Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GQ59

Protein Details
Accession C5GQ59    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-113LRDERRQRSRSRDRDGRRRDRSRSRDRRDRSRSRSRSRSRERRDRDRDRDRAGRRBasic
160-181TTSTRPRRSRSPPRQRGARTDRHydrophilic
250-274NNIYGVRKEKKTQYRQYMNRQGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-145LRDERRQRSRSRDRDGRRRDRSRSRDRRDRSRSRSRSRSRERRDRDRDRDRAGRRDRDRSGSRDRYTRRGDHGKSARYRERGRDRSW
163-182TRPRRSRSPPRQRGARTDRR
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MTMVEPPAKRARRTDSSTMWEMNDSKSVAGDHDSNEVDGGISRRDAGSTRDDIKRSNALRDERRQRSRSRDRDGRRRDRSRSRDRRDRSRSRSRSRSRERRDRDRDRDRAGRRDRDRSGSRDRYTRRGDHGKSARYRERGRDRSWTRSLSPALSPTRNGTTSTRPRRSRSPPRQRGARTDRRDAVRESGRVNGTSESRRHGSTKPQTQPMPDSMAMDIDGADGDELDQLIRKTMGFSSFRTTQNTKVPGNNIYGVRKEKKTQYRQYMNRQGGFNRPLSPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.64
3 0.65
4 0.66
5 0.61
6 0.53
7 0.48
8 0.42
9 0.35
10 0.32
11 0.25
12 0.21
13 0.19
14 0.19
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.15
19 0.18
20 0.19
21 0.18
22 0.17
23 0.16
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.13
33 0.14
34 0.18
35 0.22
36 0.28
37 0.33
38 0.34
39 0.35
40 0.38
41 0.44
42 0.4
43 0.42
44 0.43
45 0.46
46 0.53
47 0.62
48 0.67
49 0.69
50 0.76
51 0.74
52 0.74
53 0.77
54 0.8
55 0.79
56 0.79
57 0.79
58 0.79
59 0.85
60 0.89
61 0.89
62 0.88
63 0.87
64 0.87
65 0.87
66 0.88
67 0.89
68 0.89
69 0.88
70 0.88
71 0.87
72 0.89
73 0.88
74 0.89
75 0.86
76 0.86
77 0.87
78 0.86
79 0.89
80 0.88
81 0.88
82 0.89
83 0.9
84 0.89
85 0.9
86 0.89
87 0.89
88 0.9
89 0.9
90 0.89
91 0.88
92 0.85
93 0.82
94 0.82
95 0.77
96 0.76
97 0.74
98 0.73
99 0.68
100 0.69
101 0.66
102 0.65
103 0.63
104 0.6
105 0.61
106 0.6
107 0.57
108 0.57
109 0.57
110 0.57
111 0.58
112 0.55
113 0.52
114 0.53
115 0.52
116 0.53
117 0.56
118 0.55
119 0.54
120 0.58
121 0.56
122 0.54
123 0.55
124 0.55
125 0.59
126 0.58
127 0.56
128 0.6
129 0.58
130 0.6
131 0.61
132 0.55
133 0.46
134 0.44
135 0.42
136 0.34
137 0.3
138 0.28
139 0.26
140 0.24
141 0.24
142 0.21
143 0.23
144 0.22
145 0.23
146 0.21
147 0.26
148 0.36
149 0.45
150 0.52
151 0.54
152 0.57
153 0.64
154 0.71
155 0.73
156 0.75
157 0.76
158 0.77
159 0.8
160 0.85
161 0.8
162 0.8
163 0.79
164 0.78
165 0.72
166 0.7
167 0.69
168 0.63
169 0.63
170 0.55
171 0.52
172 0.47
173 0.43
174 0.37
175 0.36
176 0.33
177 0.31
178 0.3
179 0.25
180 0.23
181 0.26
182 0.26
183 0.25
184 0.25
185 0.27
186 0.28
187 0.29
188 0.36
189 0.41
190 0.5
191 0.52
192 0.57
193 0.57
194 0.57
195 0.59
196 0.51
197 0.47
198 0.38
199 0.32
200 0.25
201 0.24
202 0.21
203 0.16
204 0.13
205 0.07
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.1
220 0.12
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.26
225 0.32
226 0.35
227 0.4
228 0.41
229 0.4
230 0.47
231 0.51
232 0.47
233 0.46
234 0.48
235 0.45
236 0.46
237 0.46
238 0.41
239 0.39
240 0.42
241 0.45
242 0.48
243 0.49
244 0.52
245 0.56
246 0.63
247 0.69
248 0.74
249 0.77
250 0.81
251 0.86
252 0.9
253 0.91
254 0.88
255 0.83
256 0.77
257 0.69
258 0.67
259 0.63
260 0.55
261 0.49