Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GPH8

Protein Details
Accession C5GPH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
535-561DEKLSKAAAKNKKKREAKKAREMAEKABasic
578-598PSADRRERRGHSRSRSRGNTVBasic
607-633FNRQNRDRSRSSHRRQRSDHQNRTNGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
539-556SKAAAKNKKKREAKKARE
Subcellular Location(s) mito 10.5cyto_mito 10.5, cyto 9.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MAAPNQYAYRTQKGISIVDAAPVYESLPGFTRPDGNLRCCAYSPCGRYFAWAAPEGVVIVDASVGHVITTLPADNVYELGFSPLGTYIITWQRPSKDENGDAVKNLKVWRVVENALSDEGNKHEHSFIGSYVQKSQTGWNLQYTPDEKYCARVVTNEVQFYESGNLGKVWNKLRVEGVVDFALSPGKNNSIAVFIPERKGLPASVRIFNMPQFNSPVSQKNFFKGDKVQLKWNNTGTTLIVLAQTDVDKTGKSYYGETTLYLLSANGGFDSRIDLDKEGPIHDVTWSPNSKEFGVVYGYMPAKTTIFNNRAVATHSFALAPRNTIIFSPNGRFVVVAGFGNLAGQMDIYDLDKDYTKIATIEASNASVCEWSPDGKFILTATTSPRLRVDNGVRIWHVGGGLMYNEDLTELYQVCWRPQSATVHPPENPLHPMPTPHPSALAYLATKKAPSKPAGAYRPPGARGQTTPLAFRREDEGGEKFVRDESSSTLSGNGPNGFGKPRRRVVPGAEPVAEYLPPGAAPGGGVTLPPGAEGDEKLSKAAAKNKKKREAKKAREMAEKAGNLAADAGADSGISTGPSADRRERRGHSRSRSRGNTVSQTLDPNSFNRQNRDRSRSSHRRQRSDHQNRTNGVPATGPGNHNRPSVNTRAPAPNSTSAPAPPDVTVTSPMTPSGGTIQDKKIRGLLKKIRAIEELKMRVAGGEKLEDTQMKKIRTEDGVRKELEALGWAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.33
3 0.32
4 0.26
5 0.27
6 0.26
7 0.22
8 0.18
9 0.17
10 0.15
11 0.13
12 0.12
13 0.1
14 0.13
15 0.15
16 0.16
17 0.18
18 0.22
19 0.21
20 0.31
21 0.36
22 0.38
23 0.43
24 0.44
25 0.45
26 0.42
27 0.43
28 0.4
29 0.42
30 0.44
31 0.41
32 0.43
33 0.39
34 0.42
35 0.42
36 0.4
37 0.37
38 0.34
39 0.3
40 0.26
41 0.27
42 0.23
43 0.19
44 0.14
45 0.09
46 0.06
47 0.05
48 0.04
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.12
75 0.2
76 0.22
77 0.24
78 0.28
79 0.32
80 0.34
81 0.39
82 0.4
83 0.4
84 0.42
85 0.46
86 0.48
87 0.46
88 0.45
89 0.43
90 0.37
91 0.32
92 0.31
93 0.27
94 0.24
95 0.25
96 0.27
97 0.29
98 0.3
99 0.29
100 0.29
101 0.28
102 0.25
103 0.24
104 0.2
105 0.17
106 0.17
107 0.18
108 0.17
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.18
113 0.18
114 0.16
115 0.2
116 0.22
117 0.22
118 0.26
119 0.28
120 0.26
121 0.26
122 0.29
123 0.3
124 0.32
125 0.33
126 0.33
127 0.32
128 0.32
129 0.37
130 0.35
131 0.32
132 0.29
133 0.3
134 0.26
135 0.28
136 0.3
137 0.26
138 0.25
139 0.22
140 0.26
141 0.31
142 0.35
143 0.33
144 0.31
145 0.3
146 0.29
147 0.28
148 0.24
149 0.17
150 0.13
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.16
155 0.19
156 0.22
157 0.27
158 0.28
159 0.28
160 0.29
161 0.3
162 0.3
163 0.25
164 0.24
165 0.17
166 0.17
167 0.15
168 0.13
169 0.15
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.15
180 0.18
181 0.18
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.19
186 0.2
187 0.18
188 0.16
189 0.23
190 0.25
191 0.27
192 0.28
193 0.28
194 0.29
195 0.3
196 0.33
197 0.25
198 0.23
199 0.23
200 0.23
201 0.24
202 0.25
203 0.3
204 0.29
205 0.34
206 0.34
207 0.34
208 0.39
209 0.37
210 0.38
211 0.36
212 0.41
213 0.43
214 0.44
215 0.5
216 0.5
217 0.55
218 0.56
219 0.55
220 0.47
221 0.39
222 0.38
223 0.28
224 0.23
225 0.18
226 0.13
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.09
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.17
243 0.18
244 0.17
245 0.17
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.1
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.13
264 0.14
265 0.12
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.17
273 0.17
274 0.17
275 0.2
276 0.22
277 0.21
278 0.21
279 0.19
280 0.14
281 0.15
282 0.14
283 0.11
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.13
292 0.16
293 0.19
294 0.21
295 0.22
296 0.22
297 0.23
298 0.25
299 0.24
300 0.19
301 0.17
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.16
306 0.13
307 0.13
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.13
316 0.15
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.13
321 0.12
322 0.1
323 0.09
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.04
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.07
365 0.08
366 0.07
367 0.08
368 0.09
369 0.15
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.18
375 0.23
376 0.24
377 0.26
378 0.27
379 0.28
380 0.27
381 0.26
382 0.25
383 0.2
384 0.16
385 0.08
386 0.07
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.16
406 0.21
407 0.23
408 0.29
409 0.32
410 0.33
411 0.34
412 0.36
413 0.33
414 0.3
415 0.29
416 0.23
417 0.22
418 0.19
419 0.21
420 0.2
421 0.23
422 0.23
423 0.2
424 0.2
425 0.18
426 0.19
427 0.18
428 0.17
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.14
433 0.14
434 0.15
435 0.19
436 0.22
437 0.24
438 0.26
439 0.29
440 0.38
441 0.43
442 0.45
443 0.43
444 0.43
445 0.44
446 0.41
447 0.39
448 0.32
449 0.27
450 0.25
451 0.27
452 0.28
453 0.25
454 0.27
455 0.28
456 0.3
457 0.28
458 0.27
459 0.26
460 0.22
461 0.22
462 0.22
463 0.21
464 0.2
465 0.21
466 0.2
467 0.17
468 0.17
469 0.17
470 0.14
471 0.13
472 0.12
473 0.16
474 0.16
475 0.16
476 0.16
477 0.16
478 0.17
479 0.18
480 0.15
481 0.12
482 0.12
483 0.13
484 0.16
485 0.21
486 0.28
487 0.33
488 0.39
489 0.42
490 0.46
491 0.48
492 0.5
493 0.55
494 0.53
495 0.49
496 0.44
497 0.4
498 0.36
499 0.34
500 0.27
501 0.17
502 0.1
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.04
512 0.04
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.07
521 0.11
522 0.13
523 0.14
524 0.14
525 0.14
526 0.15
527 0.18
528 0.28
529 0.34
530 0.42
531 0.52
532 0.62
533 0.71
534 0.79
535 0.85
536 0.87
537 0.88
538 0.88
539 0.89
540 0.87
541 0.84
542 0.84
543 0.76
544 0.71
545 0.67
546 0.57
547 0.47
548 0.4
549 0.33
550 0.23
551 0.21
552 0.15
553 0.07
554 0.07
555 0.05
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.06
565 0.1
566 0.15
567 0.23
568 0.29
569 0.35
570 0.43
571 0.49
572 0.56
573 0.62
574 0.68
575 0.7
576 0.75
577 0.79
578 0.81
579 0.82
580 0.79
581 0.76
582 0.73
583 0.7
584 0.63
585 0.58
586 0.49
587 0.47
588 0.42
589 0.39
590 0.34
591 0.28
592 0.33
593 0.36
594 0.39
595 0.44
596 0.49
597 0.56
598 0.64
599 0.7
600 0.67
601 0.66
602 0.72
603 0.75
604 0.78
605 0.79
606 0.79
607 0.81
608 0.82
609 0.86
610 0.87
611 0.87
612 0.87
613 0.87
614 0.85
615 0.77
616 0.75
617 0.71
618 0.61
619 0.5
620 0.4
621 0.31
622 0.28
623 0.29
624 0.27
625 0.25
626 0.3
627 0.33
628 0.34
629 0.35
630 0.35
631 0.36
632 0.41
633 0.43
634 0.4
635 0.42
636 0.49
637 0.51
638 0.5
639 0.5
640 0.48
641 0.44
642 0.42
643 0.39
644 0.32
645 0.32
646 0.3
647 0.26
648 0.2
649 0.2
650 0.19
651 0.19
652 0.22
653 0.21
654 0.21
655 0.2
656 0.2
657 0.18
658 0.17
659 0.16
660 0.16
661 0.18
662 0.21
663 0.25
664 0.33
665 0.39
666 0.41
667 0.42
668 0.44
669 0.45
670 0.47
671 0.53
672 0.55
673 0.58
674 0.63
675 0.66
676 0.65
677 0.63
678 0.61
679 0.58
680 0.58
681 0.52
682 0.46
683 0.42
684 0.38
685 0.34
686 0.33
687 0.29
688 0.21
689 0.21
690 0.2
691 0.21
692 0.24
693 0.27
694 0.27
695 0.33
696 0.37
697 0.36
698 0.38
699 0.39
700 0.42
701 0.46
702 0.52
703 0.53
704 0.56
705 0.6
706 0.58
707 0.56
708 0.52
709 0.46
710 0.37