0.38
167 0.35
168 0.33
169 0.32
170 0.31
171 0.25
172 0.23
173 0.21
174 0.16
175 0.24
176 0.26
177 0.28
178 0.28
179 0.31
180 0.29
181 0.26
182 0.23
183 0.17
184 0.17
185 0.16
186 0.15
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.1
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.09
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.13
218 0.15
219 0.16
220 0.15
221 0.18
222 0.21
223 0.2
224 0.23
225 0.22
226 0.2
227 0.2
228 0.2
229 0.16
230 0.13
231 0.11
232 0.06
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.06
243 0.06
244 0.08
245 0.08
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.1
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.14
277 0.19
278 0.25
279 0.27
280 0.32
281 0.38
282 0.48
283 0.55
284 0.63
285 0.67
286 0.72
287 0.77
288 0.83
289 0.85
290 0.85
291 0.85
292 0.85
293 0.84
294 0.81
295 0.81
296 0.76
297 0.72
298 0.68
299 0.62
300 0.54
301 0.48
302 0.41
303 0.36
304 0.29
305 0.28
306 0.23
307 0.24
308 0.3
309 0.27
310 0.29
311 0.34
312 0.4
313 0.43
314 0.46
315 0.52
316 0.5
317 0.57
318 0.63
319 0.62
320 0.66
321 0.7
322 0.76
323 0.77
324 0.75
325 0.7
326 0.62
327 0.58
328 0.48
329 0.38
330 0.33
331 0.23
332 0.21
333 0.22
334 0.27
335 0.24
336 0.24
337 0.25
338 0.25
339 0.25
340 0.22
341 0.21
342 0.2
343 0.21
344 0.25
345 0.23
346 0.22
347 0.23
348 0.22
349 0.2
350 0.16
351 0.18
352 0.2
353 0.24
354 0.2
355 0.2
356 0.26
357 0.32
358 0.39
359 0.44
360 0.46
361 0.53
362 0.6
363 0.67
364 0.71
365 0.73
366 0.71
367 0.68
368 0.72
369 0.69
370 0.67
371 0.6
372 0.51
373 0.54
374 0.51
375 0.53
376 0.49
377 0.49
378 0.5
379 0.56
380 0.59
381 0.51
382 0.54
383 0.49
384 0.47
385 0.48
386 0.45
387 0.39
388 0.38
389 0.37
390 0.3
391 0.28
392 0.24
393 0.17
394 0.14
395 0.14
396 0.18
397 0.2
398 0.23
399 0.27