Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G4MNZ9

Protein Details
Accession G4MNZ9    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-36VSLVRLKKGKKRFEIACYKNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 21, cyto_mito 13.833, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036786  Ribosome_mat_SBDS_N_sf  
IPR002140  Sdo1/SBDS  
IPR039100  Sdo1/SBDS-like  
IPR046928  SDO1/SBDS_C  
IPR018978  SDO1/SBDS_central  
IPR037188  Sdo1/SBDS_central_sf  
IPR019783  SDO1/SBDS_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:0042256  P:cytosolic ribosome assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG mgr:MGG_05662  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01172  SBDS  
PF20268  SBDS_C  
PF09377  SBDS_domain_II  
Amino Acid Sequences MSRQINQPSNQIKLTNVSLVRLKKGKKRFEIACYKNKVLEWRSGIETDLDNVLQIPNVFLNVSKGQTAPSADLAKAFGKDVPVADVILEILNKGDIQVGDKERAQQLERVHNEVVGIVASKLVDPRTKRVYTTGMIEKALDMLSSQAHTQQQQQQQQNKSAADGKTESSSGTATPTTAAASENGEAAGGKSSKLLWTGVVTTKNAKLQALEAMKALIAHQPIPVARARMRLRIACSTSVLKQAVKAPKTEDGEQKAPGTVKDKILGYIEQVENQDVVGSEWEVTGFVEPGAFKAVSDFIGNETKGQGRVEVLDMAVTHED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.36
3 0.31
4 0.3
5 0.33
6 0.35
7 0.4
8 0.43
9 0.47
10 0.49
11 0.58
12 0.65
13 0.67
14 0.73
15 0.73
16 0.76
17 0.8
18 0.8
19 0.8
20 0.78
21 0.71
22 0.66
23 0.61
24 0.59
25 0.51
26 0.51
27 0.46
28 0.42
29 0.43
30 0.39
31 0.38
32 0.31
33 0.28
34 0.22
35 0.19
36 0.15
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.17
54 0.18
55 0.16
56 0.18
57 0.19
58 0.18
59 0.18
60 0.19
61 0.18
62 0.17
63 0.16
64 0.13
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.08
84 0.13
85 0.16
86 0.18
87 0.19
88 0.22
89 0.22
90 0.25
91 0.24
92 0.22
93 0.25
94 0.32
95 0.34
96 0.34
97 0.32
98 0.3
99 0.29
100 0.24
101 0.2
102 0.1
103 0.09
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.08
110 0.12
111 0.13
112 0.19
113 0.26
114 0.27
115 0.27
116 0.29
117 0.31
118 0.29
119 0.33
120 0.33
121 0.27
122 0.26
123 0.25
124 0.22
125 0.19
126 0.17
127 0.11
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.14
137 0.21
138 0.27
139 0.35
140 0.42
141 0.46
142 0.48
143 0.52
144 0.51
145 0.44
146 0.39
147 0.37
148 0.3
149 0.25
150 0.23
151 0.19
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.1
156 0.1
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.07
183 0.08
184 0.11
185 0.14
186 0.16
187 0.16
188 0.18
189 0.2
190 0.21
191 0.21
192 0.19
193 0.16
194 0.15
195 0.21
196 0.2
197 0.18
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.24
214 0.26
215 0.31
216 0.35
217 0.37
218 0.39
219 0.43
220 0.44
221 0.37
222 0.37
223 0.34
224 0.32
225 0.34
226 0.32
227 0.25
228 0.24
229 0.3
230 0.36
231 0.34
232 0.34
233 0.32
234 0.37
235 0.42
236 0.44
237 0.44
238 0.43
239 0.44
240 0.45
241 0.42
242 0.38
243 0.34
244 0.31
245 0.28
246 0.25
247 0.25
248 0.27
249 0.26
250 0.25
251 0.27
252 0.25
253 0.23
254 0.26
255 0.25
256 0.23
257 0.24
258 0.23
259 0.2
260 0.2
261 0.18
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.12
278 0.12
279 0.1
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.19
287 0.2
288 0.19
289 0.2
290 0.22
291 0.24
292 0.24
293 0.21
294 0.17
295 0.19
296 0.21
297 0.19
298 0.16
299 0.15
300 0.15