FuNGI

G4MW77

Protein Details

Accession

G4MW77

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-36	NGQPGQAPKRPYRKPRAVNPLVARGR	Hydrophilic
211-233	KPNEPPAQKKPQPQKKEKAFTSH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
20-25	RPYRKP
444-455	EGKRVRKALARR
488-539	AKEKEAKEKEAKEKEAKEAKEKEKLAVGASAKGSGTSPSKNKQGKSLKRPGS
551-557	SRKKAKK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	mgr:MGG_11130 -

Amino Acid Sequences

MSAPPPPNAPNGQPGQAPKRPYRKPRAVNPLVARGRNDPSKQMNRPASTVKPSATVIAKAGPSKDPVEALREQDFQKLKDFEARRKLNGGWTDPAPPNVVEYPLMVSKRALMEARFHVMRLSRAKAVQGDPVNGIDPTDPEQFSRPVTLHRRDPRQPAAARVVPEEEEVKPSPPPPEPTTDDKEAERLAQIKADKEAQRAADLAQIAPTIKPNEPPAQKKPQPQKKEKAFTSHRQTKKDYDPKTSELRYEEALPWHLEDADGKNVWVGQYVAALSQANVGLVISGEGFKMVPLEKYYKFTSKPHFKAFSIEQAESIMKQNIAIGPHKMTEEKKEQMKLEQEIAATRDFLRGGRATKVKKESNTYRSAPRSEKLDQDDIDMSGDEFQDDDENHTFEKERDEETKEAKERQRRNHLGANLFGDANEKQVEKEEAEEELMEQLRKEEGKRVRKALARREKHLMYQSDSDDKDNPYDSSSSSESEPDEEKEAKEKEAKEKEAKEKEAKEAKEKEKLAVGASAKGSGTSPSKNKQGKSLKRPGSPNLSESSENEASRKKAKKLATGSVQPSRSGTPVPGQRAKGPGGATSDGEATGGEMSDGGIKKNRLKLGATGSSSRGTPVGSRAGSPIPGSGSKPGSPIKADSPKPGVVTPDEIVAALAANPQGIAIGDLLKRYFSDRVGTGENQIHRKEFISLVVRHSQLDKVDKLLRMKPSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.49
3	0.49
4	0.53
5	0.54
6	0.61
7	0.68
8	0.74
9	0.78
10	0.8
11	0.84
12	0.88
13	0.9
14	0.87
15	0.86
16	0.82
17	0.81
18	0.78
19	0.72
20	0.64
21	0.58
22	0.58
23	0.57
24	0.53
25	0.51
26	0.54
27	0.61
28	0.64
29	0.69
30	0.71
31	0.65
32	0.67
33	0.66
34	0.63
35	0.6
36	0.57
37	0.48
38	0.42
39	0.4
40	0.4
41	0.36
42	0.31
43	0.25
44	0.26
45	0.27
46	0.26
47	0.28
48	0.25
49	0.26
50	0.26
51	0.26
52	0.25
53	0.24
54	0.27
55	0.28
56	0.3
57	0.31
58	0.33
59	0.33
60	0.37
61	0.4
62	0.36
63	0.4
64	0.38
65	0.35
66	0.4
67	0.45
68	0.46
69	0.53
70	0.57
71	0.52
72	0.55
73	0.55
74	0.53
75	0.54
76	0.5
77	0.43
78	0.4
79	0.43
80	0.41
81	0.41
82	0.35
83	0.28
84	0.27
85	0.24
86	0.24
87	0.17
88	0.16
89	0.18
90	0.2
91	0.21
92	0.18
93	0.17
94	0.19
95	0.2
96	0.22
97	0.21
98	0.18
99	0.23
100	0.26
101	0.32
102	0.29
103	0.27
104	0.27
105	0.27
106	0.32
107	0.33
108	0.33
109	0.31
110	0.32
111	0.35
112	0.37
113	0.36
114	0.37
115	0.34
116	0.32
117	0.29
118	0.29
119	0.27
120	0.22
121	0.21
122	0.14
123	0.12
124	0.14
125	0.17
126	0.17
127	0.17
128	0.2
129	0.21
130	0.22
131	0.24
132	0.2
133	0.25
134	0.33
135	0.38
136	0.45
137	0.52
138	0.6
139	0.63
140	0.71
141	0.69
142	0.7
143	0.66
144	0.62
145	0.61
146	0.56
147	0.51
148	0.44
149	0.39
150	0.3
151	0.29
152	0.26
153	0.18
154	0.2
155	0.19
156	0.19
157	0.18
158	0.19
159	0.22
160	0.24
161	0.29
162	0.27
163	0.33
164	0.36
165	0.42
166	0.47
167	0.47
168	0.45
169	0.4
170	0.39
171	0.33
172	0.29
173	0.25
174	0.2
175	0.16
176	0.18
177	0.19
178	0.18
179	0.2
180	0.27
181	0.27
182	0.27
183	0.3
184	0.27
185	0.26
186	0.25
187	0.23
188	0.19
189	0.17
190	0.15
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.13
196	0.13
197	0.13
198	0.16
199	0.2
200	0.28
201	0.34
202	0.41
203	0.45
204	0.53
205	0.58
206	0.64
207	0.71
208	0.73
209	0.77
210	0.79
211	0.83
212	0.82
213	0.86
214	0.8
215	0.79
216	0.77
217	0.76
218	0.77
219	0.76
220	0.72
221	0.68
222	0.69
223	0.66
224	0.69
225	0.69
226	0.63
227	0.61
228	0.6
229	0.59
230	0.62
231	0.56
232	0.48
233	0.42
234	0.39
235	0.31
236	0.29
237	0.27
238	0.21
239	0.22
240	0.19
241	0.17
242	0.16
243	0.14
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.13
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.12
253	0.11
254	0.09
255	0.05
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.07
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.03
276	0.05
277	0.05
278	0.06
279	0.08
280	0.13
281	0.14
282	0.18
283	0.21
284	0.24
285	0.27
286	0.31
287	0.39
288	0.45
289	0.49
290	0.52
291	0.53
292	0.49
293	0.52
294	0.48
295	0.47
296	0.41
297	0.36
298	0.28
299	0.26
300	0.25
301	0.21
302	0.21
303	0.13
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.1
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.12
312	0.13
313	0.13
314	0.15
315	0.15
316	0.18
317	0.23
318	0.26
319	0.29
320	0.32
321	0.32
322	0.34
323	0.37
324	0.33
325	0.29
326	0.26
327	0.22
328	0.19
329	0.2
330	0.16
331	0.12
332	0.11
333	0.1
334	0.08
335	0.08
336	0.1
337	0.11
338	0.12
339	0.16
340	0.22
341	0.23
342	0.28
343	0.35
344	0.36
345	0.37
346	0.43
347	0.47
348	0.47
349	0.52
350	0.49
351	0.49
352	0.48
353	0.5
354	0.45
355	0.39
356	0.38
357	0.34
358	0.36
359	0.33
360	0.34
361	0.3
362	0.29
363	0.28
364	0.23
365	0.21
366	0.16
367	0.12
368	0.08
369	0.08
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.09
376	0.09
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.1
382	0.14
383	0.12
384	0.14
385	0.17
386	0.21
387	0.23
388	0.26
389	0.32
390	0.3
391	0.35
392	0.39
393	0.44
394	0.48
395	0.55
396	0.63
397	0.62
398	0.64
399	0.64
400	0.63
401	0.57
402	0.51
403	0.45
404	0.34
405	0.29
406	0.24
407	0.19
408	0.14
409	0.13
410	0.12
411	0.1
412	0.09
413	0.11
414	0.12
415	0.11
416	0.12
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.09
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.11
429	0.11
430	0.17
431	0.26
432	0.35
433	0.4
434	0.44
435	0.48
436	0.53
437	0.59
438	0.62
439	0.64
440	0.59
441	0.58
442	0.61
443	0.57
444	0.57
445	0.56
446	0.49
447	0.42
448	0.41
449	0.39
450	0.38
451	0.37
452	0.34
453	0.3
454	0.27
455	0.25
456	0.23
457	0.21
458	0.16
459	0.16
460	0.15
461	0.16
462	0.17
463	0.16
464	0.15
465	0.16
466	0.15
467	0.16
468	0.18
469	0.15
470	0.17
471	0.17
472	0.17
473	0.22
474	0.23
475	0.23
476	0.27
477	0.29
478	0.35
479	0.41
480	0.47
481	0.48
482	0.54
483	0.61
484	0.63
485	0.66
486	0.64
487	0.59
488	0.63
489	0.63
490	0.58
491	0.57
492	0.59
493	0.58
494	0.59
495	0.57
496	0.49
497	0.45
498	0.44
499	0.36
500	0.32
501	0.28
502	0.23
503	0.22
504	0.22
505	0.17
506	0.17
507	0.16
508	0.14
509	0.16
510	0.18
511	0.23
512	0.27
513	0.37
514	0.42
515	0.42
516	0.5
517	0.58
518	0.62
519	0.67
520	0.73
521	0.72
522	0.73
523	0.77
524	0.74
525	0.73
526	0.65
527	0.57
528	0.5
529	0.46
530	0.4
531	0.37
532	0.38
533	0.33
534	0.3
535	0.3
536	0.3
537	0.29
538	0.37
539	0.42
540	0.38
541	0.41
542	0.46
543	0.53
544	0.57
545	0.62
546	0.61
547	0.63
548	0.64
549	0.64
550	0.6
551	0.52
552	0.47
553	0.4
554	0.33
555	0.27
556	0.22
557	0.23
558	0.28
559	0.35
560	0.39
561	0.4
562	0.42
563	0.45
564	0.45
565	0.41
566	0.35
567	0.3
568	0.29
569	0.28
570	0.25
571	0.22
572	0.21
573	0.17
574	0.16
575	0.12
576	0.08
577	0.07
578	0.06
579	0.05
580	0.04
581	0.05
582	0.1
583	0.1
584	0.12
585	0.16
586	0.2
587	0.26
588	0.33
589	0.36
590	0.35
591	0.36
592	0.4
593	0.44
594	0.48
595	0.45
596	0.41
597	0.4
598	0.38
599	0.36
600	0.32
601	0.24
602	0.17
603	0.16
604	0.17
605	0.21
606	0.21
607	0.21
608	0.23
609	0.25
610	0.25
611	0.24
612	0.22
613	0.18
614	0.2
615	0.21
616	0.23
617	0.25
618	0.25
619	0.29
620	0.31
621	0.3
622	0.31
623	0.32
624	0.36
625	0.42
626	0.43
627	0.46
628	0.48
629	0.48
630	0.47
631	0.46
632	0.4
633	0.33
634	0.35
635	0.29
636	0.25
637	0.22
638	0.2
639	0.18
640	0.15
641	0.12
642	0.07
643	0.08
644	0.07
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.06
650	0.06
651	0.05
652	0.1
653	0.11
654	0.13
655	0.13
656	0.14
657	0.14
658	0.17
659	0.2
660	0.18
661	0.22
662	0.22
663	0.26
664	0.31
665	0.32
666	0.34
667	0.38
668	0.42
669	0.43
670	0.44
671	0.41
672	0.37
673	0.37
674	0.35
675	0.3
676	0.31
677	0.33
678	0.33
679	0.36
680	0.42
681	0.41
682	0.39
683	0.4
684	0.37
685	0.35
686	0.39
687	0.35
688	0.35
689	0.4
690	0.44
691	0.48
692	0.51

G4MW77

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer