Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GIS0

Protein Details
Accession C5GIS0    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-402TPATEYTRPKRTGKKRSYNDSSFVHydrophilic
423-448SEEGGRGQGKKKRKKDHISGVSPNLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-437RGQGKKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSHAPPPSSVHPGPPSSPSSPAADRTKPHQLYQQNHPKDQTPHTPTSPPLMSVSAQNYASSFSTTRTSPAQTFQFGSLSSPPSSVAMSTQVSQQPTVTSTTSFPTPASSAGGNFVNNLTIDEAEGIAKNGTTDSRKDGESYTGKEVGLDVMDIDTSEHRRTDHDRQKRGADKIPDDNTMDLDHRAASSTQEEELKLSALRQNIGTAFHLCKSSYTASGPNPSLDLISLYGLGPVASSVARTDPVTGEKINRLRKSYEGKIKGLGLAGRNKPVKAEPGATGGLKYLTLWPEEEWQNQKVYGKDIKVAAPDSSFFRQQLKAMKMEPGVLPNHEIWEDALGHEKASKVMVANDASMAKAAGTVPGSIRQPVHTNGTPSMISTPATEYTRPKRTGKKRSYNDSSFVGYGEGFPDDEVDLDSGRYSNSEEGGRGQGKKKRKKDHISGVSPNLSERSGSYGVGMFGVGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.39
4 0.43
5 0.38
6 0.38
7 0.37
8 0.42
9 0.45
10 0.45
11 0.45
12 0.47
13 0.56
14 0.53
15 0.53
16 0.54
17 0.55
18 0.56
19 0.64
20 0.68
21 0.65
22 0.66
23 0.66
24 0.64
25 0.61
26 0.63
27 0.62
28 0.59
29 0.58
30 0.58
31 0.59
32 0.54
33 0.55
34 0.49
35 0.4
36 0.34
37 0.3
38 0.26
39 0.27
40 0.29
41 0.26
42 0.25
43 0.23
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.19
48 0.17
49 0.14
50 0.17
51 0.17
52 0.2
53 0.21
54 0.24
55 0.24
56 0.29
57 0.31
58 0.31
59 0.33
60 0.31
61 0.29
62 0.25
63 0.26
64 0.23
65 0.22
66 0.2
67 0.19
68 0.18
69 0.17
70 0.17
71 0.15
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.19
77 0.21
78 0.22
79 0.22
80 0.22
81 0.19
82 0.19
83 0.21
84 0.17
85 0.15
86 0.15
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.15
95 0.13
96 0.13
97 0.15
98 0.16
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.09
118 0.11
119 0.12
120 0.17
121 0.19
122 0.19
123 0.21
124 0.21
125 0.26
126 0.28
127 0.3
128 0.29
129 0.29
130 0.28
131 0.27
132 0.26
133 0.19
134 0.15
135 0.11
136 0.07
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.15
147 0.22
148 0.32
149 0.4
150 0.47
151 0.53
152 0.56
153 0.64
154 0.68
155 0.66
156 0.62
157 0.58
158 0.53
159 0.54
160 0.54
161 0.47
162 0.42
163 0.37
164 0.31
165 0.26
166 0.22
167 0.15
168 0.12
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.14
201 0.14
202 0.17
203 0.17
204 0.21
205 0.21
206 0.18
207 0.17
208 0.16
209 0.14
210 0.11
211 0.09
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.03
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.09
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.17
235 0.24
236 0.3
237 0.32
238 0.33
239 0.33
240 0.38
241 0.43
242 0.46
243 0.49
244 0.46
245 0.45
246 0.44
247 0.43
248 0.38
249 0.32
250 0.26
251 0.2
252 0.22
253 0.23
254 0.27
255 0.28
256 0.27
257 0.27
258 0.27
259 0.27
260 0.22
261 0.23
262 0.18
263 0.2
264 0.22
265 0.2
266 0.19
267 0.15
268 0.13
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.15
277 0.18
278 0.21
279 0.22
280 0.23
281 0.24
282 0.24
283 0.26
284 0.22
285 0.25
286 0.26
287 0.23
288 0.25
289 0.26
290 0.26
291 0.26
292 0.26
293 0.21
294 0.17
295 0.17
296 0.18
297 0.19
298 0.19
299 0.18
300 0.2
301 0.21
302 0.23
303 0.3
304 0.29
305 0.3
306 0.29
307 0.32
308 0.3
309 0.31
310 0.28
311 0.23
312 0.22
313 0.19
314 0.2
315 0.17
316 0.18
317 0.15
318 0.15
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.1
323 0.15
324 0.13
325 0.13
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.09
332 0.11
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.11
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.14
349 0.15
350 0.16
351 0.17
352 0.18
353 0.21
354 0.23
355 0.29
356 0.28
357 0.3
358 0.29
359 0.32
360 0.29
361 0.26
362 0.25
363 0.18
364 0.16
365 0.14
366 0.16
367 0.17
368 0.19
369 0.21
370 0.26
371 0.34
372 0.43
373 0.47
374 0.51
375 0.58
376 0.66
377 0.75
378 0.79
379 0.81
380 0.81
381 0.87
382 0.9
383 0.84
384 0.78
385 0.71
386 0.63
387 0.52
388 0.43
389 0.34
390 0.24
391 0.19
392 0.15
393 0.12
394 0.09
395 0.08
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.13
410 0.15
411 0.15
412 0.18
413 0.26
414 0.3
415 0.33
416 0.39
417 0.43
418 0.52
419 0.62
420 0.69
421 0.73
422 0.79
423 0.84
424 0.88
425 0.92
426 0.92
427 0.91
428 0.89
429 0.85
430 0.79
431 0.69
432 0.59
433 0.5
434 0.4
435 0.31
436 0.24
437 0.23
438 0.2
439 0.19
440 0.19
441 0.19
442 0.19
443 0.18
444 0.17