FuNGI

G4N9S9

Protein Details

Accession

G4N9S9

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-37	IETDLPSSKADKKSKKNKEKKRPREDDEATEAR	Basic
54-82	DGQHVNGGEKKKHKKSRKSKQTETEDVEV	Basic
86-113	QVEEARAKKEKKQKKKKDKTTNGEDASE	Basic
116-138	VPESPVKSTKKSKKVKSEVEAAP	Hydrophilic
146-173	ATEEAAPEKKKKKRSRRKSDRAAEEDVE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-28	KADKKSKKNKEKKRPR
62-73	EKKKHKKSRKSK
91-104	RAKKEKKQKKKKDK
153-164	EKKKKKRSRRKS

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 12.833, cyto 9.5, mito_nucl 9.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	mgr:MGG_10674 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MPAIIETDLPSSKADKKSKKNKEKKRPREDDEATEARNNKRSKSEAPTADEAEDGQHVNGGEKKKHKKSRKSKQTETEDVEVEPEQVEEARAKKEKKQKKKKDKTTNGEDASEEVVPESPVKSTKKSKKVKSEVEAAPETIVDNAATEEAAPEKKKKKRSRRKSDRAAEEDVEEEYGAAKTKKSDSEALPPDSPASQGFALDLMDVDSPSVARSAKPDILQPAHAPSNPEFPFATQIVSLYVPLFPIGFDQPLTKVAEQHLKPLLNHYSPLMKGVLLDYRHVTLGELPTRADPRNPPTDRTPTLLSCKDEYAVGFGWLTAEVYLFVPRRGAWMEGVVNLQSEGHLGVVCWNRFNASIEANRVPEGWKFIDVVQKAEDAKKAKFRNAGKKINLEEAEGEGDEEAEAAEEAGEDDQEELEASLQQMHATGYWVDAAGKRIAGKIRFRIKNFDVGTAGDHGYISIEGTMLDDEAERELRVKEKEREKARMAKASTSGMLRRLTRSVPEFSMTSFGKEDEEEDSSKKVELYSGSRPMTPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.5
3	0.6
4	0.7
5	0.81
6	0.88
7	0.91
8	0.93
9	0.94
10	0.96
11	0.96
12	0.96
13	0.96
14	0.91
15	0.91
16	0.86
17	0.83
18	0.8
19	0.74
20	0.66
21	0.61
22	0.59
23	0.54
24	0.55
25	0.5
26	0.45
27	0.48
28	0.51
29	0.52
30	0.55
31	0.59
32	0.59
33	0.63
34	0.64
35	0.59
36	0.53
37	0.46
38	0.37
39	0.29
40	0.23
41	0.17
42	0.12
43	0.12
44	0.11
45	0.14
46	0.18
47	0.22
48	0.28
49	0.37
50	0.47
51	0.56
52	0.67
53	0.75
54	0.81
55	0.87
56	0.91
57	0.93
58	0.93
59	0.93
60	0.93
61	0.92
62	0.9
63	0.85
64	0.78
65	0.68
66	0.57
67	0.49
68	0.39
69	0.29
70	0.2
71	0.14
72	0.1
73	0.08
74	0.09
75	0.11
76	0.13
77	0.19
78	0.26
79	0.29
80	0.37
81	0.47
82	0.56
83	0.65
84	0.74
85	0.78
86	0.83
87	0.92
88	0.95
89	0.96
90	0.97
91	0.95
92	0.94
93	0.92
94	0.84
95	0.74
96	0.63
97	0.53
98	0.44
99	0.34
100	0.24
101	0.14
102	0.11
103	0.1
104	0.11
105	0.1
106	0.09
107	0.14
108	0.17
109	0.23
110	0.33
111	0.43
112	0.53
113	0.62
114	0.7
115	0.76
116	0.83
117	0.86
118	0.8
119	0.8
120	0.73
121	0.7
122	0.62
123	0.51
124	0.41
125	0.32
126	0.26
127	0.17
128	0.14
129	0.07
130	0.06
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.07
137	0.1
138	0.12
139	0.19
140	0.28
141	0.35
142	0.46
143	0.56
144	0.65
145	0.74
146	0.83
147	0.88
148	0.91
149	0.95
150	0.95
151	0.95
152	0.93
153	0.88
154	0.82
155	0.71
156	0.6
157	0.5
158	0.39
159	0.29
160	0.19
161	0.13
162	0.08
163	0.07
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.1
168	0.13
169	0.16
170	0.19
171	0.23
172	0.25
173	0.34
174	0.39
175	0.41
176	0.38
177	0.36
178	0.33
179	0.28
180	0.26
181	0.17
182	0.14
183	0.1
184	0.09
185	0.09
186	0.08
187	0.08
188	0.07
189	0.07
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.08
201	0.12
202	0.15
203	0.16
204	0.18
205	0.21
206	0.23
207	0.24
208	0.22
209	0.22
210	0.22
211	0.22
212	0.22
213	0.18
214	0.25
215	0.24
216	0.25
217	0.21
218	0.2
219	0.22
220	0.2
221	0.2
222	0.11
223	0.11
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.04
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.1
240	0.12
241	0.11
242	0.11
243	0.13
244	0.21
245	0.2
246	0.24
247	0.26
248	0.25
249	0.24
250	0.27
251	0.29
252	0.22
253	0.22
254	0.19
255	0.18
256	0.17
257	0.18
258	0.14
259	0.1
260	0.09
261	0.1
262	0.13
263	0.11
264	0.12
265	0.11
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.11
270	0.09
271	0.12
272	0.13
273	0.13
274	0.12
275	0.14
276	0.17
277	0.17
278	0.17
279	0.18
280	0.21
281	0.31
282	0.32
283	0.33
284	0.36
285	0.43
286	0.42
287	0.42
288	0.4
289	0.32
290	0.37
291	0.37
292	0.34
293	0.28
294	0.27
295	0.24
296	0.21
297	0.18
298	0.15
299	0.12
300	0.1
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.07
306	0.05
307	0.04
308	0.04
309	0.05
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.1
314	0.1
315	0.12
316	0.12
317	0.13
318	0.1
319	0.12
320	0.13
321	0.13
322	0.14
323	0.12
324	0.11
325	0.1
326	0.09
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.1
334	0.15
335	0.15
336	0.15
337	0.15
338	0.16
339	0.17
340	0.2
341	0.17
342	0.16
343	0.18
344	0.22
345	0.24
346	0.24
347	0.23
348	0.21
349	0.2
350	0.17
351	0.19
352	0.15
353	0.14
354	0.14
355	0.16
356	0.22
357	0.21
358	0.22
359	0.19
360	0.2
361	0.21
362	0.22
363	0.25
364	0.22
365	0.25
366	0.32
367	0.34
368	0.37
369	0.43
370	0.5
371	0.56
372	0.63
373	0.68
374	0.65
375	0.69
376	0.66
377	0.66
378	0.58
379	0.48
380	0.39
381	0.31
382	0.28
383	0.2
384	0.18
385	0.1
386	0.09
387	0.07
388	0.06
389	0.05
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.05
403	0.04
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.08
412	0.07
413	0.09
414	0.08
415	0.07
416	0.08
417	0.08
418	0.09
419	0.1
420	0.13
421	0.12
422	0.13
423	0.14
424	0.17
425	0.22
426	0.27
427	0.32
428	0.39
429	0.48
430	0.54
431	0.56
432	0.62
433	0.59
434	0.62
435	0.57
436	0.51
437	0.43
438	0.36
439	0.35
440	0.29
441	0.27
442	0.18
443	0.16
444	0.12
445	0.11
446	0.1
447	0.09
448	0.06
449	0.05
450	0.05
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.08
458	0.09
459	0.09
460	0.1
461	0.12
462	0.17
463	0.23
464	0.31
465	0.38
466	0.46
467	0.56
468	0.62
469	0.68
470	0.7
471	0.74
472	0.74
473	0.74
474	0.67
475	0.63
476	0.59
477	0.54
478	0.5
479	0.45
480	0.4
481	0.36
482	0.39
483	0.36
484	0.36
485	0.36
486	0.36
487	0.38
488	0.4
489	0.4
490	0.37
491	0.38
492	0.35
493	0.32
494	0.36
495	0.3
496	0.28
497	0.24
498	0.22
499	0.21
500	0.2
501	0.21
502	0.18
503	0.21
504	0.2
505	0.21
506	0.23
507	0.22
508	0.23
509	0.22
510	0.18
511	0.18
512	0.21
513	0.25
514	0.31
515	0.39
516	0.4

G4N9S9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer