Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GPC1

Protein Details
Accession C5GPC1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAPRSHNKRHRSAHTGQFVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
363-381RTPGRKRSAPGGSRRRSSG
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022190  DUF3716  
Pfam View protein in Pfam  
PF12511  DUF3716  
Amino Acid Sequences MAPRSHNKRHRSAHTGQFVSKSSRVDRSASADDSEPSVESLVENLEDAIMEELPVSCVAGSPASPPAPSAAPSSAAPPSVPSSAAPQSPTLAPVSGSPAPATPVPATPTPATPGFAASAFVTSSPRFKEMLRRLGEPRLPARTLPPFLPTPRTIYCTKAAYDTTIWSSVADADYYVRFKYSWWGNRPFVPENHPPPQQRLDREIVMGFAVHEVVASTDTKELFTTVKFNIAGTSALANSFGMIDPYRPILWRLSSDFVVQAKDIRVFGNGNADVVLFYTRGREARTPCLGCRRGNGPFARCVLLPAFPRVPLSLPEEPRACFISAPAPEAILIEDDNAAETTPSRPQAPPVASSPSPAEKVVRTPGRKRSAPGGSRRRSSGPAPPPSVSSASAPPALAPGPAGPALSSNFSTRTRTHSYIGIPANLAINDINVVRRAVEESEACAVLLRERLAALESLADLEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.69
4 0.64
5 0.59
6 0.57
7 0.51
8 0.46
9 0.41
10 0.44
11 0.44
12 0.43
13 0.43
14 0.44
15 0.46
16 0.43
17 0.4
18 0.34
19 0.32
20 0.31
21 0.28
22 0.21
23 0.16
24 0.14
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.06
44 0.06
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.09
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.16
54 0.16
55 0.18
56 0.19
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.17
64 0.16
65 0.18
66 0.16
67 0.17
68 0.14
69 0.18
70 0.22
71 0.23
72 0.23
73 0.2
74 0.22
75 0.21
76 0.22
77 0.18
78 0.15
79 0.13
80 0.12
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.17
87 0.17
88 0.19
89 0.14
90 0.15
91 0.17
92 0.18
93 0.21
94 0.2
95 0.21
96 0.22
97 0.22
98 0.21
99 0.18
100 0.18
101 0.15
102 0.14
103 0.14
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.11
109 0.1
110 0.14
111 0.14
112 0.16
113 0.17
114 0.18
115 0.28
116 0.34
117 0.43
118 0.42
119 0.45
120 0.46
121 0.52
122 0.54
123 0.48
124 0.44
125 0.41
126 0.38
127 0.35
128 0.36
129 0.35
130 0.35
131 0.31
132 0.3
133 0.28
134 0.29
135 0.34
136 0.3
137 0.3
138 0.3
139 0.33
140 0.3
141 0.3
142 0.32
143 0.29
144 0.28
145 0.26
146 0.24
147 0.22
148 0.22
149 0.2
150 0.18
151 0.17
152 0.16
153 0.13
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.15
167 0.22
168 0.29
169 0.35
170 0.42
171 0.44
172 0.48
173 0.53
174 0.5
175 0.43
176 0.42
177 0.43
178 0.42
179 0.46
180 0.48
181 0.43
182 0.44
183 0.5
184 0.48
185 0.43
186 0.42
187 0.4
188 0.35
189 0.35
190 0.3
191 0.23
192 0.18
193 0.15
194 0.1
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.1
212 0.09
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.08
220 0.09
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.13
239 0.15
240 0.16
241 0.17
242 0.17
243 0.18
244 0.17
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.13
250 0.13
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.16
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.09
268 0.11
269 0.16
270 0.19
271 0.26
272 0.33
273 0.34
274 0.35
275 0.44
276 0.46
277 0.42
278 0.42
279 0.4
280 0.37
281 0.41
282 0.44
283 0.36
284 0.36
285 0.37
286 0.35
287 0.3
288 0.28
289 0.22
290 0.22
291 0.2
292 0.21
293 0.2
294 0.19
295 0.2
296 0.19
297 0.19
298 0.17
299 0.22
300 0.24
301 0.26
302 0.3
303 0.31
304 0.3
305 0.31
306 0.31
307 0.25
308 0.18
309 0.17
310 0.19
311 0.18
312 0.2
313 0.18
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.09
319 0.08
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.06
328 0.07
329 0.11
330 0.13
331 0.15
332 0.15
333 0.18
334 0.26
335 0.28
336 0.28
337 0.28
338 0.33
339 0.31
340 0.32
341 0.33
342 0.29
343 0.28
344 0.26
345 0.25
346 0.2
347 0.24
348 0.31
349 0.37
350 0.4
351 0.46
352 0.55
353 0.61
354 0.62
355 0.61
356 0.61
357 0.63
358 0.64
359 0.67
360 0.68
361 0.67
362 0.68
363 0.69
364 0.64
365 0.58
366 0.54
367 0.53
368 0.52
369 0.54
370 0.54
371 0.51
372 0.5
373 0.49
374 0.47
375 0.39
376 0.32
377 0.26
378 0.24
379 0.25
380 0.22
381 0.19
382 0.18
383 0.17
384 0.14
385 0.12
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.09
391 0.11
392 0.13
393 0.15
394 0.16
395 0.15
396 0.19
397 0.21
398 0.26
399 0.25
400 0.31
401 0.36
402 0.38
403 0.39
404 0.4
405 0.4
406 0.44
407 0.46
408 0.4
409 0.33
410 0.3
411 0.3
412 0.25
413 0.23
414 0.15
415 0.12
416 0.11
417 0.12
418 0.12
419 0.11
420 0.12
421 0.11
422 0.12
423 0.15
424 0.15
425 0.18
426 0.17
427 0.19
428 0.22
429 0.21
430 0.2
431 0.19
432 0.18
433 0.16
434 0.19
435 0.16
436 0.14
437 0.14
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.13
442 0.11
443 0.1