Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GTI4

Protein Details
Accession C5GTI4    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23APIALKKRTTTRAKIARKPTTSHydrophilic
32-79SDTSTLRTNKKDKRQIKHSIFLSKIEKPRTKTLKRRRPSKKLVANLDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-72KKDKRQIKHSIFLSKIEKPRTKTLKRRRPSKK
117-134LKHKPGAMKRKETLDRRE
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAPIALKKRTTTRAKIARKPTTSSTPSQGPFSDTSTLRTNKKDKRQIKHSIFLSKIEKPRTKTLKRRRPSKKLVANLDSLVDALPDTGNDNNTPNDTIDKQREMMASQMNIIRQRSLKHKPGAMKRKETLDRRERERFAKNLAQMAAASPSTAGGPGSLNNNNTPVHMAQSPSQPQVEDASTSNRWAALRSFISQTIDQNPEFNKAADRPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.8
3 0.83
4 0.83
5 0.79
6 0.76
7 0.72
8 0.71
9 0.66
10 0.61
11 0.56
12 0.54
13 0.51
14 0.48
15 0.42
16 0.37
17 0.34
18 0.33
19 0.32
20 0.26
21 0.28
22 0.32
23 0.36
24 0.37
25 0.42
26 0.48
27 0.52
28 0.62
29 0.69
30 0.71
31 0.76
32 0.81
33 0.85
34 0.82
35 0.82
36 0.76
37 0.74
38 0.66
39 0.62
40 0.58
41 0.54
42 0.53
43 0.53
44 0.53
45 0.5
46 0.58
47 0.63
48 0.68
49 0.71
50 0.76
51 0.78
52 0.81
53 0.87
54 0.88
55 0.88
56 0.88
57 0.88
58 0.86
59 0.84
60 0.83
61 0.76
62 0.67
63 0.57
64 0.48
65 0.37
66 0.28
67 0.19
68 0.11
69 0.07
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.1
82 0.12
83 0.13
84 0.16
85 0.18
86 0.19
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.17
91 0.18
92 0.15
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.17
102 0.23
103 0.29
104 0.34
105 0.36
106 0.4
107 0.45
108 0.54
109 0.62
110 0.61
111 0.61
112 0.56
113 0.6
114 0.64
115 0.63
116 0.63
117 0.62
118 0.62
119 0.62
120 0.68
121 0.64
122 0.62
123 0.61
124 0.54
125 0.51
126 0.51
127 0.45
128 0.42
129 0.38
130 0.33
131 0.27
132 0.25
133 0.2
134 0.14
135 0.12
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.04
142 0.05
143 0.06
144 0.11
145 0.14
146 0.16
147 0.16
148 0.19
149 0.19
150 0.19
151 0.21
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.18
156 0.18
157 0.26
158 0.29
159 0.28
160 0.29
161 0.25
162 0.25
163 0.27
164 0.25
165 0.19
166 0.17
167 0.21
168 0.21
169 0.22
170 0.22
171 0.2
172 0.19
173 0.19
174 0.19
175 0.2
176 0.22
177 0.24
178 0.27
179 0.27
180 0.31
181 0.31
182 0.32
183 0.32
184 0.34
185 0.31
186 0.32
187 0.32
188 0.33
189 0.33
190 0.3
191 0.28