Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GDA1

Protein Details
Accession C5GDA1    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-34PDRTGSKRSRSRSPSSWRRPEKFSRQSDGHydrophilic
418-443AAKPTWANKYRPRKPRYFNRVQMGYEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-91KK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019134  Cactin_C  
IPR018816  Cactin_central  
Pfam View protein in Pfam  
PF10312  Cactin_mid  
PF09732  CactinC_cactus  
Amino Acid Sequences MSFRVPDRTGSKRSRSRSPSSWRRPEKFSRQSDGASTANGRSRTLPHSGASGRYPRSMKEQTQLNQLQEDEKMREWVAQEDDFVLRQAKKKAEIRVKEGRAKPIDWLTITLRVIDPTRNPLDDEIATSELDLIDPEGVFEGLLPDQLRDLETDIDTFLTLEKHPKNRDFWKTMKIVCEDSRQKSQPFGPEGRAMNSVADDINRLLGPKSYEELETLEIQIRRKLDSKDPIDTDYWEQLLRSLTVWKARAKLKKVYQAVIDGRISGLRNQQKEEAVAVQKKLAPLAPLLVASSGLLPSDILNKETVLDLDPEPLLHLGAQDKSLDILDEEALLSKVALDRQKILKMGFVPLRHRAIEKMSTLVTAPSVDTSTAHFASRFAAIPNEDFSQATRALYEREVARGVSENEEIFAGEEAVSTAAKPTWANKYRPRKPRYFNRVQMGYEWNKYNQTHYDYDNPPPKVVQGYKFNIFYPDLIDKTKAPTYKIERENGRKRGQSFAPAGEEDTCLIRFIAGPPYEDLAFRIVDKEWDYSAKRERGFKSSFDKGILQLHFQFKKIYYRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.76
3 0.77
4 0.77
5 0.8
6 0.81
7 0.82
8 0.87
9 0.87
10 0.85
11 0.85
12 0.86
13 0.86
14 0.85
15 0.82
16 0.79
17 0.73
18 0.7
19 0.65
20 0.59
21 0.49
22 0.42
23 0.36
24 0.32
25 0.33
26 0.32
27 0.29
28 0.27
29 0.31
30 0.32
31 0.35
32 0.33
33 0.28
34 0.34
35 0.35
36 0.36
37 0.37
38 0.41
39 0.38
40 0.42
41 0.42
42 0.38
43 0.45
44 0.49
45 0.47
46 0.47
47 0.53
48 0.5
49 0.59
50 0.62
51 0.54
52 0.49
53 0.46
54 0.41
55 0.35
56 0.36
57 0.29
58 0.25
59 0.26
60 0.23
61 0.25
62 0.24
63 0.25
64 0.26
65 0.23
66 0.22
67 0.21
68 0.22
69 0.2
70 0.2
71 0.2
72 0.19
73 0.24
74 0.29
75 0.31
76 0.39
77 0.44
78 0.53
79 0.58
80 0.62
81 0.64
82 0.68
83 0.71
84 0.73
85 0.71
86 0.7
87 0.64
88 0.59
89 0.56
90 0.51
91 0.47
92 0.39
93 0.37
94 0.31
95 0.33
96 0.32
97 0.29
98 0.24
99 0.22
100 0.23
101 0.23
102 0.22
103 0.23
104 0.26
105 0.26
106 0.26
107 0.25
108 0.28
109 0.25
110 0.24
111 0.2
112 0.18
113 0.17
114 0.16
115 0.15
116 0.11
117 0.1
118 0.08
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.05
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.15
148 0.21
149 0.28
150 0.34
151 0.39
152 0.45
153 0.52
154 0.61
155 0.59
156 0.58
157 0.59
158 0.58
159 0.56
160 0.54
161 0.48
162 0.44
163 0.4
164 0.45
165 0.44
166 0.44
167 0.49
168 0.47
169 0.46
170 0.45
171 0.46
172 0.44
173 0.42
174 0.41
175 0.36
176 0.38
177 0.38
178 0.36
179 0.34
180 0.27
181 0.22
182 0.19
183 0.17
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.08
191 0.07
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.13
202 0.12
203 0.15
204 0.16
205 0.16
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.22
210 0.24
211 0.27
212 0.35
213 0.38
214 0.41
215 0.42
216 0.42
217 0.38
218 0.37
219 0.32
220 0.24
221 0.21
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.15
231 0.18
232 0.19
233 0.23
234 0.29
235 0.35
236 0.38
237 0.45
238 0.47
239 0.53
240 0.53
241 0.51
242 0.45
243 0.45
244 0.41
245 0.37
246 0.3
247 0.22
248 0.19
249 0.18
250 0.17
251 0.13
252 0.19
253 0.2
254 0.21
255 0.23
256 0.25
257 0.24
258 0.24
259 0.24
260 0.2
261 0.2
262 0.21
263 0.19
264 0.18
265 0.19
266 0.19
267 0.18
268 0.15
269 0.11
270 0.09
271 0.1
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.05
322 0.08
323 0.11
324 0.11
325 0.15
326 0.18
327 0.21
328 0.23
329 0.22
330 0.22
331 0.2
332 0.25
333 0.25
334 0.25
335 0.26
336 0.3
337 0.32
338 0.3
339 0.3
340 0.26
341 0.27
342 0.28
343 0.25
344 0.22
345 0.19
346 0.18
347 0.18
348 0.16
349 0.12
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.09
357 0.12
358 0.12
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.13
363 0.15
364 0.13
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.13
369 0.15
370 0.15
371 0.14
372 0.13
373 0.14
374 0.15
375 0.14
376 0.13
377 0.12
378 0.11
379 0.12
380 0.13
381 0.15
382 0.13
383 0.14
384 0.15
385 0.14
386 0.14
387 0.16
388 0.17
389 0.16
390 0.17
391 0.14
392 0.14
393 0.14
394 0.13
395 0.1
396 0.09
397 0.07
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.08
408 0.11
409 0.21
410 0.28
411 0.35
412 0.44
413 0.55
414 0.64
415 0.74
416 0.78
417 0.77
418 0.8
419 0.85
420 0.85
421 0.85
422 0.84
423 0.83
424 0.81
425 0.72
426 0.66
427 0.63
428 0.57
429 0.51
430 0.45
431 0.38
432 0.38
433 0.38
434 0.38
435 0.35
436 0.36
437 0.35
438 0.35
439 0.42
440 0.39
441 0.48
442 0.52
443 0.48
444 0.43
445 0.4
446 0.38
447 0.37
448 0.39
449 0.37
450 0.37
451 0.42
452 0.46
453 0.47
454 0.46
455 0.42
456 0.38
457 0.32
458 0.28
459 0.27
460 0.24
461 0.24
462 0.26
463 0.23
464 0.27
465 0.32
466 0.3
467 0.27
468 0.34
469 0.41
470 0.49
471 0.54
472 0.57
473 0.61
474 0.7
475 0.78
476 0.78
477 0.77
478 0.73
479 0.69
480 0.69
481 0.63
482 0.61
483 0.55
484 0.5
485 0.47
486 0.41
487 0.41
488 0.34
489 0.31
490 0.24
491 0.22
492 0.17
493 0.13
494 0.13
495 0.11
496 0.11
497 0.12
498 0.2
499 0.19
500 0.2
501 0.22
502 0.25
503 0.25
504 0.24
505 0.23
506 0.17
507 0.16
508 0.15
509 0.15
510 0.13
511 0.16
512 0.18
513 0.19
514 0.19
515 0.25
516 0.28
517 0.33
518 0.42
519 0.45
520 0.48
521 0.54
522 0.56
523 0.57
524 0.58
525 0.58
526 0.57
527 0.58
528 0.56
529 0.51
530 0.5
531 0.44
532 0.49
533 0.44
534 0.41
535 0.39
536 0.45
537 0.44
538 0.43
539 0.44
540 0.39