FuNGI

G4MYD1

Protein Details

Accession

G4MYD1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-54	GESTTPKIPQKSSKQRKKQPSKEDHALPSD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 12, mito 11, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR006224 PsdUridine_synth_RluA-like_CS IPR006225 PsdUridine_synth_RluC/D IPR006145 PsdUridine_synth_RsuA/RluA
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis
KEGG	mgr:MGG_08117 -
Pfam	View protein in Pfam PF00849 PseudoU_synth_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS01129 PSI_RLU
CDD	cd02557 PseudoU_synth_ScRIB2

Amino Acid Sequences

MASVASASAAAAATAATPVVSTASGESTTPKIPQKSSKQRKKQPSKEDHALPSDPEVIWPPPYVIEDGLRRVEPYHFAYRTWVKERWRGRALVDVFESEFRDRPIEYYRECMEKGSVLVNAKKVGPNHILKNGELIAHICHRHEPPCTADPVQVLHEDDEMIVINKPSGMPVHPAGRYNFNSVVEVMRSERSRDFKAYPCNRLDRLTSGIMFIAKTPQAACKMGEQIMGRTVRKEYLARVIGRFPDGEVICNEPILQISPKLGLNRVRANGRHARTVFKRLAYYPPAEGQGNEAKPGEAANGRPWRNKQGYSIVRCLPVTGRTHQIRVHLQHLGHPIENDPIYANYKVWGLNLGANDGDASLNSDEDIISRLSRMGKEDVAEAVAYYDEMVDEYYKKKAEKMSGELCKECDTPLYTDPGSHELSLWLHSLRYEDSGGAWSYSSPMPKWALPPDGMNGPVEVGDMKELVVAVRDTNPELVSADVACET

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.05
3	0.04
4	0.04
5	0.04
6	0.05
7	0.06
8	0.06
9	0.07
10	0.09
11	0.1
12	0.11
13	0.13
14	0.15
15	0.18
16	0.22
17	0.28
18	0.31
19	0.36
20	0.46
21	0.54
22	0.63
23	0.72
24	0.78
25	0.82
26	0.87
27	0.93
28	0.95
29	0.94
30	0.94
31	0.94
32	0.92
33	0.9
34	0.88
35	0.83
36	0.77
37	0.69
38	0.59
39	0.51
40	0.44
41	0.35
42	0.28
43	0.25
44	0.21
45	0.21
46	0.2
47	0.18
48	0.16
49	0.18
50	0.18
51	0.16
52	0.19
53	0.2
54	0.24
55	0.26
56	0.25
57	0.24
58	0.24
59	0.25
60	0.25
61	0.27
62	0.32
63	0.3
64	0.3
65	0.37
66	0.42
67	0.47
68	0.49
69	0.48
70	0.45
71	0.53
72	0.59
73	0.61
74	0.6
75	0.55
76	0.5
77	0.54
78	0.5
79	0.46
80	0.41
81	0.33
82	0.29
83	0.28
84	0.29
85	0.21
86	0.2
87	0.17
88	0.17
89	0.16
90	0.17
91	0.22
92	0.25
93	0.25
94	0.29
95	0.31
96	0.33
97	0.33
98	0.32
99	0.26
100	0.22
101	0.22
102	0.18
103	0.19
104	0.19
105	0.21
106	0.22
107	0.23
108	0.23
109	0.25
110	0.24
111	0.27
112	0.3
113	0.33
114	0.36
115	0.41
116	0.41
117	0.38
118	0.4
119	0.35
120	0.28
121	0.23
122	0.19
123	0.14
124	0.17
125	0.18
126	0.15
127	0.18
128	0.2
129	0.23
130	0.25
131	0.25
132	0.27
133	0.29
134	0.32
135	0.3
136	0.29
137	0.27
138	0.26
139	0.25
140	0.21
141	0.18
142	0.15
143	0.14
144	0.12
145	0.11
146	0.09
147	0.08
148	0.07
149	0.07
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.07
156	0.08
157	0.1
158	0.13
159	0.18
160	0.19
161	0.22
162	0.23
163	0.29
164	0.3
165	0.31
166	0.3
167	0.26
168	0.25
169	0.23
170	0.23
171	0.16
172	0.15
173	0.12
174	0.14
175	0.13
176	0.15
177	0.19
178	0.21
179	0.24
180	0.27
181	0.29
182	0.31
183	0.42
184	0.46
185	0.48
186	0.48
187	0.5
188	0.48
189	0.46
190	0.43
191	0.35
192	0.32
193	0.28
194	0.23
195	0.19
196	0.18
197	0.16
198	0.14
199	0.11
200	0.1
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.11
205	0.13
206	0.14
207	0.14
208	0.14
209	0.16
210	0.17
211	0.19
212	0.17
213	0.15
214	0.19
215	0.21
216	0.19
217	0.17
218	0.18
219	0.15
220	0.17
221	0.17
222	0.14
223	0.19
224	0.23
225	0.23
226	0.24
227	0.24
228	0.23
229	0.23
230	0.21
231	0.14
232	0.15
233	0.14
234	0.14
235	0.12
236	0.15
237	0.14
238	0.14
239	0.13
240	0.08
241	0.08
242	0.09
243	0.08
244	0.06
245	0.06
246	0.08
247	0.1
248	0.1
249	0.14
250	0.18
251	0.22
252	0.26
253	0.28
254	0.3
255	0.3
256	0.35
257	0.4
258	0.37
259	0.4
260	0.36
261	0.4
262	0.39
263	0.45
264	0.42
265	0.36
266	0.36
267	0.31
268	0.36
269	0.33
270	0.31
271	0.26
272	0.24
273	0.24
274	0.23
275	0.21
276	0.19
277	0.22
278	0.2
279	0.2
280	0.18
281	0.16
282	0.16
283	0.16
284	0.14
285	0.09
286	0.1
287	0.17
288	0.24
289	0.27
290	0.31
291	0.34
292	0.4
293	0.43
294	0.44
295	0.4
296	0.43
297	0.49
298	0.5
299	0.53
300	0.46
301	0.44
302	0.42
303	0.39
304	0.3
305	0.27
306	0.25
307	0.23
308	0.29
309	0.28
310	0.32
311	0.32
312	0.36
313	0.38
314	0.37
315	0.38
316	0.34
317	0.32
318	0.34
319	0.38
320	0.35
321	0.29
322	0.26
323	0.23
324	0.23
325	0.22
326	0.18
327	0.13
328	0.13
329	0.15
330	0.16
331	0.15
332	0.12
333	0.13
334	0.13
335	0.13
336	0.13
337	0.11
338	0.13
339	0.13
340	0.13
341	0.12
342	0.11
343	0.11
344	0.09
345	0.08
346	0.05
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.09
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.1
359	0.12
360	0.14
361	0.17
362	0.18
363	0.19
364	0.19
365	0.2
366	0.19
367	0.17
368	0.16
369	0.12
370	0.09
371	0.08
372	0.07
373	0.06
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.06
379	0.08
380	0.1
381	0.14
382	0.17
383	0.18
384	0.22
385	0.27
386	0.34
387	0.39
388	0.45
389	0.51
390	0.56
391	0.6
392	0.57
393	0.53
394	0.49
395	0.42
396	0.35
397	0.29
398	0.24
399	0.23
400	0.24
401	0.28
402	0.24
403	0.25
404	0.27
405	0.27
406	0.27
407	0.23
408	0.21
409	0.17
410	0.18
411	0.19
412	0.18
413	0.14
414	0.13
415	0.13
416	0.15
417	0.14
418	0.15
419	0.15
420	0.13
421	0.14
422	0.17
423	0.17
424	0.15
425	0.14
426	0.11
427	0.13
428	0.16
429	0.18
430	0.15
431	0.19
432	0.22
433	0.24
434	0.3
435	0.33
436	0.35
437	0.33
438	0.35
439	0.35
440	0.35
441	0.34
442	0.29
443	0.23
444	0.19
445	0.17
446	0.15
447	0.11
448	0.08
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.07
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.14
459	0.16
460	0.17
461	0.2
462	0.2
463	0.18
464	0.18
465	0.17
466	0.15
467	0.13

G4MYD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer