Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A094FIZ3

Protein Details
Accession A0A094FIZ3    Localization Confidence Low Confidence Score 7.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MGKSNKRAKVKNHPNPIAKPVKPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8.5, mito 8, cyto_nucl 7.5, cyto 5.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR028606  Clp1  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR010655  Clp1_C  
IPR038238  Clp1_C_sf  
IPR032324  Clp1_N  
IPR038239  Clp1_N_sf  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005849  C:mRNA cleavage factor complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0031124  P:mRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06807  Clp1  
PF16573  CLP1_N  
PF16575  CLP1_P  
CDD cd13394  Syo1_like  
Amino Acid Sequences MGKSNKRAKVKNHPNPIAKPVKPPTDPELAAVREKQILPVINDLKSPEVSRRSAAAVAIANLIEDTKCRKLLLREQVVGILLEQTITDSSLESKSAGWGILRNLALEEEADFSIHLYRRDILTPITAIIQMIIETIESKENPIAKLPKAQQSLLWTLSGSVVGLLTSLGEAQEEIVEAISRLPSILNFLFGLLNVPAVPGELFSDVLTCISTLTEDNKALSQQIVGHEAWLMGLMQLRELAGPRAVPACAVLHNIFTCLEWFDHNTPMEGASDAILIPTLVQCMSQVQGEDNLSNGSSHLNPDQLLQLALEITASIATSLQEALEHGAKHEKEFEGFDDKADGEDETMADDINDDASDADEEDELNEEDEEEDEMTIAEIAEDMDRVIGDGSDDEDDSEDVPATLDALIRVASPFLLKLAQTDNEAVQSGAISALNNIAWTISNVDFSTASGRLKKSWAPLAQQIWSEVVTPVLASNTADIELASSITSLAWAVARSVQGQVKLTGDEHRKFMALYQASKDIPAPSDTEGVDPFQGLGVKCVGVLGRLALDPAPLALNREIGVFLLTVLAGLPETPVADAVEALNGIFDIYADKSYACDKVFRDDGFHKHLEELKVKVIKAAKGVDRRKETELRSRADEAGPSSVPTSSTTAATVVHDLAANSEWRFEVDIGTSIEVKILSGSAELFGTELAVKHAYTFNGTKAAIFTYHGCRIEVTGQCEEYTAEESPMTQYANLHFALENLRQTSQPEPRVLVVGPNNSGKTSLVKLLTAYATRSGKQPIVVNTDPGEGMLSIPGSLTATAMSSVIDVEEGWGSSPTSGPSSVPVKLPLVYFYGLKSPEDEPKLYKPVCTRLALAVTERLADDEEVKRSGVIIDTPGVISQGKNSYDLISHIASEFTVNVIIVLGSERLHSDMLRRFSNATPTPITVIKLEKSGGCADRDDAYMSAFRQSQIREYFFGSIKRTLSPHTQTVDFSAITIYKIHEQSGMMSSFLPGGEEEVESPIFDRVEPSSQMLHCVMAVMYAGTHDALEVIRDASVMGFVYVAEVDDKKRRLRVLAPVSGKIGDRPLVWGSWPEASVSLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.83
3 0.84
4 0.82
5 0.73
6 0.73
7 0.7
8 0.7
9 0.64
10 0.64
11 0.59
12 0.58
13 0.56
14 0.49
15 0.48
16 0.42
17 0.44
18 0.4
19 0.37
20 0.33
21 0.33
22 0.32
23 0.3
24 0.32
25 0.3
26 0.38
27 0.39
28 0.35
29 0.36
30 0.35
31 0.33
32 0.31
33 0.3
34 0.29
35 0.31
36 0.32
37 0.33
38 0.34
39 0.34
40 0.33
41 0.31
42 0.27
43 0.23
44 0.22
45 0.21
46 0.18
47 0.15
48 0.13
49 0.13
50 0.09
51 0.1
52 0.14
53 0.17
54 0.19
55 0.2
56 0.26
57 0.33
58 0.43
59 0.52
60 0.55
61 0.53
62 0.53
63 0.54
64 0.5
65 0.41
66 0.32
67 0.22
68 0.13
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.12
85 0.14
86 0.16
87 0.21
88 0.21
89 0.19
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.15
94 0.14
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.15
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.19
105 0.21
106 0.23
107 0.24
108 0.2
109 0.21
110 0.21
111 0.19
112 0.18
113 0.16
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.1
124 0.1
125 0.12
126 0.16
127 0.19
128 0.19
129 0.26
130 0.3
131 0.28
132 0.37
133 0.41
134 0.46
135 0.47
136 0.47
137 0.43
138 0.44
139 0.47
140 0.4
141 0.34
142 0.25
143 0.22
144 0.22
145 0.19
146 0.13
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.15
179 0.09
180 0.09
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.1
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.12
210 0.14
211 0.17
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.1
218 0.09
219 0.05
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.14
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.15
242 0.14
243 0.13
244 0.13
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.15
249 0.16
250 0.2
251 0.2
252 0.2
253 0.19
254 0.19
255 0.18
256 0.14
257 0.12
258 0.08
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.11
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.12
292 0.12
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.06
298 0.04
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.07
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.16
315 0.17
316 0.17
317 0.21
318 0.19
319 0.18
320 0.19
321 0.21
322 0.2
323 0.2
324 0.2
325 0.18
326 0.17
327 0.16
328 0.16
329 0.13
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.04
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.04
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.05
403 0.06
404 0.05
405 0.07
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.12
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.11
414 0.08
415 0.07
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.05
428 0.08
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.12
436 0.1
437 0.11
438 0.14
439 0.14
440 0.15
441 0.17
442 0.19
443 0.2
444 0.26
445 0.28
446 0.28
447 0.33
448 0.34
449 0.34
450 0.32
451 0.29
452 0.22
453 0.19
454 0.17
455 0.11
456 0.09
457 0.06
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.04
468 0.05
469 0.04
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.03
475 0.04
476 0.03
477 0.03
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.09
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.13
489 0.12
490 0.12
491 0.13
492 0.16
493 0.21
494 0.21
495 0.22
496 0.21
497 0.21
498 0.2
499 0.2
500 0.21
501 0.17
502 0.17
503 0.18
504 0.2
505 0.2
506 0.2
507 0.2
508 0.14
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.1
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.1
519 0.08
520 0.07
521 0.06
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.06
530 0.05
531 0.05
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.05
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.05
541 0.04
542 0.06
543 0.06
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.05
551 0.05
552 0.04
553 0.04
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.02
558 0.02
559 0.02
560 0.02
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.03
570 0.03
571 0.03
572 0.03
573 0.03
574 0.02
575 0.02
576 0.03
577 0.04
578 0.04
579 0.05
580 0.05
581 0.06
582 0.07
583 0.1
584 0.1
585 0.12
586 0.13
587 0.17
588 0.2
589 0.2
590 0.23
591 0.24
592 0.28
593 0.3
594 0.3
595 0.26
596 0.25
597 0.29
598 0.28
599 0.27
600 0.24
601 0.24
602 0.26
603 0.26
604 0.27
605 0.26
606 0.24
607 0.24
608 0.27
609 0.27
610 0.33
611 0.39
612 0.43
613 0.45
614 0.47
615 0.49
616 0.51
617 0.49
618 0.5
619 0.51
620 0.46
621 0.45
622 0.44
623 0.41
624 0.36
625 0.33
626 0.24
627 0.21
628 0.18
629 0.15
630 0.13
631 0.11
632 0.11
633 0.12
634 0.12
635 0.1
636 0.11
637 0.11
638 0.1
639 0.11
640 0.11
641 0.1
642 0.08
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.08
648 0.08
649 0.07
650 0.08
651 0.07
652 0.07
653 0.09
654 0.08
655 0.08
656 0.07
657 0.1
658 0.1
659 0.11
660 0.1
661 0.09
662 0.1
663 0.09
664 0.08
665 0.05
666 0.05
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.05
679 0.06
680 0.06
681 0.07
682 0.09
683 0.09
684 0.12
685 0.13
686 0.13
687 0.16
688 0.16
689 0.15
690 0.14
691 0.15
692 0.12
693 0.12
694 0.14
695 0.16
696 0.21
697 0.21
698 0.2
699 0.2
700 0.21
701 0.26
702 0.26
703 0.25
704 0.22
705 0.22
706 0.22
707 0.22
708 0.21
709 0.16
710 0.15
711 0.11
712 0.1
713 0.09
714 0.1
715 0.1
716 0.11
717 0.1
718 0.08
719 0.08
720 0.09
721 0.12
722 0.12
723 0.12
724 0.11
725 0.11
726 0.15
727 0.16
728 0.17
729 0.16
730 0.16
731 0.16
732 0.18
733 0.24
734 0.27
735 0.29
736 0.28
737 0.28
738 0.28
739 0.3
740 0.28
741 0.27
742 0.23
743 0.22
744 0.22
745 0.23
746 0.23
747 0.22
748 0.22
749 0.18
750 0.17
751 0.16
752 0.18
753 0.16
754 0.16
755 0.16
756 0.17
757 0.18
758 0.16
759 0.16
760 0.17
761 0.18
762 0.19
763 0.21
764 0.22
765 0.22
766 0.24
767 0.27
768 0.25
769 0.32
770 0.32
771 0.31
772 0.29
773 0.29
774 0.25
775 0.21
776 0.17
777 0.09
778 0.09
779 0.07
780 0.06
781 0.05
782 0.05
783 0.05
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.04
788 0.05
789 0.05
790 0.05
791 0.05
792 0.05
793 0.05
794 0.04
795 0.04
796 0.04
797 0.05
798 0.05
799 0.05
800 0.05
801 0.06
802 0.06
803 0.07
804 0.07
805 0.08
806 0.09
807 0.1
808 0.09
809 0.13
810 0.16
811 0.17
812 0.18
813 0.19
814 0.19
815 0.2
816 0.21
817 0.18
818 0.18
819 0.17
820 0.16
821 0.15
822 0.18
823 0.18
824 0.17
825 0.19
826 0.18
827 0.25
828 0.28
829 0.29
830 0.28
831 0.33
832 0.41
833 0.38
834 0.4
835 0.37
836 0.42
837 0.45
838 0.43
839 0.39
840 0.35
841 0.38
842 0.35
843 0.32
844 0.27
845 0.22
846 0.2
847 0.19
848 0.15
849 0.13
850 0.12
851 0.14
852 0.14
853 0.17
854 0.17
855 0.17
856 0.16
857 0.15
858 0.16
859 0.13
860 0.11
861 0.1
862 0.1
863 0.11
864 0.11
865 0.11
866 0.11
867 0.11
868 0.1
869 0.12
870 0.16
871 0.16
872 0.18
873 0.18
874 0.19
875 0.19
876 0.2
877 0.2
878 0.15
879 0.15
880 0.13
881 0.13
882 0.12
883 0.11
884 0.1
885 0.07
886 0.07
887 0.06
888 0.06
889 0.06
890 0.05
891 0.05
892 0.06
893 0.06
894 0.06
895 0.06
896 0.07
897 0.08
898 0.09
899 0.1
900 0.15
901 0.21
902 0.26
903 0.27
904 0.28
905 0.3
906 0.32
907 0.41
908 0.38
909 0.37
910 0.35
911 0.34
912 0.36
913 0.34
914 0.33
915 0.26
916 0.27
917 0.23
918 0.22
919 0.23
920 0.2
921 0.22
922 0.26
923 0.26
924 0.24
925 0.24
926 0.24
927 0.24
928 0.25
929 0.24
930 0.18
931 0.17
932 0.17
933 0.17
934 0.19
935 0.17
936 0.17
937 0.2
938 0.21
939 0.27
940 0.31
941 0.34
942 0.32
943 0.34
944 0.38
945 0.37
946 0.4
947 0.36
948 0.34
949 0.33
950 0.34
951 0.33
952 0.33
953 0.38
954 0.39
955 0.41
956 0.4
957 0.4
958 0.38
959 0.4
960 0.39
961 0.3
962 0.24
963 0.2
964 0.17
965 0.16
966 0.16
967 0.15
968 0.18
969 0.19
970 0.2
971 0.2
972 0.2
973 0.22
974 0.26
975 0.25
976 0.18
977 0.18
978 0.17
979 0.16
980 0.15
981 0.13
982 0.08
983 0.09
984 0.09
985 0.1
986 0.1
987 0.12
988 0.12
989 0.11
990 0.12
991 0.13
992 0.12
993 0.11
994 0.13
995 0.13
996 0.18
997 0.2
998 0.22
999 0.25
1000 0.25
1001 0.29
1002 0.28
1003 0.25
1004 0.2
1005 0.19
1006 0.16
1007 0.11
1008 0.11
1009 0.07
1010 0.06
1011 0.06
1012 0.07
1013 0.06
1014 0.06
1015 0.05
1016 0.06
1017 0.06
1018 0.07
1019 0.08
1020 0.07
1021 0.07
1022 0.07
1023 0.08
1024 0.07
1025 0.08
1026 0.07
1027 0.06
1028 0.06
1029 0.05
1030 0.07
1031 0.06
1032 0.07
1033 0.08
1034 0.1
1035 0.14
1036 0.22
1037 0.27
1038 0.32
1039 0.37
1040 0.4
1041 0.44
1042 0.49
1043 0.55
1044 0.57
1045 0.62
1046 0.62
1047 0.59
1048 0.58
1049 0.54
1050 0.48
1051 0.4
1052 0.34
1053 0.27
1054 0.23
1055 0.24
1056 0.24
1057 0.22
1058 0.23
1059 0.24
1060 0.22
1061 0.23
1062 0.23
1063 0.2