FuNGI

C5GBZ2

Protein Details

Accession

C5GBZ2

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-42	DIDPAPLSPERKRKNKEKDRHSAKKRKHQVTTTTAQ	Hydrophilic
44-102	DVEESSPKAKKKEKKEKKHKKHKYHEGLEASARALPDTPNSRSKKPKKPAHQSHQAALN	Hydrophilic
499-524	LPVPVPGKQGKDKEKKKKTKVKKTTS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-33	ERKRKNKEKDRHSAKKRK
50-70	PKAKKKEKKEKKHKKHKYHEG
82-92	PNSRSKKPKKP
505-522	GKQGKDKEKKKKTKVKKT

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSLDAMDIDPAPLSPERKRKNKEKDRHSAKKRKHQVTTTTAQPDVEESSPKAKKKEKKEKKHKKHKYHEGLEASARALPDTPNSRSKKPKKPAHQSHQAALNDDWEQEEQPSKPQSQSPTTSRKPLSKASVSQLESTSADSTESSAFHLITATLYVPLSPISISPTHALSSLQAEHLSPLLLTYYPPLRGIVLAYSNASISSSAPSPTSPPTPPHNPDEDLNPQPLTLAVSAGEYGVLYVYLTATFLIFRPERGQLLEGWINVQSDGFLGAVVYNLFSVGIERRRLPADWQWVAPGEESTTAALGTTTPKRSSGTDDDDDDDNEDKDSDFDSDKENFRPLPATSSTILDLNAQNHNHEGMEPPFEAFEDAAAGYFRTRSGRRVRGMVRFRVRDVDVIPGAEHDKGFLSIEGTMLSAVEEAKLLEEERRRAALAPLSSSSSSSSAVARARAGAGRSGDEVPPRAMMSGGLGIPSAAATAAAASDDDADDDLMEVEPEAELPVPVPGKQGKDKEKKKKTKVKKTTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.36
3	0.45
4	0.55
5	0.65
6	0.72
7	0.8
8	0.87
9	0.89
10	0.9
11	0.91
12	0.92
13	0.94
14	0.94
15	0.93
16	0.93
17	0.93
18	0.93
19	0.92
20	0.91
21	0.88
22	0.86
23	0.84
24	0.8
25	0.77
26	0.71
27	0.62
28	0.53
29	0.44
30	0.37
31	0.33
32	0.28
33	0.23
34	0.2
35	0.29
36	0.35
37	0.39
38	0.44
39	0.49
40	0.57
41	0.65
42	0.74
43	0.76
44	0.81
45	0.89
46	0.92
47	0.95
48	0.97
49	0.97
50	0.97
51	0.97
52	0.97
53	0.96
54	0.93
55	0.91
56	0.85
57	0.77
58	0.69
59	0.59
60	0.48
61	0.39
62	0.31
63	0.22
64	0.17
65	0.14
66	0.18
67	0.22
68	0.26
69	0.34
70	0.39
71	0.46
72	0.57
73	0.66
74	0.7
75	0.75
76	0.8
77	0.82
78	0.88
79	0.92
80	0.91
81	0.92
82	0.85
83	0.8
84	0.78
85	0.68
86	0.6
87	0.49
88	0.42
89	0.32
90	0.28
91	0.24
92	0.16
93	0.16
94	0.14
95	0.17
96	0.14
97	0.19
98	0.23
99	0.24
100	0.25
101	0.29
102	0.33
103	0.37
104	0.43
105	0.45
106	0.51
107	0.52
108	0.58
109	0.58
110	0.58
111	0.56
112	0.56
113	0.57
114	0.53
115	0.54
116	0.52
117	0.56
118	0.51
119	0.49
120	0.43
121	0.37
122	0.31
123	0.28
124	0.23
125	0.15
126	0.13
127	0.11
128	0.12
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.1
133	0.1
134	0.09
135	0.1
136	0.08
137	0.07
138	0.08
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.08
149	0.09
150	0.11
151	0.12
152	0.12
153	0.13
154	0.13
155	0.13
156	0.1
157	0.13
158	0.12
159	0.12
160	0.11
161	0.11
162	0.11
163	0.11
164	0.1
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.05
169	0.05
170	0.07
171	0.09
172	0.1
173	0.11
174	0.11
175	0.1
176	0.11
177	0.11
178	0.1
179	0.1
180	0.09
181	0.09
182	0.09
183	0.09
184	0.09
185	0.08
186	0.07
187	0.06
188	0.07
189	0.07
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.1
194	0.13
195	0.16
196	0.16
197	0.19
198	0.25
199	0.32
200	0.35
201	0.37
202	0.39
203	0.37
204	0.36
205	0.37
206	0.37
207	0.31
208	0.29
209	0.25
210	0.21
211	0.19
212	0.18
213	0.14
214	0.09
215	0.07
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.04
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.02
226	0.02
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.04
233	0.04
234	0.08
235	0.08
236	0.09
237	0.11
238	0.12
239	0.13
240	0.14
241	0.14
242	0.1
243	0.15
244	0.15
245	0.13
246	0.12
247	0.12
248	0.11
249	0.11
250	0.1
251	0.06
252	0.04
253	0.05
254	0.04
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.04
266	0.06
267	0.1
268	0.12
269	0.12
270	0.14
271	0.16
272	0.17
273	0.19
274	0.23
275	0.28
276	0.28
277	0.27
278	0.26
279	0.26
280	0.26
281	0.23
282	0.17
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.08
293	0.11
294	0.14
295	0.14
296	0.15
297	0.17
298	0.18
299	0.24
300	0.26
301	0.29
302	0.29
303	0.3
304	0.31
305	0.31
306	0.3
307	0.25
308	0.2
309	0.14
310	0.12
311	0.1
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.12
319	0.16
320	0.18
321	0.19
322	0.21
323	0.19
324	0.19
325	0.21
326	0.18
327	0.19
328	0.18
329	0.2
330	0.19
331	0.2
332	0.2
333	0.18
334	0.18
335	0.15
336	0.15
337	0.15
338	0.19
339	0.18
340	0.18
341	0.18
342	0.18
343	0.16
344	0.14
345	0.15
346	0.11
347	0.14
348	0.14
349	0.13
350	0.12
351	0.12
352	0.13
353	0.09
354	0.08
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.12
364	0.13
365	0.2
366	0.3
367	0.38
368	0.41
369	0.49
370	0.53
371	0.58
372	0.64
373	0.67
374	0.66
375	0.61
376	0.59
377	0.56
378	0.52
379	0.44
380	0.38
381	0.34
382	0.26
383	0.24
384	0.22
385	0.18
386	0.19
387	0.17
388	0.15
389	0.1
390	0.1
391	0.1
392	0.11
393	0.09
394	0.09
395	0.08
396	0.09
397	0.08
398	0.08
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.06
409	0.07
410	0.12
411	0.17
412	0.2
413	0.23
414	0.25
415	0.25
416	0.25
417	0.28
418	0.29
419	0.27
420	0.27
421	0.25
422	0.27
423	0.27
424	0.26
425	0.24
426	0.2
427	0.19
428	0.16
429	0.16
430	0.16
431	0.18
432	0.19
433	0.18
434	0.17
435	0.18
436	0.2
437	0.2
438	0.2
439	0.19
440	0.19
441	0.22
442	0.23
443	0.23
444	0.24
445	0.25
446	0.22
447	0.22
448	0.21
449	0.18
450	0.16
451	0.14
452	0.13
453	0.13
454	0.12
455	0.11
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.09
460	0.07
461	0.04
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.05
470	0.05
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.06
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.1
488	0.11
489	0.12
490	0.17
491	0.21
492	0.27
493	0.35
494	0.44
495	0.51
496	0.61
497	0.71
498	0.78
499	0.85
500	0.89
501	0.92
502	0.94
503	0.95
504	0.95

C5GBZ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer