Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A4RJV3

Protein Details
Accession A4RJV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-154ELTDEGKKHRRRVSRGRKLLDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-150KKHRRRVSRGRK
287-296KSRKPRIVRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030014  C:CCR4-NOT complex  
GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005741  C:mitochondrial outer membrane  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0051020  F:GTPase binding  
GO:0006354  P:DNA-templated transcription elongation  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
GO:0000266  P:mitochondrial fission  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
GO:0006402  P:mRNA catabolic process  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG mgr:MGG_01711  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MASPEDENPFQDDPGQEDEDGSILSPRGLEAFSRKVTTTASHLMGPVVDPSSSGHYQSAMTEVQKHLRRPNLQRSMFSMARTTPSDLVRSKLSTREIQHRALAHVPDDMLANIPEDDNNSYSLFQGFQASFPELTDEGKKHRRRVSRGRKLLDEGPTTPENGTTGLQKLRKERASMSHELEMLGIRKNMASSEIREIDIKIANLHGMRRIILERLAALEQEETLLEHDLMEVEARVEDAQMLADEAESTAQQSSPRDTDDADAEDNDGFMSQSIYEKIPSAASTPSKSRKPRIVRRKSMAVLHEHFEPGTSIRELRAHQDCITAMDFDAPFGTLVSAAMDDSVKVWDLNAGRCIGSLEGHTASVRALQVEDNILATGSRDATVRLWDLSKAHYDPHGSHYNGGDDDDDAMAFENPDDQPVDPPAGSMADCPLFTLSSHMDEVTALHFKGDTLVSGSSDKTIRQWDLVKGRCVQTLDVMWAAAQASVSLGTGDGAWRQTARSQAEDADFVGAVQVFDAALACGTADGMVRLWDLRSGQVHRNLVGHTGPVTALQFDNMHLVTGSHDRSIRIWDLRTGSIFDAFAYDHPVTSMMFDARRIVSAAGEDVVKVYDKVESRQWDCGAGIKAAEEMKNPPAIVERVRIRDGYMVEGRRDGIVGIWTC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.23
4 0.22
5 0.22
6 0.19
7 0.18
8 0.15
9 0.11
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.12
17 0.16
18 0.23
19 0.26
20 0.29
21 0.29
22 0.29
23 0.3
24 0.31
25 0.31
26 0.3
27 0.29
28 0.27
29 0.27
30 0.26
31 0.24
32 0.22
33 0.18
34 0.13
35 0.11
36 0.1
37 0.12
38 0.18
39 0.19
40 0.2
41 0.18
42 0.18
43 0.19
44 0.19
45 0.21
46 0.17
47 0.17
48 0.2
49 0.23
50 0.31
51 0.36
52 0.41
53 0.45
54 0.51
55 0.59
56 0.64
57 0.72
58 0.74
59 0.72
60 0.69
61 0.68
62 0.67
63 0.6
64 0.52
65 0.44
66 0.35
67 0.35
68 0.35
69 0.32
70 0.29
71 0.29
72 0.33
73 0.31
74 0.32
75 0.32
76 0.33
77 0.32
78 0.34
79 0.36
80 0.37
81 0.41
82 0.49
83 0.5
84 0.5
85 0.52
86 0.48
87 0.47
88 0.45
89 0.41
90 0.32
91 0.28
92 0.24
93 0.2
94 0.19
95 0.15
96 0.12
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.11
112 0.15
113 0.13
114 0.13
115 0.16
116 0.17
117 0.16
118 0.16
119 0.18
120 0.14
121 0.16
122 0.19
123 0.19
124 0.25
125 0.34
126 0.41
127 0.46
128 0.54
129 0.61
130 0.67
131 0.76
132 0.79
133 0.81
134 0.85
135 0.82
136 0.79
137 0.74
138 0.71
139 0.66
140 0.59
141 0.49
142 0.44
143 0.39
144 0.36
145 0.31
146 0.25
147 0.19
148 0.16
149 0.15
150 0.12
151 0.15
152 0.2
153 0.23
154 0.27
155 0.32
156 0.39
157 0.42
158 0.43
159 0.43
160 0.46
161 0.5
162 0.52
163 0.5
164 0.44
165 0.41
166 0.38
167 0.34
168 0.27
169 0.21
170 0.18
171 0.14
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.21
180 0.22
181 0.23
182 0.23
183 0.23
184 0.23
185 0.23
186 0.2
187 0.14
188 0.12
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.15
196 0.16
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.11
201 0.13
202 0.13
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.08
240 0.11
241 0.12
242 0.13
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.08
254 0.07
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.11
269 0.13
270 0.15
271 0.2
272 0.25
273 0.32
274 0.37
275 0.41
276 0.47
277 0.55
278 0.64
279 0.7
280 0.75
281 0.76
282 0.77
283 0.79
284 0.73
285 0.67
286 0.6
287 0.55
288 0.46
289 0.38
290 0.33
291 0.26
292 0.23
293 0.18
294 0.15
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.12
301 0.12
302 0.17
303 0.2
304 0.2
305 0.19
306 0.21
307 0.2
308 0.19
309 0.19
310 0.14
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.07
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.07
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.12
376 0.15
377 0.14
378 0.14
379 0.15
380 0.16
381 0.17
382 0.22
383 0.27
384 0.24
385 0.25
386 0.25
387 0.24
388 0.22
389 0.21
390 0.16
391 0.1
392 0.1
393 0.08
394 0.07
395 0.05
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.12
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.1
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.11
429 0.1
430 0.11
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.1
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.13
447 0.17
448 0.17
449 0.19
450 0.23
451 0.27
452 0.36
453 0.4
454 0.41
455 0.41
456 0.41
457 0.41
458 0.39
459 0.32
460 0.26
461 0.23
462 0.21
463 0.17
464 0.15
465 0.12
466 0.11
467 0.11
468 0.08
469 0.06
470 0.04
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.05
479 0.06
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.11
485 0.17
486 0.2
487 0.21
488 0.22
489 0.24
490 0.25
491 0.25
492 0.23
493 0.18
494 0.15
495 0.12
496 0.11
497 0.08
498 0.07
499 0.06
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.05
515 0.06
516 0.06
517 0.07
518 0.09
519 0.09
520 0.12
521 0.17
522 0.21
523 0.27
524 0.34
525 0.36
526 0.35
527 0.37
528 0.34
529 0.32
530 0.28
531 0.23
532 0.16
533 0.15
534 0.13
535 0.12
536 0.12
537 0.11
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.14
543 0.13
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.12
548 0.17
549 0.18
550 0.17
551 0.19
552 0.19
553 0.2
554 0.26
555 0.28
556 0.28
557 0.28
558 0.3
559 0.32
560 0.34
561 0.34
562 0.31
563 0.27
564 0.25
565 0.23
566 0.18
567 0.15
568 0.14
569 0.13
570 0.16
571 0.15
572 0.13
573 0.13
574 0.14
575 0.13
576 0.13
577 0.15
578 0.12
579 0.13
580 0.14
581 0.17
582 0.17
583 0.18
584 0.19
585 0.17
586 0.14
587 0.14
588 0.15
589 0.12
590 0.12
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.09
596 0.09
597 0.13
598 0.15
599 0.18
600 0.25
601 0.32
602 0.35
603 0.42
604 0.42
605 0.39
606 0.38
607 0.41
608 0.36
609 0.29
610 0.26
611 0.19
612 0.21
613 0.22
614 0.23
615 0.18
616 0.19
617 0.22
618 0.25
619 0.24
620 0.22
621 0.24
622 0.27
623 0.28
624 0.33
625 0.37
626 0.39
627 0.42
628 0.42
629 0.38
630 0.4
631 0.38
632 0.37
633 0.37
634 0.36
635 0.35
636 0.36
637 0.35
638 0.3
639 0.29
640 0.22
641 0.16