FuNGI

G4N973

Protein Details

Accession

G4N973

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
30-56	NGFPEHKKRTRVSAFKRQKQQEQSGAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0005665 C:RNA polymerase II, core complex GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	mgr:MGG_03321 -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

METTLRVLDVREKETGSQVRPPAFPTPKPNGFPEHKKRTRVSAFKRQKQQEQSGATPNSGAGTSQSSFPSGSPSEDGPNNDQDRPHFDSERRRIDKENRERLAAMSAEDIAEAQSEILQLDPSLIQMLLRRANLDEKPAGPDPFAGDNSTETAASKSDATGQVPPKSTSCSKPEDESNGDPKGASAENEAPAPKKKTVSFAPTVEDDEPDAEEPAPRPEIPDQVLPTNTTHFPHPANPPDLDPADPNFLETLHSKYFPNLPADPARLAWMAPVPTEDSPADRESPYYPGQTSLAVSQLRFDFQGRLLPPRVSRKIPVSLGLHHHGEAPEAAGYTVGELSRLARSAVPAQRCIAFQTLGRILFRLGKGEWGVGEGTMGMGIFRCVSEGRVLDSLKEAAAVEEGVGHRSSRAYAIEALWLYEKGGWTKSFKGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.44
3	0.39
4	0.41
5	0.44
6	0.45
7	0.45
8	0.47
9	0.49
10	0.49
11	0.51
12	0.52
13	0.56
14	0.59
15	0.62
16	0.61
17	0.6
18	0.62
19	0.67
20	0.69
21	0.71
22	0.7
23	0.75
24	0.75
25	0.77
26	0.79
27	0.78
28	0.77
29	0.77
30	0.81
31	0.82
32	0.89
33	0.87
34	0.86
35	0.85
36	0.84
37	0.82
38	0.78
39	0.73
40	0.72
41	0.65
42	0.56
43	0.46
44	0.37
45	0.29
46	0.22
47	0.17
48	0.1
49	0.12
50	0.13
51	0.15
52	0.16
53	0.16
54	0.16
55	0.16
56	0.2
57	0.17
58	0.19
59	0.18
60	0.2
61	0.23
62	0.25
63	0.29
64	0.27
65	0.34
66	0.35
67	0.35
68	0.35
69	0.33
70	0.36
71	0.39
72	0.4
73	0.36
74	0.38
75	0.47
76	0.55
77	0.64
78	0.62
79	0.59
80	0.62
81	0.67
82	0.73
83	0.73
84	0.75
85	0.66
86	0.64
87	0.61
88	0.54
89	0.49
90	0.38
91	0.28
92	0.18
93	0.16
94	0.13
95	0.12
96	0.11
97	0.07
98	0.06
99	0.05
100	0.04
101	0.04
102	0.05
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.04
107	0.05
108	0.05
109	0.05
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.09
114	0.12
115	0.15
116	0.15
117	0.16
118	0.17
119	0.22
120	0.23
121	0.24
122	0.23
123	0.2
124	0.25
125	0.27
126	0.26
127	0.21
128	0.21
129	0.19
130	0.2
131	0.2
132	0.15
133	0.13
134	0.13
135	0.14
136	0.14
137	0.12
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.08
143	0.07
144	0.11
145	0.12
146	0.13
147	0.18
148	0.22
149	0.26
150	0.28
151	0.29
152	0.25
153	0.29
154	0.31
155	0.29
156	0.3
157	0.31
158	0.31
159	0.33
160	0.35
161	0.35
162	0.37
163	0.36
164	0.36
165	0.32
166	0.3
167	0.27
168	0.23
169	0.21
170	0.16
171	0.12
172	0.11
173	0.12
174	0.13
175	0.14
176	0.15
177	0.14
178	0.18
179	0.21
180	0.2
181	0.21
182	0.21
183	0.25
184	0.29
185	0.34
186	0.34
187	0.32
188	0.32
189	0.3
190	0.31
191	0.26
192	0.22
193	0.16
194	0.12
195	0.11
196	0.09
197	0.09
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.08
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.11
206	0.14
207	0.15
208	0.17
209	0.17
210	0.17
211	0.18
212	0.18
213	0.17
214	0.17
215	0.16
216	0.14
217	0.14
218	0.14
219	0.15
220	0.18
221	0.23
222	0.25
223	0.26
224	0.26
225	0.26
226	0.27
227	0.26
228	0.22
229	0.19
230	0.16
231	0.16
232	0.15
233	0.14
234	0.11
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.14
239	0.13
240	0.14
241	0.14
242	0.16
243	0.2
244	0.21
245	0.25
246	0.21
247	0.23
248	0.25
249	0.27
250	0.26
251	0.22
252	0.21
253	0.17
254	0.16
255	0.13
256	0.12
257	0.1
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.13
263	0.12
264	0.12
265	0.14
266	0.16
267	0.17
268	0.14
269	0.16
270	0.15
271	0.19
272	0.2
273	0.19
274	0.18
275	0.17
276	0.18
277	0.17
278	0.17
279	0.13
280	0.16
281	0.15
282	0.14
283	0.15
284	0.15
285	0.15
286	0.15
287	0.16
288	0.13
289	0.13
290	0.19
291	0.18
292	0.23
293	0.25
294	0.27
295	0.31
296	0.39
297	0.43
298	0.4
299	0.43
300	0.43
301	0.47
302	0.45
303	0.46
304	0.39
305	0.39
306	0.41
307	0.41
308	0.37
309	0.3
310	0.31
311	0.25
312	0.23
313	0.19
314	0.14
315	0.11
316	0.1
317	0.09
318	0.07
319	0.07
320	0.06
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.09
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.12
331	0.2
332	0.26
333	0.28
334	0.29
335	0.3
336	0.32
337	0.31
338	0.32
339	0.26
340	0.21
341	0.19
342	0.23
343	0.26
344	0.26
345	0.26
346	0.23
347	0.22
348	0.26
349	0.26
350	0.23
351	0.19
352	0.21
353	0.22
354	0.22
355	0.21
356	0.17
357	0.16
358	0.12
359	0.12
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.13
373	0.14
374	0.17
375	0.21
376	0.22
377	0.21
378	0.24
379	0.23
380	0.19
381	0.19
382	0.15
383	0.11
384	0.11
385	0.1
386	0.08
387	0.11
388	0.11
389	0.12
390	0.13
391	0.13
392	0.13
393	0.14
394	0.15
395	0.14
396	0.15
397	0.16
398	0.18
399	0.19
400	0.24
401	0.23
402	0.23
403	0.22
404	0.2
405	0.18
406	0.18
407	0.19
408	0.17
409	0.21
410	0.23
411	0.26

G4N973

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer