Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GMS1

Protein Details
Accession C5GMS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-212SWRNWQKGKSEKGEGKKKKKMKVLGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-210RRRRRLKAQMQEEGREKRKEEEEIEARKRKREDEKAWEESRDERIGSWRNWQKGKSEKGEGKKKKKMKV
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR036869  J_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50076  DNAJ_2  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MADDELEALDALEREASEFTKDAEIDRIRKAFQLDAYAVLDLQPGVPDSDIKMQYRKKSLLIHPDKSSNPAAPDAFDRLKKAQTTLLDEKARAHLDECIADARRLLIREHKYTLDSPELKTEEFKKEWRQKTIEVLVEEEARRRRRLKAQMQEEGREKRKEEEEIEARKRKREDEKAWEESRDERIGSWRNWQKGKSEKGEGKKKKKMKVLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.09
3 0.09
4 0.11
5 0.11
6 0.13
7 0.16
8 0.16
9 0.16
10 0.23
11 0.27
12 0.28
13 0.33
14 0.34
15 0.31
16 0.34
17 0.35
18 0.3
19 0.27
20 0.29
21 0.24
22 0.24
23 0.25
24 0.22
25 0.2
26 0.16
27 0.14
28 0.09
29 0.08
30 0.06
31 0.05
32 0.06
33 0.06
34 0.07
35 0.09
36 0.16
37 0.19
38 0.2
39 0.27
40 0.32
41 0.38
42 0.44
43 0.44
44 0.41
45 0.46
46 0.51
47 0.55
48 0.58
49 0.57
50 0.54
51 0.57
52 0.53
53 0.49
54 0.45
55 0.36
56 0.29
57 0.26
58 0.23
59 0.19
60 0.2
61 0.21
62 0.21
63 0.21
64 0.22
65 0.21
66 0.24
67 0.24
68 0.23
69 0.23
70 0.22
71 0.29
72 0.3
73 0.35
74 0.33
75 0.33
76 0.33
77 0.32
78 0.3
79 0.22
80 0.18
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.17
94 0.2
95 0.23
96 0.25
97 0.25
98 0.26
99 0.26
100 0.28
101 0.27
102 0.24
103 0.22
104 0.25
105 0.25
106 0.23
107 0.24
108 0.25
109 0.24
110 0.24
111 0.28
112 0.33
113 0.42
114 0.47
115 0.51
116 0.51
117 0.48
118 0.53
119 0.54
120 0.48
121 0.39
122 0.35
123 0.3
124 0.29
125 0.28
126 0.25
127 0.26
128 0.26
129 0.3
130 0.31
131 0.35
132 0.42
133 0.52
134 0.58
135 0.62
136 0.67
137 0.71
138 0.72
139 0.72
140 0.69
141 0.67
142 0.63
143 0.56
144 0.49
145 0.45
146 0.46
147 0.45
148 0.4
149 0.41
150 0.44
151 0.49
152 0.57
153 0.6
154 0.58
155 0.6
156 0.61
157 0.59
158 0.61
159 0.63
160 0.63
161 0.65
162 0.72
163 0.74
164 0.74
165 0.68
166 0.6
167 0.53
168 0.49
169 0.41
170 0.32
171 0.25
172 0.29
173 0.34
174 0.34
175 0.41
176 0.43
177 0.49
178 0.54
179 0.54
180 0.55
181 0.58
182 0.66
183 0.63
184 0.65
185 0.66
186 0.71
187 0.8
188 0.82
189 0.83
190 0.85
191 0.86
192 0.85