Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G4NAY8

Protein Details
Accession G4NAY8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-177CPLGPRCSKKHVRRNLCPYYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-276RDGKFGGGGGGGRGGWRGRGGGHRGRGRY
Subcellular Location(s) mito 14, extr 5, nucl 4.5, cyto_nucl 4, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
KEGG mgr:MGG_00680  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MASPSVAKIADAMLAHSAPKYSFSFTPFLQQTYQHSLPSDRPICKVYASGGNCPNGTRCLERHVADPSQLSNAQSGYGSGKRDGPAFNSLVCKHWLRGLCKKGDGCEFLHEYNLRRMPECNFYIRNGYCQNGEECLYLHIDPQSKLPPCPHYDQGFCPLGPRCSKKHVRRNLCPYYLCGFCPDGRLCKQGAHPGWNPKLDPPTVKVEKPAGEEDAMGFAARGGAYDDHEDGDRGGQQRGDRRGGYGQRDGKFGGGGGGGRGGWRGRGGGHRGRGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.13
4 0.14
5 0.11
6 0.15
7 0.16
8 0.17
9 0.19
10 0.23
11 0.26
12 0.25
13 0.34
14 0.32
15 0.33
16 0.31
17 0.31
18 0.33
19 0.39
20 0.4
21 0.32
22 0.32
23 0.33
24 0.35
25 0.42
26 0.43
27 0.36
28 0.37
29 0.38
30 0.37
31 0.35
32 0.32
33 0.26
34 0.28
35 0.28
36 0.32
37 0.35
38 0.36
39 0.36
40 0.35
41 0.34
42 0.28
43 0.28
44 0.25
45 0.22
46 0.25
47 0.3
48 0.3
49 0.31
50 0.34
51 0.32
52 0.3
53 0.3
54 0.25
55 0.24
56 0.24
57 0.21
58 0.17
59 0.16
60 0.14
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.15
67 0.18
68 0.19
69 0.21
70 0.21
71 0.2
72 0.22
73 0.21
74 0.21
75 0.23
76 0.23
77 0.23
78 0.25
79 0.23
80 0.19
81 0.23
82 0.27
83 0.28
84 0.37
85 0.41
86 0.41
87 0.45
88 0.45
89 0.43
90 0.42
91 0.38
92 0.3
93 0.29
94 0.28
95 0.24
96 0.26
97 0.24
98 0.22
99 0.26
100 0.29
101 0.25
102 0.23
103 0.24
104 0.24
105 0.29
106 0.29
107 0.27
108 0.24
109 0.25
110 0.3
111 0.29
112 0.3
113 0.26
114 0.25
115 0.21
116 0.21
117 0.2
118 0.15
119 0.16
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.18
131 0.18
132 0.19
133 0.22
134 0.24
135 0.25
136 0.29
137 0.32
138 0.3
139 0.31
140 0.32
141 0.34
142 0.32
143 0.28
144 0.27
145 0.24
146 0.24
147 0.27
148 0.29
149 0.26
150 0.34
151 0.44
152 0.51
153 0.59
154 0.66
155 0.71
156 0.77
157 0.83
158 0.82
159 0.78
160 0.68
161 0.62
162 0.56
163 0.47
164 0.38
165 0.31
166 0.24
167 0.2
168 0.24
169 0.22
170 0.23
171 0.25
172 0.27
173 0.25
174 0.26
175 0.28
176 0.32
177 0.33
178 0.34
179 0.37
180 0.44
181 0.48
182 0.47
183 0.45
184 0.4
185 0.41
186 0.37
187 0.34
188 0.29
189 0.34
190 0.35
191 0.35
192 0.35
193 0.35
194 0.35
195 0.36
196 0.35
197 0.28
198 0.24
199 0.24
200 0.2
201 0.18
202 0.15
203 0.11
204 0.09
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.09
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.15
220 0.14
221 0.16
222 0.17
223 0.21
224 0.29
225 0.34
226 0.38
227 0.35
228 0.36
229 0.43
230 0.48
231 0.5
232 0.51
233 0.53
234 0.49
235 0.51
236 0.48
237 0.41
238 0.34
239 0.28
240 0.2
241 0.14
242 0.12
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.13
252 0.15
253 0.23
254 0.3
255 0.36
256 0.45