FuNGI

A4RMV8

Protein Details

Accession

A4RMV8

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
42-70	YHDNVGPPPKGKKRKRKSRTQDHDQADDA	Basic
143-170	AAPAKVEKSSAKKKKKKDKGDKVDGAAQ	Hydrophilic
725-748	GKARITSKSAWERRKENNRKGAIE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
49-60	PPKGKKRKRKSR
144-162	APAKVEKSSAKKKKKKDKG
703-756	KKDKKELREKGVESRRSVAASKGKARITSKSAWERRKENNRKGAIEGSKRRKIA

Subcellular Location(s)

cyto 15, cyto_nucl 11.833, cyto_mito 10.333, nucl 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044764 DDX52/Rok1_DEADc IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA
KEGG	mgr:MGG_04523 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd17957 DEADc_DDX52 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MDILKVLSRGTKQAPKKPGVPAATLAQANIPSAGVETNPQLYHDNVGPPPKGKKRKRKSRTQDHDQADDAVDDDVELSDFDFFAPKTRRDSDGAGSKTKAADVKKAKKDADEADKARPIELDECKRILRSHRLKYTLLPVQKAAPAKVEKSSAKKKKKKDKGDKVDGAAQAAQGKSDKLPVFPQPLVSFSQLRSAYRISPRLADNLAKGSYKVPTEVQLGALPLLLQPGFALSHEGDGVDDDGKGGDGEALAMLQGASAGVDFLAIAPTGSGKTLSFLLPAINGVLKRRAEKGETGGDSSNDTKHALEAIVVAPTRELASQIANEGRKLAMGTGVRVVLMRKGMRVAAEEDSTEKKSEDQEEDVFESEDEDSLSEDDEEREKSEKPSKKPNKAPITKADILVTTPMLLLNFLSKGTSTTKKRLPRVRSLILDEADVLLDQLFREQTMGIWSACRNPNLRVSFWSATMASNIETHILDNLRAQADDAPAPPLIRLVVGLKDTAVPNISHRLVYTATESGKLLALRQLLHPASFSTTTSSTTTPEDETPLRPPFLVFVQTIERATALHEELKYDIPAAAGGASRVAVLHSSMPESARAAVIRRFRAADVWVLITTDVLARGVDFAGVNGVVNYDVPGSAAAYVHRAGRTGRAGRKGGIAVTFYTKEDIPFVKNVANVIALSERQAGAGESATQKWLLDALPDVSKKDKKELREKGVESRRSVAASKGKARITSKSAWERRKENNRKGAIEGSKRRKIAARDQGDGSDDGGEWGGIDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.64
3	0.68
4	0.7
5	0.71
6	0.66
7	0.6
8	0.54
9	0.49
10	0.49
11	0.43
12	0.35
13	0.28
14	0.25
15	0.22
16	0.19
17	0.15
18	0.09
19	0.1
20	0.1
21	0.08
22	0.1
23	0.11
24	0.15
25	0.16
26	0.18
27	0.19
28	0.2
29	0.23
30	0.24
31	0.27
32	0.27
33	0.33
34	0.33
35	0.36
36	0.45
37	0.52
38	0.6
39	0.65
40	0.72
41	0.77
42	0.86
43	0.91
44	0.93
45	0.94
46	0.94
47	0.95
48	0.94
49	0.93
50	0.88
51	0.82
52	0.73
53	0.63
54	0.53
55	0.42
56	0.32
57	0.22
58	0.15
59	0.1
60	0.09
61	0.07
62	0.06
63	0.06
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.06
68	0.08
69	0.08
70	0.16
71	0.22
72	0.24
73	0.31
74	0.35
75	0.38
76	0.4
77	0.44
78	0.44
79	0.48
80	0.49
81	0.47
82	0.44
83	0.42
84	0.39
85	0.37
86	0.34
87	0.27
88	0.33
89	0.39
90	0.49
91	0.55
92	0.62
93	0.61
94	0.6
95	0.64
96	0.62
97	0.61
98	0.6
99	0.54
100	0.54
101	0.57
102	0.53
103	0.48
104	0.4
105	0.33
106	0.3
107	0.36
108	0.37
109	0.36
110	0.38
111	0.39
112	0.41
113	0.41
114	0.42
115	0.44
116	0.47
117	0.53
118	0.59
119	0.63
120	0.62
121	0.63
122	0.64
123	0.61
124	0.55
125	0.47
126	0.4
127	0.38
128	0.41
129	0.39
130	0.32
131	0.31
132	0.29
133	0.29
134	0.31
135	0.34
136	0.35
137	0.42
138	0.52
139	0.56
140	0.64
141	0.7
142	0.78
143	0.83
144	0.88
145	0.91
146	0.91
147	0.92
148	0.92
149	0.94
150	0.9
151	0.83
152	0.79
153	0.69
154	0.59
155	0.48
156	0.38
157	0.3
158	0.24
159	0.2
160	0.14
161	0.14
162	0.13
163	0.19
164	0.19
165	0.17
166	0.21
167	0.26
168	0.31
169	0.3
170	0.34
171	0.28
172	0.29
173	0.3
174	0.3
175	0.26
176	0.21
177	0.28
178	0.26
179	0.25
180	0.26
181	0.25
182	0.28
183	0.33
184	0.37
185	0.31
186	0.33
187	0.34
188	0.34
189	0.35
190	0.31
191	0.26
192	0.26
193	0.26
194	0.22
195	0.22
196	0.19
197	0.2
198	0.18
199	0.18
200	0.15
201	0.16
202	0.19
203	0.19
204	0.19
205	0.17
206	0.16
207	0.14
208	0.13
209	0.1
210	0.07
211	0.08
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.06
218	0.08
219	0.07
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.03
235	0.04
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.02
242	0.02
243	0.02
244	0.02
245	0.02
246	0.02
247	0.02
248	0.02
249	0.02
250	0.02
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.08
270	0.08
271	0.09
272	0.14
273	0.15
274	0.17
275	0.2
276	0.22
277	0.23
278	0.25
279	0.27
280	0.29
281	0.29
282	0.29
283	0.26
284	0.24
285	0.24
286	0.23
287	0.19
288	0.13
289	0.13
290	0.11
291	0.1
292	0.11
293	0.08
294	0.07
295	0.08
296	0.07
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.07
305	0.05
306	0.07
307	0.07
308	0.09
309	0.12
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.11
314	0.11
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.1
320	0.1
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.11
325	0.08
326	0.11
327	0.11
328	0.1
329	0.11
330	0.12
331	0.12
332	0.13
333	0.14
334	0.12
335	0.12
336	0.12
337	0.13
338	0.15
339	0.16
340	0.15
341	0.13
342	0.12
343	0.14
344	0.17
345	0.17
346	0.18
347	0.18
348	0.19
349	0.19
350	0.19
351	0.17
352	0.13
353	0.12
354	0.09
355	0.08
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.1
368	0.11
369	0.14
370	0.23
371	0.29
372	0.32
373	0.43
374	0.52
375	0.6
376	0.67
377	0.73
378	0.74
379	0.74
380	0.74
381	0.69
382	0.68
383	0.6
384	0.53
385	0.44
386	0.33
387	0.27
388	0.23
389	0.17
390	0.08
391	0.06
392	0.06
393	0.05
394	0.05
395	0.04
396	0.04
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.11
403	0.18
404	0.21
405	0.27
406	0.34
407	0.41
408	0.49
409	0.56
410	0.58
411	0.61
412	0.65
413	0.65
414	0.61
415	0.58
416	0.54
417	0.46
418	0.39
419	0.29
420	0.21
421	0.16
422	0.12
423	0.08
424	0.04
425	0.04
426	0.03
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.07
434	0.09
435	0.08
436	0.09
437	0.1
438	0.15
439	0.18
440	0.2
441	0.2
442	0.21
443	0.28
444	0.3
445	0.31
446	0.27
447	0.32
448	0.3
449	0.29
450	0.28
451	0.21
452	0.19
453	0.18
454	0.16
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.08
460	0.07
461	0.09
462	0.09
463	0.08
464	0.09
465	0.11
466	0.1
467	0.1
468	0.11
469	0.1
470	0.11
471	0.12
472	0.12
473	0.11
474	0.11
475	0.11
476	0.11
477	0.09
478	0.08
479	0.07
480	0.07
481	0.06
482	0.08
483	0.08
484	0.09
485	0.08
486	0.1
487	0.11
488	0.11
489	0.11
490	0.09
491	0.1
492	0.16
493	0.16
494	0.14
495	0.14
496	0.16
497	0.15
498	0.16
499	0.16
500	0.14
501	0.14
502	0.15
503	0.15
504	0.13
505	0.15
506	0.14
507	0.12
508	0.12
509	0.13
510	0.13
511	0.14
512	0.19
513	0.18
514	0.18
515	0.17
516	0.15
517	0.17
518	0.17
519	0.16
520	0.13
521	0.14
522	0.16
523	0.17
524	0.17
525	0.16
526	0.17
527	0.18
528	0.17
529	0.17
530	0.18
531	0.18
532	0.2
533	0.24
534	0.25
535	0.24
536	0.22
537	0.21
538	0.19
539	0.19
540	0.2
541	0.15
542	0.14
543	0.17
544	0.19
545	0.19
546	0.17
547	0.15
548	0.12
549	0.13
550	0.13
551	0.11
552	0.13
553	0.13
554	0.14
555	0.15
556	0.17
557	0.16
558	0.14
559	0.13
560	0.09
561	0.09
562	0.08
563	0.08
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.07
574	0.08
575	0.09
576	0.1
577	0.11
578	0.11
579	0.12
580	0.12
581	0.12
582	0.12
583	0.13
584	0.18
585	0.24
586	0.26
587	0.27
588	0.28
589	0.27
590	0.28
591	0.27
592	0.26
593	0.21
594	0.2
595	0.18
596	0.17
597	0.16
598	0.14
599	0.12
600	0.09
601	0.07
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.06
606	0.06
607	0.07
608	0.06
609	0.05
610	0.06
611	0.07
612	0.07
613	0.06
614	0.06
615	0.05
616	0.05
617	0.06
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.07
625	0.07
626	0.09
627	0.1
628	0.13
629	0.13
630	0.14
631	0.14
632	0.19
633	0.27
634	0.33
635	0.38
636	0.43
637	0.45
638	0.45
639	0.48
640	0.44
641	0.38
642	0.32
643	0.27
644	0.21
645	0.24
646	0.24
647	0.21
648	0.21
649	0.19
650	0.18
651	0.2
652	0.21
653	0.19
654	0.2
655	0.21
656	0.22
657	0.22
658	0.22
659	0.2
660	0.18
661	0.15
662	0.15
663	0.15
664	0.12
665	0.13
666	0.15
667	0.13
668	0.12
669	0.13
670	0.12
671	0.1
672	0.11
673	0.12
674	0.13
675	0.14
676	0.15
677	0.15
678	0.14
679	0.13
680	0.14
681	0.11
682	0.1
683	0.11
684	0.13
685	0.19
686	0.2
687	0.23
688	0.29
689	0.34
690	0.35
691	0.43
692	0.45
693	0.48
694	0.58
695	0.66
696	0.69
697	0.73
698	0.74
699	0.75
700	0.8
701	0.77
702	0.7
703	0.64
704	0.57
705	0.5
706	0.48
707	0.45
708	0.43
709	0.44
710	0.49
711	0.51
712	0.51
713	0.55
714	0.57
715	0.56
716	0.54
717	0.53
718	0.55
719	0.59
720	0.65
721	0.68
722	0.73
723	0.73
724	0.78
725	0.82
726	0.84
727	0.83
728	0.84
729	0.83
730	0.78
731	0.75
732	0.74
733	0.72
734	0.71
735	0.72
736	0.71
737	0.71
738	0.69
739	0.68
740	0.65
741	0.63
742	0.64
743	0.64
744	0.61
745	0.58
746	0.6
747	0.58
748	0.54
749	0.47
750	0.37
751	0.28
752	0.21
753	0.16
754	0.14
755	0.11

A4RMV8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer