Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q52C47

Protein Details
Accession Q52C47    Localization Confidence High Confidence Score 25.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-247NNEAKVYKPEIKKRKRDGYEEGBasic
369-397ELEKLKERNSTKKKRERRKENERKQKDIVBasic
613-635KADSKKTKEKTADKKAAKKAKKABasic
751-785RAFNARPIKKVREAKGRKKMKAAQRLEKLKKKSDLBasic
798-824AESIAKLLRKATKKKPKQAVKVVVAKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-23KHGKGRLDKWYKLAKEKG
374-393KERNSTKKKRERRKENERKQ
616-637SKKTKEKTADKKAAKKAKKAAQ
736-782KPITKAAAAAIKEKMRAFNARPIKKVREAKGRKKMKAAQRLEKLKKK
801-865IAKLLRKATKKKPKQAVKVVVAKGANRGIKGRPQGIKGRYKIVDPRMKKEMRALKRVAQKAKKRR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG mgr:MGG_08140  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MAIQKKHGKGRLDKWYKLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYGFLEKSKVLLDLCAAPGSWCQVAAEVMPVSSLIVGVDLAPIKPIPKVITFQSDITTEKCRATIRQHLKTWKADTVLHDGAPNVGTAWVQDSFNQAELTLQAMKLATEFLVEGGTFVTKVFRSKDYNSMLWVFNQLFKKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCRGFKAPKRIDPKFLDPRAVFAELADPTPNNEAKVYKPEIKKRKRDGYEEGDYTQYKELPAYEFIQSTDPIAILGSTNRLSLEQSKNGDVALAVLEKLPETTDEIRTCCADLKVLGRKEFKLLLKWRLAVREKLGFPTKKSVKKEEEAAAAVAAAEEVAKIESMDEEMRIQHELEKLKERNSTKKKRERRKENERKQKDIVRMQMHMVAPMDIGVEQAGPEGEDAMFALRAVEKGDVMRRLAKGKMVVASEADAKKDRDSGIGSSGETDDESDEELDRLETELDDMYDQFRERKAASDAKYRAKKARQARNGDGDEEWEGVSDNEKADEISDDSELEEESSGDSDDEDDTAPRKSLLTDLDTTPSDNSGLSKRARAFFNQDIFKELDGDMDEPMDEELRAALAGEDEDADMEDTVSKADSKKTKEKTADKKAAKKAKKAAQKAQQVKDDDSDDESDGGFEVVKSGKEDDWEDEDKRTKDGRLDIDIITAEAMTLAHQLATGQKSSHDVIDDGFNKHAFKDREGLPEWFLDDETKHDKPQKPITKAAAAAIKEKMRAFNARPIKKVREAKGRKKMKAAQRLEKLKKKSDLLVNEEGMTEKEKAESIAKLLRKATKKKPKQAVKVVVAKGANRGIKGRPQGIKGRYKIVDPRMKKEMRALKRVAQKAKKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.75
3 0.73
4 0.72
5 0.71
6 0.7
7 0.71
8 0.77
9 0.79
10 0.77
11 0.78
12 0.73
13 0.74
14 0.67
15 0.65
16 0.59
17 0.55
18 0.57
19 0.57
20 0.62
21 0.57
22 0.61
23 0.55
24 0.54
25 0.51
26 0.47
27 0.47
28 0.43
29 0.46
30 0.43
31 0.44
32 0.41
33 0.42
34 0.35
35 0.29
36 0.26
37 0.23
38 0.21
39 0.18
40 0.17
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.16
45 0.13
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.12
50 0.14
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.14
70 0.15
71 0.17
72 0.21
73 0.23
74 0.3
75 0.32
76 0.33
77 0.32
78 0.31
79 0.3
80 0.29
81 0.3
82 0.25
83 0.24
84 0.25
85 0.26
86 0.29
87 0.34
88 0.42
89 0.48
90 0.55
91 0.61
92 0.67
93 0.72
94 0.74
95 0.71
96 0.65
97 0.58
98 0.52
99 0.49
100 0.48
101 0.44
102 0.37
103 0.32
104 0.28
105 0.26
106 0.22
107 0.18
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.15
117 0.16
118 0.17
119 0.17
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.15
124 0.13
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.09
144 0.12
145 0.15
146 0.2
147 0.25
148 0.29
149 0.38
150 0.41
151 0.42
152 0.42
153 0.42
154 0.38
155 0.33
156 0.34
157 0.26
158 0.26
159 0.27
160 0.25
161 0.23
162 0.23
163 0.27
164 0.28
165 0.33
166 0.36
167 0.41
168 0.48
169 0.53
170 0.57
171 0.6
172 0.61
173 0.6
174 0.53
175 0.52
176 0.44
177 0.38
178 0.35
179 0.28
180 0.23
181 0.19
182 0.17
183 0.11
184 0.1
185 0.12
186 0.17
187 0.2
188 0.29
189 0.35
190 0.43
191 0.52
192 0.56
193 0.62
194 0.62
195 0.67
196 0.67
197 0.64
198 0.63
199 0.53
200 0.53
201 0.49
202 0.44
203 0.34
204 0.24
205 0.25
206 0.18
207 0.19
208 0.17
209 0.13
210 0.12
211 0.17
212 0.17
213 0.14
214 0.15
215 0.16
216 0.17
217 0.24
218 0.28
219 0.32
220 0.39
221 0.48
222 0.58
223 0.66
224 0.74
225 0.77
226 0.82
227 0.81
228 0.8
229 0.79
230 0.76
231 0.74
232 0.66
233 0.57
234 0.51
235 0.44
236 0.39
237 0.32
238 0.24
239 0.17
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.15
247 0.16
248 0.17
249 0.16
250 0.15
251 0.12
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.17
265 0.22
266 0.24
267 0.26
268 0.27
269 0.27
270 0.26
271 0.25
272 0.17
273 0.13
274 0.09
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.09
284 0.11
285 0.16
286 0.18
287 0.19
288 0.2
289 0.2
290 0.21
291 0.19
292 0.16
293 0.12
294 0.12
295 0.17
296 0.24
297 0.27
298 0.32
299 0.32
300 0.33
301 0.35
302 0.39
303 0.34
304 0.35
305 0.37
306 0.39
307 0.4
308 0.42
309 0.41
310 0.44
311 0.45
312 0.4
313 0.38
314 0.37
315 0.35
316 0.36
317 0.43
318 0.36
319 0.35
320 0.42
321 0.46
322 0.47
323 0.51
324 0.54
325 0.52
326 0.53
327 0.57
328 0.5
329 0.46
330 0.39
331 0.35
332 0.26
333 0.2
334 0.17
335 0.11
336 0.07
337 0.04
338 0.02
339 0.02
340 0.02
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.13
356 0.15
357 0.17
358 0.25
359 0.26
360 0.28
361 0.35
362 0.35
363 0.42
364 0.51
365 0.59
366 0.61
367 0.7
368 0.77
369 0.82
370 0.9
371 0.9
372 0.9
373 0.92
374 0.93
375 0.93
376 0.94
377 0.9
378 0.85
379 0.8
380 0.75
381 0.71
382 0.66
383 0.63
384 0.55
385 0.49
386 0.44
387 0.43
388 0.36
389 0.29
390 0.23
391 0.16
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.03
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.14
422 0.14
423 0.17
424 0.17
425 0.18
426 0.16
427 0.16
428 0.18
429 0.16
430 0.15
431 0.13
432 0.13
433 0.16
434 0.15
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.14
439 0.16
440 0.15
441 0.12
442 0.14
443 0.13
444 0.14
445 0.15
446 0.14
447 0.13
448 0.13
449 0.11
450 0.09
451 0.09
452 0.06
453 0.05
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.07
472 0.08
473 0.08
474 0.1
475 0.1
476 0.13
477 0.17
478 0.23
479 0.25
480 0.33
481 0.37
482 0.44
483 0.5
484 0.5
485 0.53
486 0.52
487 0.57
488 0.57
489 0.63
490 0.63
491 0.65
492 0.67
493 0.69
494 0.65
495 0.58
496 0.49
497 0.4
498 0.32
499 0.24
500 0.19
501 0.1
502 0.09
503 0.07
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.06
520 0.05
521 0.04
522 0.04
523 0.05
524 0.05
525 0.04
526 0.04
527 0.05
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.07
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.1
539 0.12
540 0.15
541 0.16
542 0.17
543 0.2
544 0.2
545 0.2
546 0.18
547 0.16
548 0.12
549 0.1
550 0.11
551 0.1
552 0.15
553 0.15
554 0.2
555 0.23
556 0.27
557 0.29
558 0.3
559 0.35
560 0.37
561 0.43
562 0.42
563 0.39
564 0.37
565 0.37
566 0.34
567 0.28
568 0.21
569 0.15
570 0.12
571 0.13
572 0.1
573 0.09
574 0.08
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.05
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.05
593 0.04
594 0.04
595 0.05
596 0.04
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.07
601 0.13
602 0.2
603 0.26
604 0.36
605 0.41
606 0.5
607 0.58
608 0.67
609 0.71
610 0.76
611 0.8
612 0.78
613 0.82
614 0.83
615 0.84
616 0.81
617 0.78
618 0.76
619 0.74
620 0.76
621 0.75
622 0.75
623 0.74
624 0.78
625 0.79
626 0.77
627 0.75
628 0.69
629 0.62
630 0.56
631 0.48
632 0.39
633 0.32
634 0.27
635 0.21
636 0.18
637 0.16
638 0.13
639 0.11
640 0.1
641 0.07
642 0.05
643 0.06
644 0.07
645 0.08
646 0.09
647 0.11
648 0.11
649 0.14
650 0.16
651 0.17
652 0.22
653 0.26
654 0.26
655 0.29
656 0.35
657 0.33
658 0.36
659 0.35
660 0.31
661 0.32
662 0.37
663 0.37
664 0.36
665 0.38
666 0.34
667 0.33
668 0.31
669 0.26
670 0.19
671 0.14
672 0.09
673 0.06
674 0.05
675 0.04
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.1
682 0.12
683 0.13
684 0.12
685 0.13
686 0.17
687 0.18
688 0.19
689 0.16
690 0.14
691 0.14
692 0.22
693 0.24
694 0.22
695 0.23
696 0.23
697 0.22
698 0.23
699 0.3
700 0.24
701 0.24
702 0.29
703 0.31
704 0.37
705 0.41
706 0.42
707 0.35
708 0.34
709 0.33
710 0.27
711 0.23
712 0.17
713 0.14
714 0.17
715 0.22
716 0.23
717 0.28
718 0.36
719 0.41
720 0.48
721 0.58
722 0.63
723 0.62
724 0.67
725 0.68
726 0.65
727 0.6
728 0.56
729 0.51
730 0.42
731 0.4
732 0.38
733 0.34
734 0.32
735 0.33
736 0.32
737 0.3
738 0.36
739 0.36
740 0.4
741 0.49
742 0.51
743 0.56
744 0.6
745 0.63
746 0.66
747 0.71
748 0.7
749 0.71
750 0.76
751 0.8
752 0.84
753 0.87
754 0.82
755 0.83
756 0.83
757 0.82
758 0.82
759 0.81
760 0.8
761 0.8
762 0.86
763 0.86
764 0.87
765 0.84
766 0.82
767 0.79
768 0.73
769 0.71
770 0.69
771 0.67
772 0.65
773 0.65
774 0.57
775 0.51
776 0.47
777 0.39
778 0.32
779 0.27
780 0.2
781 0.14
782 0.13
783 0.13
784 0.15
785 0.18
786 0.18
787 0.19
788 0.26
789 0.29
790 0.32
791 0.37
792 0.43
793 0.49
794 0.57
795 0.64
796 0.68
797 0.75
798 0.82
799 0.87
800 0.89
801 0.91
802 0.92
803 0.91
804 0.89
805 0.88
806 0.8
807 0.75
808 0.67
809 0.57
810 0.52
811 0.48
812 0.42
813 0.34
814 0.36
815 0.34
816 0.4
817 0.46
818 0.49
819 0.48
820 0.52
821 0.59
822 0.64
823 0.69
824 0.65
825 0.67
826 0.6
827 0.6
828 0.63
829 0.64
830 0.66
831 0.61
832 0.65
833 0.66
834 0.67
835 0.64
836 0.65
837 0.65
838 0.63
839 0.67
840 0.65
841 0.63
842 0.7
843 0.77
844 0.78
845 0.78