FuNGI

A0A094D0B2

Protein Details

Accession

A0A094D0B2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
428-451	EMKKRLGKSLRKSLRKREKNYTYE	Basic
536-561	ETSGNESTRKKHKKKHMLSSSQPTGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
425-446	KEKEMKKRLGKSLRKSLRKREK
486-490	KEKEK
518-522	HKKHN
544-550	RKKHKKK

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPAGITPNGTPTPNSGGQPPKIIRRAKPDPFATYKKPVARPQAAPRSRQQNQNGLTPLNKKPPAPRPLPRYPGNNPATAPAGPSSSNAPPQPQLDFTRKSNIGEYEDFALTTTKRAMREGLRYHIARFASKKNVDPTNSDDFIKPVSLHRRDPRQPPAGKVAKDEDTVMGEPIDDKEREKQEIARAAKEAQRAADLAQIAPSGNNASALAAKKVQSFKNEKTTQVHRTAQTEEEMKESDLRYEEALPWHLEDAENKHTWVGNYEAALSDTNVIFVIDGTNFRMVPIEKWYKFTPKNQFKTLTIEEAEAEMNKKSKANRWVMHADQQNQEAAERQRGIQAMAGLYSKVKGERPMPKSEARDHDDLDITDDLFQDDDEQATVEPDNDEDTKFAAEKIKREQLGANLFGDADEQEVEEEFKEEAKEKEMKKRLGKSLRKSLRKREKNYTYESDSSNPYSSSSDNETTDDEKQAEEDRKKDEEAKLKEKEKLGLPKIASGASTKGTTTPIGRPRSTDPHKKHNHLKRAGSPNLSASETSGNESTRKKHKKKHMLSSSQPTGTSTPRSGSPHPSSSAPAGGVSPRKSSIVKLHVNSSRLSDIQANAPHPAMSDSEMSDGAGGKRKSGIKLRLGSSASPSRAGSPTNGSRAGSPAQAQGAASPTRPIMADEIAAAIPAEGIAIGMLLKIFSGRIKGNGKDKEDREKFIKLVKENSVFSQEDKLLRPRAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.3
3	0.32
4	0.32
5	0.33
6	0.38
7	0.4
8	0.48
9	0.49
10	0.51
11	0.56
12	0.61
13	0.61
14	0.63
15	0.71
16	0.7
17	0.75
18	0.71
19	0.71
20	0.72
21	0.73
22	0.7
23	0.68
24	0.68
25	0.67
26	0.7
27	0.7
28	0.72
29	0.72
30	0.73
31	0.75
32	0.78
33	0.75
34	0.72
35	0.72
36	0.72
37	0.7
38	0.72
39	0.68
40	0.66
41	0.64
42	0.67
43	0.63
44	0.55
45	0.55
46	0.52
47	0.51
48	0.52
49	0.52
50	0.47
51	0.53
52	0.6
53	0.63
54	0.66
55	0.68
56	0.68
57	0.74
58	0.79
59	0.76
60	0.74
61	0.7
62	0.72
63	0.66
64	0.61
65	0.51
66	0.46
67	0.43
68	0.35
69	0.31
70	0.22
71	0.21
72	0.18
73	0.18
74	0.2
75	0.2
76	0.26
77	0.25
78	0.27
79	0.29
80	0.3
81	0.32
82	0.32
83	0.34
84	0.37
85	0.4
86	0.39
87	0.45
88	0.45
89	0.44
90	0.44
91	0.42
92	0.4
93	0.37
94	0.36
95	0.31
96	0.29
97	0.27
98	0.23
99	0.21
100	0.16
101	0.16
102	0.19
103	0.18
104	0.2
105	0.21
106	0.26
107	0.29
108	0.39
109	0.42
110	0.43
111	0.47
112	0.47
113	0.47
114	0.46
115	0.42
116	0.38
117	0.37
118	0.37
119	0.4
120	0.42
121	0.46
122	0.48
123	0.54
124	0.51
125	0.5
126	0.5
127	0.48
128	0.47
129	0.43
130	0.36
131	0.3
132	0.29
133	0.27
134	0.22
135	0.2
136	0.29
137	0.32
138	0.4
139	0.47
140	0.56
141	0.61
142	0.69
143	0.71
144	0.71
145	0.7
146	0.66
147	0.68
148	0.66
149	0.6
150	0.55
151	0.51
152	0.44
153	0.41
154	0.38
155	0.28
156	0.24
157	0.24
158	0.2
159	0.15
160	0.12
161	0.12
162	0.12
163	0.15
164	0.12
165	0.13
166	0.2
167	0.24
168	0.27
169	0.29
170	0.31
171	0.34
172	0.42
173	0.43
174	0.38
175	0.36
176	0.37
177	0.39
178	0.38
179	0.32
180	0.24
181	0.22
182	0.2
183	0.19
184	0.19
185	0.16
186	0.13
187	0.12
188	0.11
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.06
196	0.07
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.13
201	0.15
202	0.19
203	0.24
204	0.26
205	0.31
206	0.37
207	0.41
208	0.49
209	0.51
210	0.5
211	0.51
212	0.56
213	0.55
214	0.55
215	0.55
216	0.47
217	0.47
218	0.45
219	0.41
220	0.37
221	0.33
222	0.26
223	0.23
224	0.21
225	0.19
226	0.19
227	0.18
228	0.17
229	0.15
230	0.15
231	0.14
232	0.14
233	0.15
234	0.14
235	0.16
236	0.15
237	0.14
238	0.14
239	0.13
240	0.12
241	0.12
242	0.15
243	0.18
244	0.19
245	0.18
246	0.18
247	0.19
248	0.19
249	0.19
250	0.17
251	0.13
252	0.12
253	0.13
254	0.12
255	0.12
256	0.12
257	0.1
258	0.09
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.07
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.1
273	0.09
274	0.1
275	0.17
276	0.25
277	0.24
278	0.28
279	0.31
280	0.37
281	0.4
282	0.47
283	0.51
284	0.53
285	0.58
286	0.59
287	0.61
288	0.54
289	0.57
290	0.51
291	0.43
292	0.34
293	0.28
294	0.23
295	0.2
296	0.19
297	0.12
298	0.11
299	0.09
300	0.09
301	0.1
302	0.12
303	0.13
304	0.19
305	0.28
306	0.36
307	0.37
308	0.42
309	0.47
310	0.47
311	0.52
312	0.5
313	0.45
314	0.38
315	0.37
316	0.31
317	0.25
318	0.23
319	0.2
320	0.17
321	0.16
322	0.15
323	0.14
324	0.16
325	0.17
326	0.17
327	0.14
328	0.13
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.06
336	0.07
337	0.08
338	0.1
339	0.16
340	0.25
341	0.29
342	0.35
343	0.38
344	0.42
345	0.44
346	0.47
347	0.48
348	0.43
349	0.41
350	0.36
351	0.33
352	0.29
353	0.26
354	0.22
355	0.16
356	0.12
357	0.1
358	0.09
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.04
372	0.05
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.13
382	0.14
383	0.17
384	0.23
385	0.29
386	0.28
387	0.29
388	0.3
389	0.29
390	0.32
391	0.3
392	0.24
393	0.18
394	0.18
395	0.16
396	0.15
397	0.09
398	0.06
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.05
404	0.04
405	0.06
406	0.05
407	0.06
408	0.07
409	0.08
410	0.09
411	0.13
412	0.19
413	0.21
414	0.31
415	0.38
416	0.44
417	0.5
418	0.56
419	0.62
420	0.66
421	0.72
422	0.7
423	0.74
424	0.76
425	0.79
426	0.78
427	0.8
428	0.8
429	0.82
430	0.81
431	0.8
432	0.81
433	0.77
434	0.78
435	0.72
436	0.67
437	0.6
438	0.55
439	0.47
440	0.4
441	0.36
442	0.3
443	0.24
444	0.19
445	0.17
446	0.16
447	0.16
448	0.18
449	0.18
450	0.18
451	0.19
452	0.2
453	0.21
454	0.22
455	0.21
456	0.17
457	0.14
458	0.14
459	0.18
460	0.24
461	0.24
462	0.26
463	0.28
464	0.3
465	0.32
466	0.36
467	0.37
468	0.39
469	0.44
470	0.49
471	0.52
472	0.54
473	0.57
474	0.54
475	0.52
476	0.49
477	0.51
478	0.46
479	0.44
480	0.41
481	0.39
482	0.38
483	0.34
484	0.28
485	0.2
486	0.18
487	0.14
488	0.14
489	0.12
490	0.12
491	0.13
492	0.14
493	0.15
494	0.21
495	0.27
496	0.33
497	0.33
498	0.35
499	0.4
500	0.49
501	0.54
502	0.57
503	0.55
504	0.6
505	0.68
506	0.73
507	0.77
508	0.77
509	0.79
510	0.77
511	0.78
512	0.76
513	0.77
514	0.75
515	0.68
516	0.59
517	0.52
518	0.46
519	0.4
520	0.31
521	0.23
522	0.21
523	0.18
524	0.19
525	0.18
526	0.16
527	0.19
528	0.22
529	0.27
530	0.34
531	0.45
532	0.51
533	0.59
534	0.69
535	0.77
536	0.84
537	0.89
538	0.89
539	0.88
540	0.87
541	0.87
542	0.83
543	0.73
544	0.64
545	0.54
546	0.46
547	0.4
548	0.36
549	0.27
550	0.23
551	0.25
552	0.3
553	0.32
554	0.38
555	0.41
556	0.41
557	0.41
558	0.41
559	0.39
560	0.36
561	0.34
562	0.26
563	0.2
564	0.17
565	0.19
566	0.23
567	0.22
568	0.23
569	0.22
570	0.24
571	0.25
572	0.28
573	0.32
574	0.36
575	0.41
576	0.41
577	0.47
578	0.5
579	0.51
580	0.48
581	0.43
582	0.37
583	0.3
584	0.3
585	0.25
586	0.22
587	0.26
588	0.3
589	0.27
590	0.26
591	0.26
592	0.24
593	0.21
594	0.21
595	0.15
596	0.13
597	0.14
598	0.13
599	0.14
600	0.14
601	0.13
602	0.13
603	0.13
604	0.13
605	0.19
606	0.18
607	0.18
608	0.24
609	0.27
610	0.33
611	0.4
612	0.46
613	0.47
614	0.54
615	0.55
616	0.57
617	0.56
618	0.51
619	0.48
620	0.48
621	0.41
622	0.36
623	0.34
624	0.31
625	0.31
626	0.31
627	0.27
628	0.28
629	0.32
630	0.35
631	0.36
632	0.33
633	0.32
634	0.35
635	0.34
636	0.28
637	0.24
638	0.22
639	0.21
640	0.21
641	0.2
642	0.18
643	0.2
644	0.19
645	0.18
646	0.16
647	0.15
648	0.15
649	0.16
650	0.16
651	0.14
652	0.14
653	0.14
654	0.13
655	0.15
656	0.13
657	0.13
658	0.11
659	0.08
660	0.06
661	0.06
662	0.05
663	0.03
664	0.03
665	0.03
666	0.03
667	0.03
668	0.03
669	0.03
670	0.03
671	0.03
672	0.04
673	0.05
674	0.07
675	0.11
676	0.13
677	0.21
678	0.28
679	0.34
680	0.43
681	0.51
682	0.56
683	0.61
684	0.65
685	0.68
686	0.67
687	0.68
688	0.64
689	0.61
690	0.57
691	0.55
692	0.58
693	0.52
694	0.54
695	0.56
696	0.57
697	0.53
698	0.54
699	0.53
700	0.46
701	0.43
702	0.42
703	0.38
704	0.36
705	0.39
706	0.42

A0A094D0B2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer