FuNGI

A4R1T1

Protein Details

Accession

A4R1T1

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-55	LVSRYAKKPKPLRSGSNAAS	Hydrophilic
83-107	ETLPPPRAKTKAKPKQKDPPEVVDL	Hydrophilic
114-139	NIPEPQPERRKARKTANGVTKKKRGG	Basic
361-382	NQASPVKSKAPKKKPRTITDLA	Hydrophilic
415-441	QHCHPDSRLRKPERKRKPKGRGQVLLS	Basic
760-784	VEATTPVKRPRGRPKKNAKAEASPD	Hydrophilic
797-816	VAAAVKTPRRRKKAATQPAV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
89-97	RAKTKAKPK
121-138	ERRKARKTANGVTKKKRG
214-225	RKTSSAASRKKK
367-375	KSKAPKKKP
422-435	RLRKPERKRKPKGR
723-748	GPRGKTSTAAAAAKSPTKRPVGRPRK
767-778	KRPRGRPKKNAK
805-809	RRRKK

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR000637 HMGI/Y_DNA-bd_CS IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
KEGG	mgr:MGG_16183 -
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MTTPRFLPSSPPGQARSDLYTTLVSSSPDLPSINELVSRYAKKPKPLRSGSNAASIPTTATTTFTTAAKLLQSAQAEQADLVETLPPPRAKTKAKPKQKDPPEVVDLSPDLPVNIPEPQPERRKARKTANGVTKKKRGGGEESVADDATNEITTPTKNQPWKFFKSPSPRTTSDLEITGFQEVAATTAPVTTSTTDLTKGTASAQNKVTKSRVRKTSSAASRKKKAETVSRHFAVPDDVSTAPEPITVPDDAPEEQLFNLEPAVARRLDWTPPRETNTADLCPVSSNAKEVTSTLDGALSAAPAAVQNVFLTLQDKFAYPVEQVARRPDSPSKELGPPPEVIKKRKVIQLVGPSNDSKIPNQASPVKSKAPKKKPRTITDLATAAYTTEGKQSNAPAKKGTLTSYLEGQGEQVFQHCHPDSRLRKPERKRKPKGRGQVLLSPLSAIDQSARQDFVFGTSSQLAQEHSPTFLRDLHAALRQSNDFSDDPFASPIMAAPQGRKLWTAGARGEEGDLMNIEVIDLVDSPAFPDDPDAIVRAEMQKSPSRSEPKGIKNRRTPMVNLDSSEIDISEPHARDLESANSAEHTLKTQASKSTHFASTTPPRPTKITMVPACENTAEPPIVASDVDSDNEPPPSNQQAYQMPPPPRPVVPEETAIPRPNFEVMTDTQLSKQVSSYGFKSVKKRSAMIALLNQCWESKAGATGAAGQSSAFATTSRTSAPRGPRGKTSTAAAAAKSPTKRPVGRPRKNSVGASGDVTVVEATTPVKRPRGRPKKNAKAEASPDMMQNIAASMPPTVAAAVKTPRRRKKAATQPAVEILDSDGEAGLSPSPSLSPEPVFSSPEKDSVDVSIGEHTTMSLAVTPTAQQAELFTRITRAVKSAPRSTDPDKPSWHEKMLMYDPIVLEDLAAWLNSGQLDRVGYDGEVAPADVKMWCESKSICCLWRMSYRGRERKRL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.46
3	0.45
4	0.39
5	0.34
6	0.31
7	0.29
8	0.26
9	0.25
10	0.22
11	0.17
12	0.17
13	0.19
14	0.18
15	0.18
16	0.18
17	0.17
18	0.19
19	0.2
20	0.19
21	0.19
22	0.18
23	0.21
24	0.28
25	0.31
26	0.32
27	0.4
28	0.44
29	0.52
30	0.6
31	0.66
32	0.7
33	0.74
34	0.79
35	0.77
36	0.81
37	0.74
38	0.74
39	0.64
40	0.54
41	0.47
42	0.38
43	0.31
44	0.23
45	0.21
46	0.12
47	0.14
48	0.15
49	0.16
50	0.17
51	0.16
52	0.17
53	0.16
54	0.17
55	0.16
56	0.15
57	0.15
58	0.18
59	0.19
60	0.19
61	0.22
62	0.22
63	0.21
64	0.2
65	0.19
66	0.15
67	0.14
68	0.12
69	0.1
70	0.1
71	0.11
72	0.17
73	0.18
74	0.2
75	0.25
76	0.33
77	0.39
78	0.49
79	0.58
80	0.63
81	0.73
82	0.8
83	0.84
84	0.88
85	0.9
86	0.9
87	0.85
88	0.83
89	0.78
90	0.71
91	0.61
92	0.54
93	0.45
94	0.35
95	0.3
96	0.21
97	0.15
98	0.13
99	0.14
100	0.12
101	0.15
102	0.15
103	0.18
104	0.23
105	0.31
106	0.38
107	0.46
108	0.53
109	0.6
110	0.68
111	0.72
112	0.78
113	0.8
114	0.81
115	0.83
116	0.84
117	0.85
118	0.85
119	0.86
120	0.84
121	0.79
122	0.75
123	0.69
124	0.63
125	0.6
126	0.58
127	0.55
128	0.49
129	0.47
130	0.42
131	0.38
132	0.33
133	0.25
134	0.18
135	0.13
136	0.09
137	0.07
138	0.06
139	0.08
140	0.09
141	0.13
142	0.19
143	0.26
144	0.34
145	0.39
146	0.49
147	0.55
148	0.63
149	0.65
150	0.65
151	0.67
152	0.7
153	0.75
154	0.72
155	0.72
156	0.66
157	0.63
158	0.61
159	0.56
160	0.48
161	0.4
162	0.34
163	0.28
164	0.26
165	0.23
166	0.19
167	0.14
168	0.12
169	0.09
170	0.09
171	0.07
172	0.07
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.1
181	0.11
182	0.12
183	0.13
184	0.13
185	0.12
186	0.12
187	0.14
188	0.18
189	0.19
190	0.23
191	0.28
192	0.34
193	0.35
194	0.39
195	0.42
196	0.44
197	0.52
198	0.55
199	0.59
200	0.59
201	0.61
202	0.63
203	0.67
204	0.7
205	0.71
206	0.72
207	0.71
208	0.73
209	0.75
210	0.73
211	0.67
212	0.64
213	0.63
214	0.64
215	0.64
216	0.64
217	0.6
218	0.56
219	0.52
220	0.45
221	0.39
222	0.29
223	0.21
224	0.16
225	0.15
226	0.16
227	0.16
228	0.16
229	0.13
230	0.12
231	0.12
232	0.09
233	0.12
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.13
238	0.13
239	0.14
240	0.14
241	0.12
242	0.11
243	0.12
244	0.11
245	0.09
246	0.08
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.12
254	0.14
255	0.2
256	0.26
257	0.29
258	0.33
259	0.37
260	0.42
261	0.41
262	0.4
263	0.39
264	0.38
265	0.35
266	0.29
267	0.25
268	0.21
269	0.2
270	0.2
271	0.17
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.13
276	0.12
277	0.12
278	0.15
279	0.14
280	0.15
281	0.13
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.06
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.03
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.05
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.1
304	0.1
305	0.11
306	0.1
307	0.14
308	0.17
309	0.2
310	0.21
311	0.26
312	0.29
313	0.28
314	0.32
315	0.33
316	0.35
317	0.35
318	0.37
319	0.35
320	0.37
321	0.38
322	0.38
323	0.35
324	0.3
325	0.3
326	0.35
327	0.37
328	0.35
329	0.39
330	0.41
331	0.43
332	0.47
333	0.47
334	0.41
335	0.43
336	0.49
337	0.48
338	0.45
339	0.42
340	0.38
341	0.35
342	0.36
343	0.3
344	0.2
345	0.21
346	0.21
347	0.19
348	0.23
349	0.29
350	0.28
351	0.31
352	0.34
353	0.35
354	0.39
355	0.48
356	0.54
357	0.59
358	0.67
359	0.71
360	0.77
361	0.8
362	0.81
363	0.81
364	0.75
365	0.67
366	0.62
367	0.55
368	0.45
369	0.35
370	0.29
371	0.2
372	0.15
373	0.12
374	0.07
375	0.1
376	0.11
377	0.11
378	0.13
379	0.16
380	0.24
381	0.27
382	0.28
383	0.25
384	0.25
385	0.27
386	0.27
387	0.25
388	0.22
389	0.21
390	0.2
391	0.21
392	0.22
393	0.2
394	0.18
395	0.17
396	0.12
397	0.1
398	0.09
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.13
403	0.13
404	0.14
405	0.15
406	0.25
407	0.3
408	0.38
409	0.48
410	0.5
411	0.59
412	0.68
413	0.76
414	0.78
415	0.84
416	0.85
417	0.86
418	0.89
419	0.9
420	0.9
421	0.89
422	0.84
423	0.78
424	0.73
425	0.65
426	0.56
427	0.46
428	0.36
429	0.26
430	0.2
431	0.15
432	0.09
433	0.06
434	0.06
435	0.07
436	0.08
437	0.09
438	0.08
439	0.09
440	0.09
441	0.1
442	0.11
443	0.1
444	0.11
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.11
449	0.1
450	0.08
451	0.1
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.1
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.15
463	0.16
464	0.15
465	0.15
466	0.15
467	0.14
468	0.13
469	0.15
470	0.11
471	0.11
472	0.13
473	0.12
474	0.12
475	0.12
476	0.12
477	0.08
478	0.08
479	0.07
480	0.06
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.12
485	0.13
486	0.14
487	0.14
488	0.13
489	0.15
490	0.18
491	0.21
492	0.18
493	0.18
494	0.18
495	0.18
496	0.18
497	0.14
498	0.1
499	0.08
500	0.06
501	0.05
502	0.04
503	0.04
504	0.03
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.07
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.08
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.13
528	0.16
529	0.18
530	0.21
531	0.27
532	0.31
533	0.31
534	0.36
535	0.41
536	0.47
537	0.56
538	0.61
539	0.64
540	0.66
541	0.71
542	0.7
543	0.65
544	0.56
545	0.54
546	0.53
547	0.45
548	0.38
549	0.33
550	0.28
551	0.26
552	0.24
553	0.16
554	0.09
555	0.07
556	0.09
557	0.12
558	0.11
559	0.11
560	0.12
561	0.12
562	0.13
563	0.15
564	0.15
565	0.12
566	0.12
567	0.12
568	0.11
569	0.12
570	0.12
571	0.11
572	0.1
573	0.1
574	0.11
575	0.13
576	0.14
577	0.19
578	0.21
579	0.24
580	0.25
581	0.27
582	0.27
583	0.27
584	0.25
585	0.27
586	0.33
587	0.37
588	0.41
589	0.39
590	0.4
591	0.42
592	0.44
593	0.42
594	0.39
595	0.41
596	0.37
597	0.41
598	0.41
599	0.4
600	0.38
601	0.33
602	0.27
603	0.19
604	0.18
605	0.13
606	0.1
607	0.09
608	0.09
609	0.08
610	0.08
611	0.07
612	0.07
613	0.07
614	0.08
615	0.08
616	0.1
617	0.1
618	0.12
619	0.12
620	0.1
621	0.13
622	0.18
623	0.19
624	0.18
625	0.22
626	0.25
627	0.28
628	0.34
629	0.38
630	0.37
631	0.38
632	0.41
633	0.39
634	0.36
635	0.35
636	0.34
637	0.33
638	0.31
639	0.31
640	0.29
641	0.31
642	0.34
643	0.34
644	0.3
645	0.24
646	0.23
647	0.22
648	0.2
649	0.15
650	0.16
651	0.13
652	0.19
653	0.2
654	0.19
655	0.19
656	0.23
657	0.23
658	0.19
659	0.18
660	0.16
661	0.17
662	0.19
663	0.2
664	0.24
665	0.28
666	0.32
667	0.4
668	0.43
669	0.49
670	0.49
671	0.49
672	0.44
673	0.46
674	0.44
675	0.41
676	0.4
677	0.37
678	0.35
679	0.34
680	0.31
681	0.24
682	0.22
683	0.19
684	0.12
685	0.09
686	0.1
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.13
691	0.12
692	0.12
693	0.11
694	0.09
695	0.1
696	0.09
697	0.09
698	0.06
699	0.05
700	0.08
701	0.09
702	0.1
703	0.12
704	0.13
705	0.16
706	0.22
707	0.3
708	0.37
709	0.42
710	0.44
711	0.5
712	0.54
713	0.55
714	0.51
715	0.45
716	0.4
717	0.39
718	0.37
719	0.3
720	0.27
721	0.26
722	0.29
723	0.29
724	0.28
725	0.29
726	0.35
727	0.39
728	0.46
729	0.55
730	0.61
731	0.69
732	0.74
733	0.76
734	0.79
735	0.8
736	0.71
737	0.65
738	0.58
739	0.5
740	0.43
741	0.36
742	0.27
743	0.21
744	0.19
745	0.14
746	0.09
747	0.07
748	0.05
749	0.06
750	0.09
751	0.15
752	0.18
753	0.26
754	0.32
755	0.41
756	0.52
757	0.62
758	0.69
759	0.75
760	0.83
761	0.86
762	0.91
763	0.92
764	0.86
765	0.84
766	0.79
767	0.75
768	0.68
769	0.58
770	0.48
771	0.39
772	0.33
773	0.24
774	0.18
775	0.12
776	0.08
777	0.07
778	0.06
779	0.06
780	0.06
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.07
785	0.07
786	0.11
787	0.18
788	0.26
789	0.35
790	0.45
791	0.55
792	0.62
793	0.67
794	0.71
795	0.75
796	0.79
797	0.8
798	0.8
799	0.74
800	0.7
801	0.7
802	0.64
803	0.52
804	0.42
805	0.31
806	0.22
807	0.18
808	0.14
809	0.08
810	0.06
811	0.06
812	0.07
813	0.07
814	0.06
815	0.06
816	0.06
817	0.06
818	0.08
819	0.1
820	0.12
821	0.13
822	0.15
823	0.2
824	0.22
825	0.25
826	0.25
827	0.28
828	0.27
829	0.31
830	0.31
831	0.26
832	0.25
833	0.24
834	0.25
835	0.2
836	0.19
837	0.17
838	0.16
839	0.15
840	0.14
841	0.12
842	0.1
843	0.1
844	0.09
845	0.08
846	0.08
847	0.08
848	0.09
849	0.1
850	0.12
851	0.13
852	0.13
853	0.11
854	0.12
855	0.16
856	0.19
857	0.19
858	0.17
859	0.18
860	0.21
861	0.24
862	0.22
863	0.22
864	0.26
865	0.32
866	0.39
867	0.45
868	0.47
869	0.5
870	0.56
871	0.57
872	0.6
873	0.58
874	0.57
875	0.56
876	0.56
877	0.6
878	0.59
879	0.57
880	0.53
881	0.5
882	0.5
883	0.49
884	0.48
885	0.41
886	0.38
887	0.34
888	0.3
889	0.29
890	0.21
891	0.16
892	0.12
893	0.11
894	0.09
895	0.08
896	0.07
897	0.06
898	0.07
899	0.08
900	0.08
901	0.08
902	0.09
903	0.1
904	0.1
905	0.11
906	0.11
907	0.1
908	0.12
909	0.12
910	0.12
911	0.11
912	0.11
913	0.11
914	0.09
915	0.11
916	0.09
917	0.11
918	0.13
919	0.15
920	0.16
921	0.19
922	0.21
923	0.25
924	0.32
925	0.35
926	0.35
927	0.37
928	0.38
929	0.4
930	0.47
931	0.47
932	0.48
933	0.54
934	0.62
935	0.69

A4R1T1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer