Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GDQ4

Protein Details
Accession C5GDQ4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
213-232KEPWFLPKRRKRLDTNDTRSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 10.833, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046896  Cup1-like_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF20263  LYRM2-like  
CDD cd20273  Complex1_LYR_unchar  
Amino Acid Sequences MSLSPPQTPHWRHVYRALLRESSYLPDPIARQYMSSHVRESYRGYQPRMIQNSYRGPNGQFYLERRARKLLSILSRANDGYMKPLERVLMLSYGRIGRRRHVLARPFFVPNSSADKIPFRFILPPTCPPSWEPIPSLAALLKSQMENRKLSSIDATPAIREIPQPKKSIWNGHVSKRKVQKATEKWYDIVIKSFLPPIPDQEWNTLHGLAVGKEPWFLPKRRKRLDTNDTRSALDAEFLVFGPQKDRTFEAYARGRPHKITRKLITPIWERVLLATPRMTQDPETKSWIVRWGIPARKPPMFPTLDPELAINSQLFAGVDSTTGALLTPKRTRKRETTVSAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.6
3 0.64
4 0.63
5 0.56
6 0.54
7 0.53
8 0.46
9 0.4
10 0.35
11 0.28
12 0.24
13 0.23
14 0.23
15 0.24
16 0.27
17 0.23
18 0.21
19 0.22
20 0.3
21 0.33
22 0.34
23 0.32
24 0.31
25 0.33
26 0.34
27 0.39
28 0.38
29 0.43
30 0.46
31 0.48
32 0.5
33 0.55
34 0.63
35 0.62
36 0.59
37 0.52
38 0.54
39 0.59
40 0.56
41 0.52
42 0.45
43 0.4
44 0.41
45 0.39
46 0.35
47 0.3
48 0.3
49 0.38
50 0.42
51 0.44
52 0.42
53 0.46
54 0.43
55 0.42
56 0.43
57 0.4
58 0.41
59 0.44
60 0.44
61 0.39
62 0.41
63 0.38
64 0.35
65 0.29
66 0.21
67 0.19
68 0.2
69 0.2
70 0.18
71 0.19
72 0.18
73 0.17
74 0.18
75 0.14
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.19
81 0.21
82 0.26
83 0.26
84 0.25
85 0.33
86 0.37
87 0.42
88 0.46
89 0.52
90 0.52
91 0.56
92 0.54
93 0.49
94 0.45
95 0.39
96 0.32
97 0.26
98 0.27
99 0.24
100 0.22
101 0.2
102 0.25
103 0.25
104 0.26
105 0.24
106 0.18
107 0.21
108 0.22
109 0.28
110 0.27
111 0.32
112 0.35
113 0.34
114 0.34
115 0.31
116 0.36
117 0.32
118 0.3
119 0.26
120 0.22
121 0.23
122 0.22
123 0.22
124 0.16
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.12
131 0.17
132 0.2
133 0.2
134 0.22
135 0.23
136 0.23
137 0.23
138 0.22
139 0.17
140 0.15
141 0.16
142 0.15
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.1
147 0.11
148 0.16
149 0.22
150 0.27
151 0.28
152 0.29
153 0.36
154 0.38
155 0.43
156 0.4
157 0.42
158 0.41
159 0.47
160 0.54
161 0.49
162 0.53
163 0.54
164 0.57
165 0.51
166 0.52
167 0.54
168 0.55
169 0.62
170 0.62
171 0.55
172 0.5
173 0.49
174 0.47
175 0.37
176 0.31
177 0.23
178 0.16
179 0.15
180 0.16
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.16
185 0.18
186 0.21
187 0.22
188 0.24
189 0.25
190 0.24
191 0.25
192 0.21
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.14
203 0.18
204 0.21
205 0.31
206 0.4
207 0.5
208 0.58
209 0.65
210 0.67
211 0.73
212 0.8
213 0.8
214 0.79
215 0.77
216 0.71
217 0.65
218 0.57
219 0.48
220 0.37
221 0.26
222 0.18
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.1
230 0.14
231 0.15
232 0.16
233 0.19
234 0.22
235 0.26
236 0.27
237 0.33
238 0.36
239 0.4
240 0.45
241 0.47
242 0.45
243 0.44
244 0.53
245 0.56
246 0.58
247 0.62
248 0.61
249 0.63
250 0.66
251 0.65
252 0.63
253 0.58
254 0.54
255 0.48
256 0.44
257 0.37
258 0.33
259 0.37
260 0.3
261 0.26
262 0.23
263 0.22
264 0.23
265 0.25
266 0.24
267 0.2
268 0.28
269 0.31
270 0.32
271 0.36
272 0.35
273 0.35
274 0.35
275 0.39
276 0.33
277 0.31
278 0.35
279 0.38
280 0.44
281 0.48
282 0.54
283 0.54
284 0.57
285 0.56
286 0.52
287 0.52
288 0.49
289 0.45
290 0.43
291 0.44
292 0.4
293 0.39
294 0.35
295 0.29
296 0.25
297 0.25
298 0.18
299 0.12
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.09
313 0.12
314 0.19
315 0.27
316 0.37
317 0.47
318 0.54
319 0.62
320 0.68
321 0.75
322 0.79