FuNGI

C5GV43

Protein Details

Accession

C5GV43

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-136	PASGRTNKTRVRRIVRMRKRNVAKRGGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
112-134	GRTNKTRVRRIVRMRKRNVAKRG

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009071 HMG_box_dom IPR036910 HMG_box_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00505 HMG_box
PROSITE	View protein in PROSITE PS50118 HMG_BOX_2
CDD	cd01389 HMG-box_ROX1-like

Amino Acid Sequences

MSNTHPPSPPLSIDGELSRTIGVCSIQQAGLPFFQNRLQVDSLYTQMTPSPTLQYTRIEVDPHREPIIAGDYGVLGPYRNGDEVVYPQTAPLRTPESPLGSPNRTVSRPASGRTNKTRVRRIVRMRKRNVAKRGGPDEILVPRPLSELTKGMRIPVRNMELHVMRSTEQRQKEVEKKNGKIARPMNSFMLYRSAYAEATKEWCAQNNHQVVSRVAGLSWPKEPKEVRDYYERLANIERDNHDKAHPNYKFAPNKSANTPKKKKALTMKEEEHSDVSDHGITMAPSYQNPVRHVSGASFQDGSFRSRTPTPIDRDSSYDSRQGTPFEQIGDVYLNGDMNRSSWQMSNPGRPHPGMFSPPEQQHYYQPSIHQSTLGPNIEDVTFKKMGVPGMQYDGPVALAGLPGNAHPDLLQQQPLPQSRTPVSLNVLQVDPQLFEFDGQPNLSSSDGTSYEGPIDMWQMPNVEQQFARSGLPSQEDERYISQSGFHPGLQQPMDGREVWNENQVDAGGQFEDWISTGPPFEYGNSQQKHL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.27
3	0.24
4	0.23
5	0.2
6	0.16
7	0.15
8	0.14
9	0.12
10	0.11
11	0.13
12	0.15
13	0.15
14	0.16
15	0.17
16	0.18
17	0.2
18	0.22
19	0.2
20	0.2
21	0.23
22	0.27
23	0.26
24	0.28
25	0.27
26	0.25
27	0.27
28	0.27
29	0.26
30	0.23
31	0.22
32	0.17
33	0.18
34	0.19
35	0.18
36	0.17
37	0.2
38	0.2
39	0.24
40	0.26
41	0.27
42	0.28
43	0.3
44	0.31
45	0.29
46	0.29
47	0.33
48	0.36
49	0.36
50	0.35
51	0.31
52	0.29
53	0.28
54	0.31
55	0.24
56	0.18
57	0.15
58	0.13
59	0.13
60	0.14
61	0.11
62	0.06
63	0.06
64	0.08
65	0.1
66	0.1
67	0.1
68	0.1
69	0.12
70	0.15
71	0.19
72	0.19
73	0.17
74	0.17
75	0.21
76	0.21
77	0.2
78	0.2
79	0.22
80	0.21
81	0.26
82	0.29
83	0.3
84	0.31
85	0.35
86	0.39
87	0.35
88	0.37
89	0.37
90	0.39
91	0.34
92	0.37
93	0.35
94	0.37
95	0.37
96	0.38
97	0.43
98	0.45
99	0.52
100	0.58
101	0.65
102	0.62
103	0.68
104	0.74
105	0.73
106	0.75
107	0.76
108	0.78
109	0.8
110	0.84
111	0.87
112	0.85
113	0.85
114	0.87
115	0.87
116	0.85
117	0.83
118	0.79
119	0.77
120	0.75
121	0.68
122	0.58
123	0.5
124	0.44
125	0.38
126	0.34
127	0.26
128	0.2
129	0.17
130	0.17
131	0.17
132	0.15
133	0.13
134	0.15
135	0.16
136	0.21
137	0.21
138	0.24
139	0.27
140	0.27
141	0.29
142	0.31
143	0.34
144	0.29
145	0.3
146	0.31
147	0.29
148	0.29
149	0.27
150	0.22
151	0.18
152	0.22
153	0.26
154	0.29
155	0.3
156	0.31
157	0.33
158	0.39
159	0.47
160	0.52
161	0.56
162	0.57
163	0.58
164	0.64
165	0.67
166	0.61
167	0.6
168	0.57
169	0.57
170	0.52
171	0.52
172	0.45
173	0.41
174	0.4
175	0.32
176	0.31
177	0.22
178	0.19
179	0.18
180	0.17
181	0.14
182	0.15
183	0.15
184	0.11
185	0.13
186	0.14
187	0.15
188	0.15
189	0.19
190	0.23
191	0.25
192	0.33
193	0.34
194	0.33
195	0.33
196	0.34
197	0.29
198	0.27
199	0.25
200	0.17
201	0.12
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.16
206	0.17
207	0.17
208	0.22
209	0.22
210	0.25
211	0.32
212	0.33
213	0.31
214	0.36
215	0.38
216	0.35
217	0.39
218	0.34
219	0.27
220	0.27
221	0.26
222	0.2
223	0.22
224	0.22
225	0.23
226	0.24
227	0.24
228	0.24
229	0.29
230	0.3
231	0.36
232	0.35
233	0.34
234	0.37
235	0.44
236	0.48
237	0.43
238	0.49
239	0.43
240	0.45
241	0.47
242	0.53
243	0.52
244	0.57
245	0.63
246	0.6
247	0.64
248	0.63
249	0.62
250	0.62
251	0.64
252	0.6
253	0.61
254	0.59
255	0.53
256	0.53
257	0.48
258	0.38
259	0.29
260	0.22
261	0.14
262	0.11
263	0.09
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.09
273	0.11
274	0.14
275	0.16
276	0.2
277	0.19
278	0.2
279	0.2
280	0.19
281	0.21
282	0.19
283	0.19
284	0.15
285	0.14
286	0.17
287	0.18
288	0.19
289	0.15
290	0.15
291	0.16
292	0.17
293	0.19
294	0.22
295	0.27
296	0.31
297	0.35
298	0.38
299	0.36
300	0.39
301	0.42
302	0.4
303	0.35
304	0.34
305	0.29
306	0.29
307	0.28
308	0.27
309	0.23
310	0.22
311	0.2
312	0.17
313	0.16
314	0.13
315	0.13
316	0.12
317	0.1
318	0.08
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.08
326	0.08
327	0.1
328	0.1
329	0.12
330	0.2
331	0.23
332	0.31
333	0.32
334	0.36
335	0.38
336	0.37
337	0.37
338	0.32
339	0.32
340	0.27
341	0.27
342	0.26
343	0.29
344	0.31
345	0.34
346	0.33
347	0.32
348	0.34
349	0.36
350	0.36
351	0.32
352	0.32
353	0.35
354	0.36
355	0.35
356	0.3
357	0.25
358	0.25
359	0.3
360	0.29
361	0.23
362	0.18
363	0.2
364	0.19
365	0.19
366	0.16
367	0.16
368	0.15
369	0.15
370	0.17
371	0.17
372	0.19
373	0.2
374	0.21
375	0.17
376	0.2
377	0.21
378	0.19
379	0.17
380	0.16
381	0.13
382	0.11
383	0.09
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.1
395	0.13
396	0.15
397	0.18
398	0.15
399	0.19
400	0.26
401	0.31
402	0.33
403	0.3
404	0.34
405	0.33
406	0.37
407	0.35
408	0.31
409	0.3
410	0.31
411	0.31
412	0.28
413	0.27
414	0.23
415	0.23
416	0.2
417	0.17
418	0.13
419	0.13
420	0.11
421	0.11
422	0.12
423	0.13
424	0.15
425	0.14
426	0.15
427	0.14
428	0.15
429	0.15
430	0.13
431	0.11
432	0.12
433	0.13
434	0.14
435	0.14
436	0.14
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.11
441	0.13
442	0.13
443	0.13
444	0.14
445	0.14
446	0.15
447	0.21
448	0.22
449	0.21
450	0.2
451	0.21
452	0.23
453	0.23
454	0.23
455	0.18
456	0.19
457	0.2
458	0.23
459	0.24
460	0.24
461	0.26
462	0.27
463	0.29
464	0.29
465	0.3
466	0.28
467	0.25
468	0.25
469	0.23
470	0.27
471	0.25
472	0.23
473	0.25
474	0.25
475	0.32
476	0.3
477	0.29
478	0.25
479	0.26
480	0.29
481	0.24
482	0.24
483	0.22
484	0.26
485	0.27
486	0.32
487	0.29
488	0.27
489	0.27
490	0.26
491	0.21
492	0.16
493	0.16
494	0.09
495	0.08
496	0.09
497	0.08
498	0.08
499	0.07
500	0.09
501	0.08
502	0.09
503	0.1
504	0.1
505	0.12
506	0.12
507	0.14
508	0.19
509	0.26
510	0.35

C5GV43

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer