Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GCD4

Protein Details
Accession C5GCD4    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-338GTPVRRKKRKGALTNPSAYSHydrophilic
420-444DDRGVHAKRKGAKGKRGKNGNEVVGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
323-328RRKKRK
426-437AKRKGAKGKRGK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRRQWIDKKSATTYQLFHRSQNDPLIHDADADDRVLHRVSGAPITESAPKISKTSKVLAELEKEFEGAQVRKNEGEAANYGIYYDDSQYDYMQHLRDLGGAGSEQSHFVEAAPMKGKGKAKGMKLEDALRETSLDDVEDFRSVHEHDVLSTASTYSRKSTYQDQQDVPDAIAGFQPDMDPRLRETLEALEDDAFVDSDEDGGLFESLVQGGVDAEVDPSEWRDTYIEDDGEGWESDATEKAPEQPSVSTQNAAPPSKGPTNDEQIPDTTAAEGDWLRNFAQYKKDMKTKPSAPGTQGDTGSALPAGTVASTMFTAGGTPVRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERIEALYSLDEEGEDYDDSSMADDMSMVSGMSTVSKVPSLVSGGTPLRSDFNQIMDGFLDDWDDRGVHAKRKGAKGKRGKNGNEVVGIRMLDEIRQGLGPARLPGKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.57
3 0.56
4 0.59
5 0.54
6 0.52
7 0.51
8 0.5
9 0.5
10 0.55
11 0.48
12 0.4
13 0.42
14 0.41
15 0.34
16 0.31
17 0.27
18 0.21
19 0.19
20 0.17
21 0.14
22 0.12
23 0.14
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.14
28 0.16
29 0.19
30 0.19
31 0.18
32 0.19
33 0.22
34 0.26
35 0.23
36 0.24
37 0.24
38 0.24
39 0.26
40 0.28
41 0.32
42 0.32
43 0.37
44 0.38
45 0.4
46 0.43
47 0.44
48 0.46
49 0.42
50 0.41
51 0.35
52 0.31
53 0.25
54 0.22
55 0.24
56 0.2
57 0.24
58 0.25
59 0.27
60 0.27
61 0.28
62 0.31
63 0.25
64 0.27
65 0.22
66 0.21
67 0.2
68 0.19
69 0.18
70 0.14
71 0.14
72 0.12
73 0.12
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.16
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.12
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.13
99 0.12
100 0.16
101 0.18
102 0.19
103 0.2
104 0.25
105 0.29
106 0.27
107 0.35
108 0.37
109 0.4
110 0.47
111 0.5
112 0.49
113 0.48
114 0.49
115 0.43
116 0.4
117 0.36
118 0.28
119 0.24
120 0.2
121 0.18
122 0.13
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.11
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.14
146 0.15
147 0.18
148 0.26
149 0.32
150 0.4
151 0.46
152 0.45
153 0.45
154 0.47
155 0.45
156 0.36
157 0.29
158 0.2
159 0.14
160 0.13
161 0.11
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.1
218 0.09
219 0.1
220 0.09
221 0.07
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.09
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.15
235 0.2
236 0.2
237 0.17
238 0.15
239 0.19
240 0.23
241 0.23
242 0.21
243 0.17
244 0.21
245 0.23
246 0.24
247 0.22
248 0.21
249 0.27
250 0.3
251 0.3
252 0.27
253 0.24
254 0.25
255 0.22
256 0.19
257 0.13
258 0.09
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.1
267 0.12
268 0.13
269 0.19
270 0.24
271 0.29
272 0.32
273 0.41
274 0.42
275 0.45
276 0.51
277 0.51
278 0.53
279 0.54
280 0.52
281 0.46
282 0.47
283 0.47
284 0.42
285 0.37
286 0.29
287 0.23
288 0.2
289 0.18
290 0.13
291 0.09
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.03
296 0.04
297 0.03
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.09
306 0.11
307 0.17
308 0.25
309 0.36
310 0.43
311 0.48
312 0.57
313 0.63
314 0.71
315 0.76
316 0.78
317 0.78
318 0.8
319 0.81
320 0.72
321 0.64
322 0.54
323 0.44
324 0.35
325 0.25
326 0.18
327 0.14
328 0.14
329 0.12
330 0.13
331 0.14
332 0.13
333 0.14
334 0.19
335 0.21
336 0.22
337 0.23
338 0.24
339 0.25
340 0.31
341 0.31
342 0.27
343 0.25
344 0.23
345 0.22
346 0.21
347 0.22
348 0.14
349 0.16
350 0.13
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.11
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.16
387 0.17
388 0.18
389 0.18
390 0.18
391 0.19
392 0.18
393 0.22
394 0.19
395 0.2
396 0.23
397 0.23
398 0.23
399 0.2
400 0.21
401 0.17
402 0.15
403 0.15
404 0.1
405 0.11
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.17
410 0.21
411 0.26
412 0.31
413 0.37
414 0.44
415 0.55
416 0.65
417 0.66
418 0.73
419 0.76
420 0.82
421 0.85
422 0.87
423 0.83
424 0.82
425 0.8
426 0.74
427 0.7
428 0.61
429 0.53
430 0.46
431 0.41
432 0.31
433 0.26
434 0.22
435 0.15
436 0.16
437 0.14
438 0.13
439 0.13
440 0.13
441 0.14
442 0.18
443 0.19
444 0.22