Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G4N8S8

Protein Details
Accession G4N8S8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
401-423EQEQAHKRQQKMKKKNNRGGARGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-427KRQQKMKKKNNRGGARGGRGG
495-513RDRGRGRGRGRGGFRGGRG
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 10.5, nucl 5.5, mito 2, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005635  C:nuclear envelope  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0065003  P:protein-containing complex assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
GO:0016074  P:sno(s)RNA metabolic process  
KEGG mgr:MGG_10116  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSGGFVIPGLGEAKPNETLPVASFASEAFPKTGSETEQLSATNQAGDDKPATEDAMNVDSSQPPEPTHAAGTSTSAALEVNEDSMDVDNSTQGAAAIQAPAVAHEFQSDQSHLATAAPVADKNTTQTTANPRAEEANDSIQDSAHVTDALDAALLAMSQPKPEDLGPTTEAIVQAQAPITTTEPVAQEGAAAEWEADSSPYESSSDSSSSDDSSDDDSESGAMGLEETVRMLMANGDDSDADSDAGGDGKNGGKGRQVRSKNEQPDWVPPKPEVTITEDMEILPLGSILRIVGNTVLIQSGDDGEERVLDIETAVCRADRSIIAAIADVIGSVLRPMYILRFATSEDVEKEGLTTDMPVFYSPQHAQVVLTRALRQQKGYDASNLHDEEIPMEDQEFSDDEQEQAHKRQQKMKKKNNRGGARGGRGGAQSREMGSGHHGPSSGAAASADVGLNYDDDDDGPYKPLSRPANFGMGAPSSSEGATGNDRGGERDNFRDRGRGRGRGRGGFRGGRGGNGGGYSNGYSKQQQDRYPNYDQQQQQAPQSQPAAPYQWMPPPPPMTFNAGSQHAQQGGAAMPFAFPPFPPPAHQFGGNPPPAPPMGQHAPPVAPPVGQPQANWQAMAALYANPAFQQALRQAQQQQPPQGQPGWGQGPGAPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.17
4 0.17
5 0.18
6 0.17
7 0.21
8 0.19
9 0.17
10 0.17
11 0.15
12 0.18
13 0.18
14 0.18
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.17
19 0.19
20 0.19
21 0.2
22 0.22
23 0.22
24 0.22
25 0.22
26 0.21
27 0.21
28 0.19
29 0.17
30 0.14
31 0.16
32 0.16
33 0.18
34 0.18
35 0.16
36 0.18
37 0.17
38 0.19
39 0.16
40 0.16
41 0.16
42 0.17
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.16
47 0.19
48 0.2
49 0.18
50 0.17
51 0.21
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.21
56 0.21
57 0.2
58 0.21
59 0.18
60 0.16
61 0.14
62 0.12
63 0.11
64 0.09
65 0.1
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.11
102 0.08
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.15
110 0.18
111 0.17
112 0.17
113 0.22
114 0.3
115 0.38
116 0.41
117 0.38
118 0.36
119 0.38
120 0.38
121 0.36
122 0.31
123 0.27
124 0.24
125 0.24
126 0.23
127 0.2
128 0.19
129 0.17
130 0.14
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.08
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.03
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.15
151 0.14
152 0.18
153 0.19
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.19
158 0.15
159 0.14
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.06
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.05
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.14
241 0.2
242 0.26
243 0.34
244 0.38
245 0.42
246 0.5
247 0.59
248 0.61
249 0.58
250 0.57
251 0.51
252 0.55
253 0.56
254 0.5
255 0.42
256 0.35
257 0.35
258 0.3
259 0.3
260 0.21
261 0.21
262 0.23
263 0.22
264 0.23
265 0.21
266 0.2
267 0.18
268 0.16
269 0.09
270 0.05
271 0.04
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.05
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.04
316 0.03
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.03
324 0.04
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.11
349 0.11
350 0.14
351 0.14
352 0.14
353 0.14
354 0.16
355 0.19
356 0.18
357 0.18
358 0.16
359 0.2
360 0.25
361 0.26
362 0.24
363 0.22
364 0.24
365 0.27
366 0.27
367 0.27
368 0.23
369 0.23
370 0.27
371 0.26
372 0.22
373 0.19
374 0.17
375 0.14
376 0.15
377 0.13
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.11
390 0.12
391 0.14
392 0.2
393 0.24
394 0.28
395 0.37
396 0.46
397 0.55
398 0.64
399 0.72
400 0.78
401 0.83
402 0.87
403 0.88
404 0.86
405 0.79
406 0.78
407 0.75
408 0.68
409 0.59
410 0.52
411 0.44
412 0.37
413 0.35
414 0.26
415 0.21
416 0.17
417 0.15
418 0.16
419 0.14
420 0.13
421 0.15
422 0.19
423 0.18
424 0.18
425 0.17
426 0.16
427 0.16
428 0.17
429 0.13
430 0.08
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.06
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.05
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.1
448 0.1
449 0.12
450 0.13
451 0.2
452 0.25
453 0.25
454 0.29
455 0.3
456 0.36
457 0.34
458 0.34
459 0.29
460 0.23
461 0.22
462 0.18
463 0.16
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.08
468 0.09
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.12
473 0.13
474 0.14
475 0.17
476 0.19
477 0.2
478 0.27
479 0.33
480 0.35
481 0.35
482 0.42
483 0.39
484 0.46
485 0.5
486 0.52
487 0.5
488 0.56
489 0.61
490 0.6
491 0.64
492 0.6
493 0.59
494 0.53
495 0.5
496 0.49
497 0.43
498 0.37
499 0.34
500 0.28
501 0.22
502 0.19
503 0.18
504 0.1
505 0.11
506 0.11
507 0.11
508 0.12
509 0.13
510 0.15
511 0.21
512 0.29
513 0.35
514 0.4
515 0.48
516 0.55
517 0.6
518 0.65
519 0.65
520 0.6
521 0.63
522 0.59
523 0.55
524 0.56
525 0.51
526 0.49
527 0.5
528 0.48
529 0.43
530 0.44
531 0.4
532 0.34
533 0.33
534 0.32
535 0.25
536 0.26
537 0.25
538 0.28
539 0.3
540 0.3
541 0.33
542 0.35
543 0.35
544 0.36
545 0.36
546 0.36
547 0.35
548 0.36
549 0.34
550 0.33
551 0.33
552 0.31
553 0.33
554 0.27
555 0.25
556 0.21
557 0.18
558 0.16
559 0.15
560 0.13
561 0.09
562 0.08
563 0.09
564 0.1
565 0.09
566 0.07
567 0.12
568 0.16
569 0.18
570 0.22
571 0.27
572 0.32
573 0.35
574 0.37
575 0.34
576 0.38
577 0.46
578 0.44
579 0.4
580 0.35
581 0.35
582 0.33
583 0.32
584 0.25
585 0.23
586 0.26
587 0.28
588 0.3
589 0.29
590 0.3
591 0.3
592 0.34
593 0.26
594 0.21
595 0.2
596 0.24
597 0.27
598 0.27
599 0.26
600 0.3
601 0.39
602 0.39
603 0.38
604 0.31
605 0.27
606 0.26
607 0.27
608 0.19
609 0.11
610 0.11
611 0.12
612 0.12
613 0.1
614 0.11
615 0.1
616 0.1
617 0.14
618 0.18
619 0.26
620 0.29
621 0.34
622 0.41
623 0.47
624 0.55
625 0.58
626 0.61
627 0.6
628 0.61
629 0.61
630 0.56
631 0.51
632 0.45
633 0.46
634 0.41
635 0.34
636 0.31