FuNGI

C5GB38

Protein Details

Accession

C5GB38

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
235-260	VYMPKKRVWHERCYKTHKRHNPDSSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 12.5, cyto 8, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001781 Znf_LIM
Gene Ontology	GO:0030695 F:GTPase regulator activity GO:0046872 F:metal ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF00412 LIM
PROSITE	View protein in PROSITE PS00478 LIM_DOMAIN_1 PS50023 LIM_DOMAIN_2
CDD	cd09392 LIM2_Lrg1p_like

Amino Acid Sequences

MEASICAVQECSDAQRSKAVSSHIRGLWSIVDAGRLGSSGKETYQSLANNFEVDTCVDKDSCIIAPANCGGEVSMATKRRLHTKAGSQGSAYSTISDSCAKCGMSIASECISAFGSFYHPQCFKCHDCHKPIYREFFPAQERNGPIPLCETDLFRRLDMLCSQCGGALRDLYISALGRKYHMDHFTCHSCQHVIGAGDNYYIHGGKAYCKKDYMAKYADCCYGCGMAIMDQYIKVYMPKKRVWHERCYKTHKRHNPDSSLGDVPIAAEQDAESTPLKMERILDNFEATVTSCISDSLEHLESGSREKISEGILTLITALGVLFSSIDAVDDVRRKAGKTVLSDSSEIDLLRAKLTDFMTVSLSNSQQPRSTSSHLKEIYAASSGLSYFMKKVIKIFGERVVDVDLSASSEYLNSLDKFPDHPPLATMNFTKIELSRSDAELCQVCNGPISTECVSWDGYLRRQHLTCKSSCVHCDACETPQNTNLVLINPPGDSYALCCTICQKNVNILGDRAADEPSVKSCKYVTKLQQYVFLLRAQFEQMQKPTDVHYDQMTMTTATTATTTTTTTTMTTLFERSHKQLDRGIFGRLSANSHRTPTDQPAANSLIDRTASDTFALGAMIGSSYQGLKKGFFGRSKTRCRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.3
3	0.31
4	0.32
5	0.34
6	0.36
7	0.37
8	0.4
9	0.47
10	0.43
11	0.43
12	0.41
13	0.39
14	0.34
15	0.27
16	0.25
17	0.17
18	0.16
19	0.14
20	0.14
21	0.13
22	0.12
23	0.11
24	0.09
25	0.12
26	0.12
27	0.13
28	0.15
29	0.16
30	0.18
31	0.23
32	0.25
33	0.24
34	0.27
35	0.27
36	0.25
37	0.24
38	0.22
39	0.18
40	0.17
41	0.18
42	0.15
43	0.17
44	0.16
45	0.16
46	0.17
47	0.18
48	0.17
49	0.16
50	0.16
51	0.14
52	0.17
53	0.19
54	0.2
55	0.17
56	0.16
57	0.14
58	0.12
59	0.13
60	0.13
61	0.17
62	0.2
63	0.22
64	0.26
65	0.28
66	0.37
67	0.39
68	0.43
69	0.44
70	0.5
71	0.57
72	0.6
73	0.59
74	0.5
75	0.49
76	0.45
77	0.4
78	0.31
79	0.22
80	0.16
81	0.15
82	0.17
83	0.2
84	0.18
85	0.18
86	0.2
87	0.19
88	0.18
89	0.2
90	0.18
91	0.16
92	0.17
93	0.17
94	0.15
95	0.16
96	0.16
97	0.14
98	0.15
99	0.11
100	0.1
101	0.08
102	0.12
103	0.15
104	0.17
105	0.23
106	0.24
107	0.25
108	0.29
109	0.35
110	0.34
111	0.4
112	0.48
113	0.5
114	0.56
115	0.64
116	0.69
117	0.72
118	0.75
119	0.74
120	0.67
121	0.65
122	0.58
123	0.55
124	0.53
125	0.48
126	0.44
127	0.43
128	0.43
129	0.39
130	0.42
131	0.35
132	0.29
133	0.28
134	0.26
135	0.23
136	0.2
137	0.21
138	0.21
139	0.27
140	0.28
141	0.24
142	0.26
143	0.23
144	0.26
145	0.27
146	0.26
147	0.21
148	0.2
149	0.2
150	0.19
151	0.2
152	0.19
153	0.16
154	0.13
155	0.12
156	0.12
157	0.12
158	0.11
159	0.1
160	0.09
161	0.1
162	0.12
163	0.12
164	0.13
165	0.14
166	0.17
167	0.22
168	0.28
169	0.27
170	0.28
171	0.33
172	0.38
173	0.38
174	0.35
175	0.31
176	0.26
177	0.24
178	0.22
179	0.2
180	0.14
181	0.14
182	0.15
183	0.14
184	0.13
185	0.13
186	0.12
187	0.1
188	0.09
189	0.07
190	0.08
191	0.08
192	0.14
193	0.22
194	0.25
195	0.25
196	0.26
197	0.28
198	0.33
199	0.38
200	0.39
201	0.36
202	0.36
203	0.37
204	0.4
205	0.43
206	0.36
207	0.31
208	0.26
209	0.2
210	0.18
211	0.15
212	0.12
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.08
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.08
222	0.13
223	0.17
224	0.24
225	0.28
226	0.34
227	0.42
228	0.53
229	0.56
230	0.61
231	0.67
232	0.71
233	0.75
234	0.78
235	0.81
236	0.79
237	0.84
238	0.83
239	0.82
240	0.82
241	0.81
242	0.77
243	0.72
244	0.65
245	0.59
246	0.5
247	0.41
248	0.31
249	0.23
250	0.17
251	0.12
252	0.1
253	0.06
254	0.04
255	0.04
256	0.05
257	0.06
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.1
266	0.12
267	0.14
268	0.17
269	0.17
270	0.17
271	0.16
272	0.16
273	0.14
274	0.11
275	0.09
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.1
288	0.1
289	0.12
290	0.13
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.04
304	0.04
305	0.03
306	0.02
307	0.02
308	0.02
309	0.02
310	0.02
311	0.02
312	0.02
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.06
317	0.08
318	0.08
319	0.1
320	0.11
321	0.12
322	0.13
323	0.17
324	0.19
325	0.2
326	0.25
327	0.26
328	0.27
329	0.28
330	0.26
331	0.23
332	0.2
333	0.16
334	0.12
335	0.1
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.07
340	0.1
341	0.11
342	0.12
343	0.11
344	0.11
345	0.13
346	0.13
347	0.14
348	0.12
349	0.12
350	0.14
351	0.15
352	0.15
353	0.16
354	0.17
355	0.21
356	0.24
357	0.28
358	0.32
359	0.32
360	0.4
361	0.38
362	0.37
363	0.34
364	0.3
365	0.26
366	0.2
367	0.18
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.08
372	0.08
373	0.07
374	0.06
375	0.11
376	0.12
377	0.12
378	0.14
379	0.17
380	0.19
381	0.22
382	0.23
383	0.25
384	0.26
385	0.26
386	0.25
387	0.22
388	0.19
389	0.16
390	0.14
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.08
400	0.08
401	0.09
402	0.1
403	0.11
404	0.14
405	0.15
406	0.22
407	0.2
408	0.2
409	0.2
410	0.23
411	0.24
412	0.24
413	0.22
414	0.18
415	0.18
416	0.18
417	0.18
418	0.15
419	0.16
420	0.14
421	0.17
422	0.16
423	0.17
424	0.19
425	0.18
426	0.19
427	0.19
428	0.18
429	0.16
430	0.15
431	0.13
432	0.13
433	0.13
434	0.11
435	0.11
436	0.15
437	0.14
438	0.14
439	0.15
440	0.14
441	0.15
442	0.14
443	0.18
444	0.16
445	0.2
446	0.26
447	0.28
448	0.31
449	0.31
450	0.38
451	0.42
452	0.45
453	0.4
454	0.41
455	0.42
456	0.42
457	0.43
458	0.42
459	0.35
460	0.31
461	0.34
462	0.3
463	0.31
464	0.33
465	0.33
466	0.29
467	0.3
468	0.31
469	0.26
470	0.25
471	0.22
472	0.17
473	0.16
474	0.15
475	0.13
476	0.11
477	0.11
478	0.1
479	0.1
480	0.08
481	0.09
482	0.12
483	0.14
484	0.14
485	0.14
486	0.18
487	0.23
488	0.27
489	0.27
490	0.26
491	0.3
492	0.36
493	0.4
494	0.38
495	0.33
496	0.32
497	0.3
498	0.3
499	0.23
500	0.18
501	0.14
502	0.13
503	0.14
504	0.16
505	0.19
506	0.18
507	0.18
508	0.19
509	0.26
510	0.3
511	0.38
512	0.43
513	0.49
514	0.55
515	0.55
516	0.61
517	0.56
518	0.55
519	0.47
520	0.41
521	0.32
522	0.26
523	0.27
524	0.22
525	0.24
526	0.24
527	0.29
528	0.29
529	0.31
530	0.31
531	0.31
532	0.3
533	0.32
534	0.3
535	0.25
536	0.24
537	0.23
538	0.22
539	0.23
540	0.21
541	0.15
542	0.14
543	0.13
544	0.11
545	0.09
546	0.09
547	0.08
548	0.08
549	0.09
550	0.09
551	0.1
552	0.11
553	0.11
554	0.12
555	0.13
556	0.12
557	0.13
558	0.14
559	0.15
560	0.17
561	0.2
562	0.25
563	0.29
564	0.37
565	0.39
566	0.41
567	0.44
568	0.46
569	0.49
570	0.45
571	0.45
572	0.36
573	0.33
574	0.34
575	0.3
576	0.3
577	0.29
578	0.34
579	0.32
580	0.35
581	0.36
582	0.35
583	0.39
584	0.41
585	0.44
586	0.43
587	0.41
588	0.44
589	0.45
590	0.42
591	0.38
592	0.31
593	0.25
594	0.21
595	0.2
596	0.19
597	0.18
598	0.18
599	0.17
600	0.16
601	0.14
602	0.13
603	0.13
604	0.09
605	0.07
606	0.06
607	0.06
608	0.05
609	0.05
610	0.06
611	0.07
612	0.09
613	0.13
614	0.14
615	0.15
616	0.21
617	0.28
618	0.35
619	0.4
620	0.46
621	0.53
622	0.62

C5GB38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer