Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GFA7

Protein Details
Accession C5GFA7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
796-820IRIPVDEKNRWKKRTKEYGNEQLEDHydrophilic
876-898LERNLEQEQRRRRQQQDIKGKEEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00013  KH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50084  KH_TYPE_1  
PS51375  PPR  
CDD cd00105  KH-I  
Amino Acid Sequences MLPGARHGLRRLSFSQSPLDHATPSRNELFLPFLYPRESFSVLTQERYVRRSLFSLAVGNNRFNGSSSSNCCRHTSLNPHRTTRKYTAPPSASNVSDSTHASELGNHDNGGESKEMDTGASSVHDTCSTASDASSESSSEQSMDVFKEVEAIESNSSGIVRQVRAEKWWRKQLERELAGKPPLRQNRLYLEWTDIMNEIMALRRDTANIPAPSYAKTIYLSEPEVVALAGDERENVWDIRVLSGCRVHILPRERESRDSTRKVVLTGSPEAVRLAEEEIRSAIEMVHEADGSVQPDSLPLFVTAHDWKQEQGMDTPTIRSVWTHNVPLIAEGKRSRIPVRADAFRKPEKWTIKSFGDYLESLTNLAFSTSIHNLLYSDGQLNRDMIIDIIRELFTSPDMQQFLSTRAVNSVIFYCYRYPQYLPVLLSLFPNFEHLMTTRTFNALLTGCSKSHDLNRFRYLISLMKRCGVKPNGVEWVAFIDTILSTGVRQKVVARLRKERLLDNERILRRLVYRIIPDSFTSHLDSGQSVKDYIAVMDKRYGKNWICTDSITHMLGVTVRLHNTEAAREIMQFCKQSRLKLDVQGMNYCLAVHLNKKQYSETIAVYLDLISKYRRLRANNETIRILFSAAWQARHYNTCRVIWAYACFWGFTTSSMKHMVLFSLLRNTVPTMGDEARQDWLKKAGKAIAGINPIMSELDSRFDVLRNAPRTPAQEMLGSDSVMSLLTEYQPAGELRSRQRNLALWIIHGDFLAAWRYKPRVKFEEMMWEANMLDMAWWAEGHARNMSVTEIVRDVIRIPVDEKNRWKKRTKEYGNEQLEDEIREEQQQRQEEDKEEEEEELDQQPQEPEQGPEGRLEGRPEGRPEQVLEGILERELERNLEQEQRRRRQQQDIKGKEEETGEGVNKDATIVSNARSAQPELQLEHTGHKEGWMGGSVSIDEVKEMFERKGISWKGPGSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.49
3 0.42
4 0.45
5 0.45
6 0.43
7 0.37
8 0.36
9 0.4
10 0.35
11 0.4
12 0.37
13 0.32
14 0.3
15 0.3
16 0.32
17 0.25
18 0.26
19 0.23
20 0.22
21 0.25
22 0.24
23 0.26
24 0.27
25 0.29
26 0.25
27 0.26
28 0.34
29 0.33
30 0.36
31 0.36
32 0.38
33 0.39
34 0.4
35 0.42
36 0.34
37 0.35
38 0.35
39 0.35
40 0.31
41 0.29
42 0.33
43 0.32
44 0.38
45 0.38
46 0.36
47 0.34
48 0.32
49 0.3
50 0.26
51 0.26
52 0.22
53 0.26
54 0.31
55 0.38
56 0.42
57 0.44
58 0.46
59 0.45
60 0.46
61 0.48
62 0.52
63 0.56
64 0.61
65 0.65
66 0.71
67 0.75
68 0.76
69 0.76
70 0.71
71 0.7
72 0.69
73 0.7
74 0.72
75 0.69
76 0.67
77 0.65
78 0.63
79 0.54
80 0.47
81 0.41
82 0.32
83 0.28
84 0.26
85 0.23
86 0.19
87 0.19
88 0.17
89 0.19
90 0.21
91 0.24
92 0.24
93 0.2
94 0.19
95 0.21
96 0.21
97 0.2
98 0.18
99 0.13
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.11
104 0.11
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.13
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.14
135 0.13
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.13
147 0.13
148 0.16
149 0.22
150 0.23
151 0.3
152 0.4
153 0.46
154 0.51
155 0.6
156 0.62
157 0.62
158 0.7
159 0.73
160 0.74
161 0.7
162 0.66
163 0.6
164 0.59
165 0.61
166 0.56
167 0.49
168 0.48
169 0.51
170 0.52
171 0.51
172 0.5
173 0.51
174 0.53
175 0.52
176 0.44
177 0.4
178 0.36
179 0.34
180 0.3
181 0.23
182 0.18
183 0.14
184 0.13
185 0.08
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.15
193 0.19
194 0.24
195 0.24
196 0.25
197 0.25
198 0.26
199 0.26
200 0.27
201 0.23
202 0.16
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.19
207 0.19
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.14
212 0.11
213 0.09
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.11
225 0.11
226 0.14
227 0.16
228 0.15
229 0.16
230 0.19
231 0.18
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.22
236 0.28
237 0.32
238 0.36
239 0.43
240 0.44
241 0.47
242 0.52
243 0.55
244 0.58
245 0.56
246 0.53
247 0.52
248 0.5
249 0.47
250 0.42
251 0.35
252 0.3
253 0.28
254 0.27
255 0.22
256 0.21
257 0.21
258 0.18
259 0.15
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.08
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.11
290 0.12
291 0.14
292 0.16
293 0.15
294 0.15
295 0.17
296 0.18
297 0.16
298 0.16
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.19
303 0.17
304 0.16
305 0.15
306 0.13
307 0.13
308 0.18
309 0.2
310 0.21
311 0.21
312 0.21
313 0.21
314 0.22
315 0.24
316 0.17
317 0.17
318 0.17
319 0.2
320 0.21
321 0.24
322 0.24
323 0.26
324 0.29
325 0.34
326 0.38
327 0.43
328 0.43
329 0.47
330 0.51
331 0.5
332 0.49
333 0.45
334 0.48
335 0.47
336 0.48
337 0.48
338 0.47
339 0.45
340 0.45
341 0.41
342 0.34
343 0.3
344 0.25
345 0.22
346 0.17
347 0.14
348 0.12
349 0.11
350 0.1
351 0.07
352 0.07
353 0.05
354 0.04
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.09
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.08
373 0.08
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.08
383 0.08
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.13
389 0.15
390 0.17
391 0.16
392 0.13
393 0.13
394 0.15
395 0.13
396 0.13
397 0.12
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.15
406 0.17
407 0.2
408 0.22
409 0.21
410 0.21
411 0.2
412 0.19
413 0.19
414 0.15
415 0.12
416 0.09
417 0.11
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.1
423 0.1
424 0.12
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.1
429 0.11
430 0.1
431 0.1
432 0.11
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.14
437 0.13
438 0.19
439 0.27
440 0.28
441 0.32
442 0.36
443 0.36
444 0.35
445 0.35
446 0.3
447 0.27
448 0.27
449 0.26
450 0.23
451 0.25
452 0.26
453 0.26
454 0.31
455 0.28
456 0.27
457 0.25
458 0.27
459 0.28
460 0.27
461 0.27
462 0.19
463 0.19
464 0.15
465 0.13
466 0.1
467 0.06
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.03
472 0.03
473 0.07
474 0.09
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.17
479 0.24
480 0.3
481 0.32
482 0.39
483 0.42
484 0.46
485 0.47
486 0.44
487 0.45
488 0.45
489 0.43
490 0.39
491 0.43
492 0.4
493 0.39
494 0.36
495 0.28
496 0.23
497 0.23
498 0.21
499 0.17
500 0.18
501 0.2
502 0.21
503 0.21
504 0.2
505 0.2
506 0.18
507 0.17
508 0.17
509 0.14
510 0.13
511 0.12
512 0.12
513 0.11
514 0.11
515 0.1
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.13
522 0.12
523 0.13
524 0.18
525 0.23
526 0.22
527 0.23
528 0.29
529 0.25
530 0.31
531 0.33
532 0.31
533 0.28
534 0.27
535 0.28
536 0.24
537 0.25
538 0.19
539 0.16
540 0.12
541 0.11
542 0.11
543 0.11
544 0.1
545 0.08
546 0.08
547 0.09
548 0.1
549 0.11
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.12
555 0.12
556 0.13
557 0.13
558 0.16
559 0.17
560 0.16
561 0.24
562 0.25
563 0.28
564 0.3
565 0.34
566 0.33
567 0.37
568 0.43
569 0.38
570 0.38
571 0.37
572 0.34
573 0.29
574 0.26
575 0.2
576 0.13
577 0.1
578 0.09
579 0.11
580 0.16
581 0.23
582 0.25
583 0.26
584 0.27
585 0.27
586 0.3
587 0.29
588 0.24
589 0.19
590 0.16
591 0.15
592 0.15
593 0.14
594 0.11
595 0.09
596 0.09
597 0.08
598 0.12
599 0.14
600 0.2
601 0.25
602 0.27
603 0.34
604 0.42
605 0.52
606 0.54
607 0.56
608 0.52
609 0.47
610 0.44
611 0.37
612 0.3
613 0.19
614 0.13
615 0.18
616 0.17
617 0.18
618 0.18
619 0.19
620 0.2
621 0.26
622 0.28
623 0.27
624 0.29
625 0.28
626 0.3
627 0.3
628 0.29
629 0.25
630 0.24
631 0.18
632 0.18
633 0.17
634 0.15
635 0.14
636 0.15
637 0.13
638 0.13
639 0.17
640 0.14
641 0.16
642 0.19
643 0.19
644 0.18
645 0.18
646 0.17
647 0.14
648 0.14
649 0.13
650 0.15
651 0.16
652 0.14
653 0.15
654 0.15
655 0.15
656 0.14
657 0.14
658 0.13
659 0.14
660 0.16
661 0.16
662 0.16
663 0.18
664 0.2
665 0.2
666 0.17
667 0.24
668 0.27
669 0.27
670 0.29
671 0.3
672 0.29
673 0.31
674 0.32
675 0.29
676 0.27
677 0.26
678 0.22
679 0.18
680 0.17
681 0.15
682 0.12
683 0.08
684 0.06
685 0.08
686 0.08
687 0.1
688 0.1
689 0.11
690 0.12
691 0.16
692 0.24
693 0.25
694 0.26
695 0.27
696 0.3
697 0.33
698 0.34
699 0.32
700 0.26
701 0.25
702 0.24
703 0.28
704 0.25
705 0.22
706 0.18
707 0.15
708 0.14
709 0.11
710 0.1
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.08
718 0.08
719 0.11
720 0.13
721 0.18
722 0.25
723 0.36
724 0.37
725 0.37
726 0.4
727 0.41
728 0.42
729 0.43
730 0.36
731 0.27
732 0.29
733 0.28
734 0.25
735 0.21
736 0.17
737 0.1
738 0.1
739 0.14
740 0.12
741 0.12
742 0.15
743 0.21
744 0.26
745 0.32
746 0.39
747 0.4
748 0.45
749 0.48
750 0.46
751 0.53
752 0.51
753 0.47
754 0.39
755 0.34
756 0.28
757 0.24
758 0.22
759 0.1
760 0.07
761 0.05
762 0.05
763 0.05
764 0.05
765 0.05
766 0.1
767 0.12
768 0.14
769 0.15
770 0.15
771 0.15
772 0.16
773 0.17
774 0.14
775 0.13
776 0.12
777 0.11
778 0.12
779 0.12
780 0.11
781 0.11
782 0.12
783 0.13
784 0.12
785 0.14
786 0.21
787 0.27
788 0.34
789 0.43
790 0.51
791 0.6
792 0.66
793 0.72
794 0.75
795 0.8
796 0.84
797 0.84
798 0.84
799 0.84
800 0.88
801 0.86
802 0.78
803 0.67
804 0.59
805 0.51
806 0.41
807 0.33
808 0.24
809 0.18
810 0.21
811 0.23
812 0.25
813 0.3
814 0.34
815 0.37
816 0.4
817 0.43
818 0.42
819 0.45
820 0.43
821 0.39
822 0.34
823 0.31
824 0.26
825 0.23
826 0.21
827 0.18
828 0.16
829 0.13
830 0.14
831 0.14
832 0.14
833 0.17
834 0.16
835 0.16
836 0.2
837 0.24
838 0.23
839 0.24
840 0.25
841 0.25
842 0.25
843 0.27
844 0.28
845 0.28
846 0.32
847 0.37
848 0.38
849 0.39
850 0.38
851 0.37
852 0.36
853 0.33
854 0.29
855 0.24
856 0.22
857 0.2
858 0.18
859 0.17
860 0.13
861 0.13
862 0.12
863 0.14
864 0.13
865 0.14
866 0.17
867 0.26
868 0.31
869 0.39
870 0.49
871 0.56
872 0.66
873 0.73
874 0.76
875 0.79
876 0.82
877 0.84
878 0.84
879 0.83
880 0.79
881 0.74
882 0.69
883 0.6
884 0.52
885 0.43
886 0.35
887 0.3
888 0.26
889 0.22
890 0.22
891 0.19
892 0.17
893 0.16
894 0.13
895 0.1
896 0.13
897 0.14
898 0.15
899 0.19
900 0.2
901 0.23
902 0.25
903 0.27
904 0.26
905 0.31
906 0.33
907 0.3
908 0.33
909 0.34
910 0.32
911 0.35
912 0.34
913 0.31
914 0.27
915 0.26
916 0.24
917 0.21
918 0.22
919 0.19
920 0.17
921 0.15
922 0.16
923 0.15
924 0.14
925 0.14
926 0.13
927 0.1
928 0.09
929 0.11
930 0.13
931 0.15
932 0.15
933 0.17
934 0.19
935 0.21
936 0.3
937 0.32
938 0.33
939 0.38