FuNGI

A0A094BVJ9

Protein Details

Accession

A0A094BVJ9

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
428-447	MKKRLGKSLRKSLRKREKNY	Basic
535-560	ETSGNESTRKKHKKKHMLSSSQPTGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
424-445	KEKEMKKRLGKSLRKSLRKREK
485-487	KEK
517-521	HKKHN
543-549	RKKHKKK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPAGITPNGTPTPNSSGQPPKIIRRAKPDPFATYKKPVVRPQAAPRSRQQNQNGLTALNKPPPAPRPLPRYPGNNRAATAGPSASNAPPQPQLDFTRKSNVGEYEDFALTTTKRAMREGLRYHIARFASKKNVDPTNSDDFIKPVSLHRRDPRQPPAGKIAKDEDTVMGEPIDDKEREKQEIARAAKEAQRAADLAQIAPSGNNASALAAKKVQSFKNEKTTQVHRTAQTEEEMKESDLRYEEALPWHLEDAENKHTWVGNYEAALSDTNVIFVIDGTNFRMVPIEKWYKFTPKNQFKTLTIEEAEAEMNKKSKANRWVMHADQQNQEAAERQRGIQAMAGLYSKVKGERPMPKSEARDHDDLDITDDLFQDDDEQATFEPDNDEETKLATEKIKREQLGANLFGDADEQEVEEEFKEEAKEKEMKKRLGKSLRKSLRKREKNYSYESDSSNPYSSSSGDETTDDEKQAEEDRKKDEEAKLKEKEKLGMPKIASGASTKGTTTPIGRPRSTDPHKKHNHLKRAGSPNLSASETSGNESTRKKHKKKHMLSSSQPTGTSTPRSGSPHPSSSAPAGGVSPRKSSIVKLHVNSSRLSDIQANAPHPAMSDSEMSDGAGGKRKSGIKLRLGSSASPSRAGSPTNGSRAGSPAQAQGMTSISLSPTSQIPFRPTSPPKPRSGSPASARVTNGSAGSASPARPIMADEIAAAIPAEGIAIGMLLKIFSGRIKGNGKDKEDREKFIKLVKENSVFSQEDKLLRPRAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.31
3	0.33
4	0.33
5	0.34
6	0.41
7	0.44
8	0.53
9	0.54
10	0.55
11	0.61
12	0.68
13	0.67
14	0.67
15	0.74
16	0.73
17	0.76
18	0.73
19	0.72
20	0.72
21	0.73
22	0.7
23	0.68
24	0.68
25	0.67
26	0.7
27	0.7
28	0.72
29	0.72
30	0.73
31	0.75
32	0.79
33	0.75
34	0.72
35	0.72
36	0.73
37	0.71
38	0.72
39	0.68
40	0.66
41	0.64
42	0.66
43	0.59
44	0.49
45	0.45
46	0.42
47	0.4
48	0.36
49	0.34
50	0.29
51	0.35
52	0.39
53	0.45
54	0.47
55	0.5
56	0.53
57	0.6
58	0.66
59	0.66
60	0.7
61	0.7
62	0.73
63	0.71
64	0.66
65	0.59
66	0.54
67	0.49
68	0.42
69	0.37
70	0.28
71	0.21
72	0.19
73	0.21
74	0.19
75	0.22
76	0.21
77	0.21
78	0.25
79	0.26
80	0.26
81	0.29
82	0.33
83	0.36
84	0.4
85	0.4
86	0.44
87	0.44
88	0.44
89	0.44
90	0.42
91	0.4
92	0.37
93	0.36
94	0.31
95	0.29
96	0.27
97	0.23
98	0.21
99	0.16
100	0.16
101	0.19
102	0.19
103	0.2
104	0.21
105	0.26
106	0.3
107	0.39
108	0.42
109	0.44
110	0.47
111	0.47
112	0.47
113	0.47
114	0.43
115	0.38
116	0.38
117	0.38
118	0.4
119	0.43
120	0.47
121	0.49
122	0.54
123	0.52
124	0.51
125	0.5
126	0.49
127	0.47
128	0.43
129	0.37
130	0.31
131	0.29
132	0.27
133	0.22
134	0.21
135	0.29
136	0.32
137	0.4
138	0.47
139	0.56
140	0.62
141	0.69
142	0.72
143	0.71
144	0.7
145	0.66
146	0.69
147	0.66
148	0.6
149	0.56
150	0.51
151	0.45
152	0.42
153	0.38
154	0.29
155	0.25
156	0.24
157	0.21
158	0.15
159	0.12
160	0.12
161	0.13
162	0.15
163	0.12
164	0.14
165	0.21
166	0.25
167	0.28
168	0.29
169	0.31
170	0.35
171	0.43
172	0.44
173	0.39
174	0.37
175	0.37
176	0.39
177	0.38
178	0.33
179	0.25
180	0.23
181	0.21
182	0.2
183	0.19
184	0.16
185	0.13
186	0.12
187	0.12
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.08
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.1
197	0.12
198	0.13
199	0.14
200	0.15
201	0.19
202	0.24
203	0.27
204	0.31
205	0.38
206	0.41
207	0.5
208	0.52
209	0.51
210	0.52
211	0.56
212	0.55
213	0.56
214	0.55
215	0.47
216	0.47
217	0.46
218	0.41
219	0.37
220	0.34
221	0.27
222	0.23
223	0.22
224	0.19
225	0.2
226	0.19
227	0.17
228	0.15
229	0.15
230	0.14
231	0.15
232	0.16
233	0.15
234	0.17
235	0.15
236	0.15
237	0.14
238	0.13
239	0.12
240	0.13
241	0.16
242	0.19
243	0.19
244	0.19
245	0.19
246	0.2
247	0.19
248	0.19
249	0.17
250	0.13
251	0.13
252	0.13
253	0.12
254	0.12
255	0.12
256	0.1
257	0.09
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.06
265	0.05
266	0.06
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.1
272	0.1
273	0.11
274	0.18
275	0.25
276	0.25
277	0.29
278	0.31
279	0.38
280	0.41
281	0.48
282	0.52
283	0.53
284	0.58
285	0.6
286	0.62
287	0.55
288	0.58
289	0.52
290	0.44
291	0.35
292	0.29
293	0.24
294	0.21
295	0.19
296	0.13
297	0.12
298	0.09
299	0.1
300	0.1
301	0.12
302	0.13
303	0.2
304	0.28
305	0.36
306	0.38
307	0.42
308	0.48
309	0.48
310	0.53
311	0.51
312	0.46
313	0.39
314	0.38
315	0.32
316	0.26
317	0.24
318	0.21
319	0.17
320	0.17
321	0.16
322	0.15
323	0.17
324	0.17
325	0.17
326	0.14
327	0.14
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.1
338	0.17
339	0.26
340	0.3
341	0.36
342	0.39
343	0.43
344	0.46
345	0.48
346	0.49
347	0.44
348	0.42
349	0.37
350	0.34
351	0.3
352	0.26
353	0.23
354	0.16
355	0.12
356	0.11
357	0.1
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.08
373	0.09
374	0.1
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.1
380	0.11
381	0.14
382	0.17
383	0.23
384	0.27
385	0.27
386	0.29
387	0.31
388	0.33
389	0.33
390	0.31
391	0.25
392	0.2
393	0.19
394	0.17
395	0.14
396	0.09
397	0.06
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.08
409	0.09
410	0.12
411	0.19
412	0.2
413	0.3
414	0.37
415	0.43
416	0.48
417	0.55
418	0.6
419	0.65
420	0.71
421	0.69
422	0.72
423	0.75
424	0.78
425	0.77
426	0.79
427	0.79
428	0.81
429	0.8
430	0.79
431	0.8
432	0.76
433	0.77
434	0.71
435	0.66
436	0.59
437	0.54
438	0.46
439	0.38
440	0.35
441	0.28
442	0.23
443	0.18
444	0.16
445	0.14
446	0.15
447	0.14
448	0.13
449	0.12
450	0.13
451	0.14
452	0.16
453	0.16
454	0.14
455	0.12
456	0.11
457	0.12
458	0.16
459	0.21
460	0.21
461	0.23
462	0.27
463	0.29
464	0.3
465	0.34
466	0.36
467	0.38
468	0.42
469	0.48
470	0.51
471	0.52
472	0.56
473	0.52
474	0.5
475	0.47
476	0.49
477	0.44
478	0.42
479	0.39
480	0.37
481	0.36
482	0.33
483	0.27
484	0.19
485	0.17
486	0.14
487	0.14
488	0.11
489	0.11
490	0.12
491	0.13
492	0.14
493	0.2
494	0.27
495	0.32
496	0.32
497	0.34
498	0.38
499	0.47
500	0.53
501	0.56
502	0.54
503	0.59
504	0.67
505	0.71
506	0.76
507	0.76
508	0.78
509	0.76
510	0.76
511	0.75
512	0.76
513	0.73
514	0.66
515	0.58
516	0.5
517	0.45
518	0.39
519	0.3
520	0.22
521	0.2
522	0.17
523	0.18
524	0.17
525	0.15
526	0.18
527	0.21
528	0.26
529	0.33
530	0.44
531	0.5
532	0.58
533	0.68
534	0.76
535	0.83
536	0.88
537	0.88
538	0.87
539	0.86
540	0.86
541	0.82
542	0.72
543	0.62
544	0.53
545	0.44
546	0.38
547	0.34
548	0.26
549	0.21
550	0.24
551	0.29
552	0.3
553	0.36
554	0.39
555	0.39
556	0.4
557	0.39
558	0.37
559	0.34
560	0.33
561	0.24
562	0.19
563	0.15
564	0.17
565	0.21
566	0.21
567	0.21
568	0.21
569	0.23
570	0.23
571	0.26
572	0.31
573	0.34
574	0.39
575	0.39
576	0.46
577	0.48
578	0.49
579	0.46
580	0.41
581	0.35
582	0.28
583	0.28
584	0.23
585	0.2
586	0.25
587	0.28
588	0.26
589	0.24
590	0.24
591	0.22
592	0.2
593	0.19
594	0.14
595	0.13
596	0.13
597	0.12
598	0.13
599	0.13
600	0.13
601	0.12
602	0.12
603	0.12
604	0.18
605	0.18
606	0.17
607	0.22
608	0.26
609	0.31
610	0.39
611	0.44
612	0.45
613	0.52
614	0.53
615	0.55
616	0.54
617	0.49
618	0.47
619	0.46
620	0.39
621	0.35
622	0.33
623	0.29
624	0.29
625	0.29
626	0.25
627	0.26
628	0.3
629	0.33
630	0.34
631	0.31
632	0.3
633	0.33
634	0.32
635	0.26
636	0.22
637	0.2
638	0.2
639	0.2
640	0.19
641	0.17
642	0.16
643	0.14
644	0.12
645	0.1
646	0.09
647	0.1
648	0.1
649	0.1
650	0.11
651	0.13
652	0.15
653	0.17
654	0.22
655	0.26
656	0.29
657	0.37
658	0.42
659	0.51
660	0.59
661	0.63
662	0.65
663	0.67
664	0.67
665	0.66
666	0.66
667	0.64
668	0.6
669	0.63
670	0.58
671	0.55
672	0.53
673	0.47
674	0.41
675	0.33
676	0.27
677	0.19
678	0.17
679	0.13
680	0.16
681	0.16
682	0.14
683	0.15
684	0.15
685	0.15
686	0.15
687	0.16
688	0.16
689	0.15
690	0.15
691	0.13
692	0.14
693	0.13
694	0.13
695	0.11
696	0.07
697	0.06
698	0.05
699	0.05
700	0.03
701	0.03
702	0.03
703	0.03
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.04
709	0.04
710	0.05
711	0.07
712	0.11
713	0.13
714	0.21
715	0.28
716	0.34
717	0.43
718	0.51
719	0.56
720	0.61
721	0.65
722	0.68
723	0.68
724	0.68
725	0.64
726	0.61
727	0.57
728	0.55
729	0.58
730	0.52
731	0.54
732	0.56
733	0.57
734	0.53
735	0.54
736	0.53
737	0.46
738	0.43
739	0.42
740	0.38
741	0.36
742	0.39
743	0.42

A0A094BVJ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer