Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GA47

Protein Details
Accession C5GA47    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-104PTAAERKDKEREHREPRDHRHRKRRRIAGENETDRDBasic
276-307EEERRERGDSSRHRRERRRRRRRGSDGSLDSLBasic
353-374GNSHSHRSSRDQDKDRAKRSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-95ERKDKEREHREPRDHRHRKRRRI
248-299RGVRQLREVEKERKKWEEERRRELKALKEEERRERGDSSRHRRERRRRRRRG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MVLHLLGKKSWNVYNTDNIARVRRDEAEAKARGEEEQRRLQEIDAEKRIQVLRGLRSPSRSPPPVQEAPTAAERKDKEREHREPRDHRHRKRRRIAGENETDRDIRFAREDAQRAETKRENDVVLVRKPSKDDAPIIDDSGHINLFPEPAAIDAITGSSGKNPEAEEEAAKKKLEYEDQYTMRFSNAAGFKQSLDKGPWYSSSAVDIAAKTAEDMLPSKDVWGNEDPRRQERERARTDMNDPLAAMKRGVRQLREVEKERKKWEEERRRELKALKEEERRERGDSSRHRRERRRRRRRGSDGSLDSLEGFRLDAETQPAGSGRDRDRELSRNPHRERGERSQEERSKHSRAYGNSHSHRSSRDQDKDRAKRSSSDDRLSSWAPAPGKRYSAQFADV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.44
3 0.45
4 0.45
5 0.44
6 0.47
7 0.44
8 0.43
9 0.39
10 0.36
11 0.38
12 0.37
13 0.41
14 0.44
15 0.46
16 0.45
17 0.42
18 0.4
19 0.37
20 0.4
21 0.42
22 0.4
23 0.45
24 0.45
25 0.47
26 0.47
27 0.45
28 0.45
29 0.44
30 0.46
31 0.43
32 0.43
33 0.39
34 0.42
35 0.43
36 0.37
37 0.34
38 0.32
39 0.32
40 0.37
41 0.43
42 0.41
43 0.46
44 0.48
45 0.51
46 0.54
47 0.52
48 0.49
49 0.51
50 0.56
51 0.57
52 0.56
53 0.51
54 0.44
55 0.43
56 0.47
57 0.42
58 0.34
59 0.34
60 0.33
61 0.35
62 0.42
63 0.45
64 0.48
65 0.56
66 0.66
67 0.69
68 0.78
69 0.82
70 0.84
71 0.88
72 0.89
73 0.9
74 0.91
75 0.91
76 0.92
77 0.93
78 0.93
79 0.92
80 0.91
81 0.9
82 0.88
83 0.87
84 0.86
85 0.81
86 0.73
87 0.65
88 0.56
89 0.46
90 0.39
91 0.3
92 0.21
93 0.17
94 0.16
95 0.19
96 0.25
97 0.28
98 0.29
99 0.33
100 0.36
101 0.36
102 0.41
103 0.4
104 0.37
105 0.37
106 0.37
107 0.32
108 0.29
109 0.33
110 0.32
111 0.31
112 0.35
113 0.33
114 0.32
115 0.33
116 0.35
117 0.32
118 0.3
119 0.29
120 0.25
121 0.29
122 0.28
123 0.27
124 0.24
125 0.21
126 0.18
127 0.17
128 0.13
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.12
152 0.13
153 0.13
154 0.16
155 0.19
156 0.2
157 0.2
158 0.19
159 0.18
160 0.19
161 0.22
162 0.22
163 0.25
164 0.3
165 0.32
166 0.34
167 0.32
168 0.3
169 0.25
170 0.22
171 0.15
172 0.14
173 0.15
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.18
179 0.19
180 0.15
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.12
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.11
208 0.14
209 0.17
210 0.22
211 0.26
212 0.31
213 0.33
214 0.36
215 0.42
216 0.4
217 0.44
218 0.48
219 0.53
220 0.54
221 0.56
222 0.54
223 0.51
224 0.52
225 0.5
226 0.42
227 0.32
228 0.26
229 0.24
230 0.24
231 0.21
232 0.18
233 0.15
234 0.18
235 0.24
236 0.27
237 0.25
238 0.27
239 0.34
240 0.41
241 0.46
242 0.48
243 0.52
244 0.58
245 0.63
246 0.64
247 0.62
248 0.59
249 0.62
250 0.66
251 0.67
252 0.68
253 0.72
254 0.74
255 0.72
256 0.72
257 0.68
258 0.65
259 0.63
260 0.6
261 0.58
262 0.6
263 0.62
264 0.67
265 0.68
266 0.63
267 0.56
268 0.52
269 0.49
270 0.5
271 0.54
272 0.55
273 0.6
274 0.67
275 0.73
276 0.8
277 0.88
278 0.89
279 0.9
280 0.92
281 0.92
282 0.94
283 0.95
284 0.96
285 0.95
286 0.93
287 0.91
288 0.85
289 0.78
290 0.68
291 0.56
292 0.46
293 0.36
294 0.27
295 0.16
296 0.11
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.13
307 0.15
308 0.2
309 0.2
310 0.26
311 0.28
312 0.32
313 0.37
314 0.41
315 0.46
316 0.51
317 0.58
318 0.62
319 0.64
320 0.69
321 0.7
322 0.7
323 0.72
324 0.71
325 0.72
326 0.69
327 0.71
328 0.73
329 0.73
330 0.7
331 0.7
332 0.66
333 0.61
334 0.55
335 0.57
336 0.53
337 0.52
338 0.56
339 0.57
340 0.61
341 0.62
342 0.66
343 0.63
344 0.59
345 0.58
346 0.57
347 0.57
348 0.57
349 0.61
350 0.61
351 0.67
352 0.75
353 0.81
354 0.82
355 0.81
356 0.73
357 0.7
358 0.7
359 0.72
360 0.7
361 0.68
362 0.62
363 0.57
364 0.6
365 0.54
366 0.49
367 0.41
368 0.38
369 0.34
370 0.35
371 0.36
372 0.35
373 0.38
374 0.38
375 0.4
376 0.39