FuNGI

C5GSS7

Protein Details

Accession

C5GSS7

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
352-376	SSTSNSSTSKKKSKKQTGSQSKFTA	Hydrophilic
446-474	LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
451-467	GKGFTKEKNKKKRGSYR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MALSKDVKKSSKTASTTSVKKSVASKPNNGKGVKEKSTSFSRKAALSPALLDAVNDFLNAYGFNKTSKAFAVEQKENESITKAKIRTTGKTTTKTPFLVEIFEDWERNHKAQRSEEKEENSVDTDESDSSDSDSDASSSESSDSDVAMESAHSSSSSSSSSESDSSDEDAEKAPVAQLNNLKRKHHGNSSSSSSDSGSDRARPQAKRTKLATKKSTLKAAAKLSSTSESSFESSSGSGSDSDSNSDSGSNSDSNSDSDSDSDSGSDSSSTSESVKSKKKPVSKSTDVAAAQIPLPESGENDSSDSSSSSSSSSSDSSDNDGSSGLRRSTESSATLEASSSPSDPSSDSSSNSSTSNSSTSKKKSKKQTGSQSKFTASSTTLNRNTFSTSTPNVVSTPLSTPAVSTSPAKRSGAKPTPLAQASELPHNHPSNAYIPYAYAERAHKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGPGKSFKFED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.58
3	0.62
4	0.63
5	0.63
6	0.54
7	0.53
8	0.55
9	0.56
10	0.58
11	0.58
12	0.61
13	0.64
14	0.72
15	0.76
16	0.71
17	0.66
18	0.65
19	0.67
20	0.64
21	0.58
22	0.52
23	0.5
24	0.6
25	0.62
26	0.57
27	0.53
28	0.49
29	0.48
30	0.47
31	0.47
32	0.4
33	0.35
34	0.32
35	0.28
36	0.26
37	0.23
38	0.21
39	0.15
40	0.14
41	0.12
42	0.1
43	0.09
44	0.07
45	0.08
46	0.08
47	0.09
48	0.1
49	0.1
50	0.12
51	0.14
52	0.14
53	0.16
54	0.17
55	0.2
56	0.21
57	0.27
58	0.35
59	0.39
60	0.41
61	0.44
62	0.44
63	0.4
64	0.37
65	0.33
66	0.27
67	0.25
68	0.31
69	0.27
70	0.28
71	0.35
72	0.38
73	0.42
74	0.46
75	0.51
76	0.51
77	0.56
78	0.58
79	0.56
80	0.57
81	0.51
82	0.47
83	0.42
84	0.35
85	0.32
86	0.28
87	0.24
88	0.23
89	0.23
90	0.22
91	0.17
92	0.23
93	0.25
94	0.26
95	0.3
96	0.31
97	0.36
98	0.44
99	0.54
100	0.55
101	0.59
102	0.63
103	0.61
104	0.59
105	0.55
106	0.48
107	0.39
108	0.32
109	0.24
110	0.19
111	0.16
112	0.13
113	0.13
114	0.12
115	0.1
116	0.1
117	0.1
118	0.09
119	0.08
120	0.08
121	0.07
122	0.07
123	0.08
124	0.07
125	0.07
126	0.08
127	0.08
128	0.09
129	0.09
130	0.08
131	0.07
132	0.07
133	0.06
134	0.06
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.05
140	0.06
141	0.06
142	0.08
143	0.09
144	0.08
145	0.09
146	0.1
147	0.12
148	0.13
149	0.13
150	0.12
151	0.13
152	0.13
153	0.13
154	0.12
155	0.11
156	0.11
157	0.11
158	0.1
159	0.09
160	0.08
161	0.09
162	0.09
163	0.12
164	0.18
165	0.26
166	0.34
167	0.37
168	0.38
169	0.4
170	0.46
171	0.47
172	0.49
173	0.48
174	0.44
175	0.46
176	0.51
177	0.49
178	0.43
179	0.39
180	0.31
181	0.25
182	0.22
183	0.19
184	0.14
185	0.16
186	0.17
187	0.23
188	0.29
189	0.29
190	0.36
191	0.43
192	0.46
193	0.5
194	0.53
195	0.57
196	0.59
197	0.67
198	0.65
199	0.63
200	0.67
201	0.63
202	0.64
203	0.58
204	0.54
205	0.5
206	0.48
207	0.43
208	0.35
209	0.32
210	0.28
211	0.25
212	0.22
213	0.17
214	0.14
215	0.13
216	0.13
217	0.13
218	0.11
219	0.1
220	0.09
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.06
225	0.07
226	0.08
227	0.08
228	0.09
229	0.1
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.08
234	0.07
235	0.09
236	0.08
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.05
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.07
258	0.1
259	0.12
260	0.18
261	0.25
262	0.29
263	0.36
264	0.42
265	0.49
266	0.55
267	0.62
268	0.65
269	0.64
270	0.62
271	0.56
272	0.56
273	0.48
274	0.41
275	0.32
276	0.23
277	0.17
278	0.16
279	0.14
280	0.08
281	0.08
282	0.07
283	0.07
284	0.09
285	0.1
286	0.09
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.1
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.1
300	0.11
301	0.12
302	0.12
303	0.15
304	0.16
305	0.15
306	0.14
307	0.13
308	0.12
309	0.13
310	0.15
311	0.12
312	0.11
313	0.12
314	0.16
315	0.18
316	0.2
317	0.2
318	0.19
319	0.2
320	0.2
321	0.2
322	0.16
323	0.14
324	0.13
325	0.12
326	0.11
327	0.1
328	0.09
329	0.1
330	0.1
331	0.13
332	0.17
333	0.18
334	0.18
335	0.21
336	0.22
337	0.23
338	0.23
339	0.21
340	0.16
341	0.16
342	0.19
343	0.19
344	0.22
345	0.28
346	0.35
347	0.44
348	0.52
349	0.59
350	0.66
351	0.74
352	0.81
353	0.84
354	0.87
355	0.88
356	0.87
357	0.87
358	0.79
359	0.71
360	0.62
361	0.52
362	0.43
363	0.34
364	0.32
365	0.3
366	0.35
367	0.38
368	0.38
369	0.38
370	0.36
371	0.38
372	0.33
373	0.31
374	0.28
375	0.25
376	0.27
377	0.26
378	0.26
379	0.23
380	0.23
381	0.21
382	0.17
383	0.17
384	0.17
385	0.17
386	0.16
387	0.16
388	0.17
389	0.18
390	0.17
391	0.19
392	0.21
393	0.25
394	0.3
395	0.32
396	0.34
397	0.37
398	0.46
399	0.51
400	0.5
401	0.5
402	0.5
403	0.57
404	0.53
405	0.51
406	0.42
407	0.39
408	0.37
409	0.41
410	0.37
411	0.33
412	0.38
413	0.38
414	0.36
415	0.31
416	0.32
417	0.27
418	0.29
419	0.26
420	0.2
421	0.19
422	0.2
423	0.21
424	0.19
425	0.19
426	0.2
427	0.22
428	0.25
429	0.25
430	0.24
431	0.26
432	0.3
433	0.33
434	0.39
435	0.37
436	0.37
437	0.42
438	0.42
439	0.47
440	0.5
441	0.52
442	0.54
443	0.63
444	0.71
445	0.77
446	0.85
447	0.87
448	0.9
449	0.91
450	0.9
451	0.9
452	0.89
453	0.89
454	0.88
455	0.82
456	0.72
457	0.62
458	0.61
459	0.54
460	0.47
461	0.37
462	0.3
463	0.28

C5GSS7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer